探索性数据分析(EDA)简介及Python代码示例

发布时间 2023-10-13 17:35:29作者: 生物信息刘博

当进行探索性数据分析(EDA)时,您可以使用各种统计和可视化工具来深入了解数据,并识别其中的模式和趋势。以下是一些常用的EDA技术和方法:

1. 描述性统计:计算每列数据的基本统计指标,例如均值、中位数、标准差等。这可以帮助您了解数据的集中趋势和离散程度。

2. 直方图:绘制每列数据的直方图,以展示每个值的出现频率。这有助于了解数据的分布情况,并检测是否存在异常值或偏斜。

3. 箱线图:绘制每列数据的箱线图,以展示数据的分布范围、中位数和异常值。这可以帮助您识别数据中的离群值。

4. 散点图:绘制两列数据之间的散点图,以探索它们之间的关系。这有助于发现变量之间的相关性和趋势。

5. 热力图:通过绘制矩阵形式的颜色编码,展示变量之间的相关性。热力图可以帮助您识别数据中的模式和相关性。

6. 折线图:对于时间序列数据,使用折线图来显示随时间变化的数据趋势。这可以帮助您发现季节性、趋势和周期性模式。

7. 相关性分析:计算每对变量之间的相关系数,并绘制相关矩阵。这有助于了解变量之间的关系强度和方向。

8. 缺失值分析:检查每列数据中的缺失值情况,并确定处理缺失值的策略。这可以避免在后续分析中产生偏差。

以上只是一些常见的EDA技术和方法,具体的分析取决于您的数据和研究目标。通过使用这些技术,您可以更好地了解数据,并为进一步的分析和建模做好准备。

 

 

首先,我们可以使用Python的pandas库来加载数据集并获取基本的统计信息。以下是示例代码:

```python
import pandas as pd

# 加载数据集
data = pd.read_csv('final_output_data.csv')

# 获取数据集的基本统计信息
data.describe()
```

接下来,我们可以使用数据可视化工具来更好地理解数据。以下是一些常用的数据可视化方法:

1. 直方图:用于显示数值变量的分布情况。可以使用Python的matplotlib库绘制直方图,例如:

```python
import matplotlib.pyplot as plt

# 绘制直方图
plt.hist(data['filteredReads'], bins=10)
plt.xlabel('filteredReads')
plt.ylabel('Frequency')
plt.title('Histogram of filteredReads')
plt.show()
```

2. 散点图:用于显示两个数值变量之间的关系。可以使用Python的matplotlib库绘制散点图,例如:

```python
import matplotlib.pyplot as plt

# 绘制散点图
plt.scatter(data['filteredReads'], data['mappedReads'])
plt.xlabel('filteredReads')
plt.ylabel('mappedReads')
plt.title('Scatter plot of filteredReads vs mappedReads')
plt.show()
```

3. 箱线图:用于显示数值变量的分布情况和离群值。可以使用Python的matplotlib库绘制箱线图,例如:

```python
import matplotlib.pyplot as plt

# 绘制箱线图
plt.boxplot(data['filteredReads'])
plt.xlabel('filteredReads')
plt.title('Boxplot of filteredReads')
plt.show()
```

以上只是一些常见的数据可视化方法的示例,您可以根据您的数据和分析目标选择适合的可视化方法。

此外,您还可以使用其他统计工具和方法来深入分析数据,例如相关性分析、特征选择和异常值检测等。

请告诉我您希望进一步探索的方面,以便我可以为您提供更具体的帮助。