Co-occurrence Network:相关系数矩阵的阈值

发布时间 2023-08-04 19:50:46作者: 王哲MGG_AI

"abs(occor.r) < 0.7" 这部分代码是对相关系数矩阵进行阈值处理的一部分。这里的 "0.7" 是一个阈值,用来筛选相关性较强的微生物对。具体来说,对于相关系数矩阵中的每个元素,如果其绝对值小于0.7,则将其设置为0。

相关系数范围在-1到1之间,绝对值越接近1表示相关性越强,绝对值越接近0表示相关性越弱。在这里,设定阈值为0.7意味着只保留相关性绝对值大于等于0.7的微生物对,而小于0.7的相关性则被视为不显著,将其设为0,以简化网络结构和减少边的数量。

这样做的目的是为了在绘制共现网络图时,只关注相关性较强的微生物对,避免过多的边导致网络图的复杂性。通过设定适当的阈值,可以更好地凸显网络中的关键微生物群体和相互作用关系。