13家应用数学中心包括：
上海国家应用数学中心（复旦大学建设）、
江苏国家应用数学中心（南京大学、东南大学建设）、
广东国家应用数学中心（中山大学、华南师范大学、华南理工大学、哈尔滨工业大学南方国际数学中心建设）、
山东国家应用数学中心（山东大学建设）、
天津国家应用数学中心（天津大学建设）、
湖南国家应用数学中心（湘潭大学建设）、
湖北国家应用数学中心（武汉大学、中科院武汉物理与数学研究所、华中科技大学、华中师范大学、武汉理工大学、湖北大学）、
吉林国家应用数学中心（吉林大学、东北师范大学）、
陕西国家应用数学中心（西安交通大学、西北工业大学）、
四川国家应用数学中心（四川大学）、
重庆国家应用数学中心（重庆师范大学、中国科学院大学、重庆大学、陆军军医大学、中国科学院绿色智能技术研究院）
深圳国家应用数学中心（南方科技大学、深圳大学、中国科学院深圳先进技术研究院、中国电子科技集团）等