当一家公司为组织的不同部分实施不同的 ERP 系统时，行业将这种策略称为二层 ERP 策略。这种策略是由对大型复杂组织的需求与小型简单组织的需求非常不同的认识驱动的。通常作为子公司的较小组织，如果运行符合其需求的 ERP 解决方案，而不被其较大的姐妹组织所需的过度复杂的解决方案所困扰，可以更有效。随着公司希望强化其工业 4.0 策略，他们希望拥有更有效的子公司，同时仍然在整个组织中保持高度的合作和协调。下面展示的各种二层部署选项可以支持客户走向工业 4.0。
二层 ERP 策略就是一种在同一企业内部，对不同层级或者不同业务模块采用不同的 ERP 系统的策略。这种策略基于一个认识，那就是大型复杂组织和小型简单组织的需求有着很大的差异。大型组织由于其业务复杂、部门众多，对于 ERP 系统的需求更倾向于全面性和集成性，而小型组织则更注重 ERP 系统的灵活性和针对性。
通常情况下，企业的总部或者主要部门会采用一种全面性强、集成性好、对业务流程支持全面的 ERP 系统，这种系统通常被视为一层 ERP 系统。而对于子公司或者一些相对独立的业务部门，由于其业务需求相对简单，故可能会选择一种更为灵活、简单的 ERP 系统，这种系统则被视为二层 ERP 系统。
二层 ERP 策略的主要优势在于，它可以更好地满足企业不同部门或者子公司的业务需求，使得各部门或者子公司都能找到最适合自己的 ERP 系统，提高了整体的业务效率。同时，二层 ERP 策略还能保证整个组织的协同性和一致性，因为这两种 ERP 系统都能通过数据接口进行联接，实现数据的互通和共享。
然而，二层 ERP 策略也存在一些挑战。首先，两种 ERP 系统的部署和维护都需要投入人力和财力，这会增加企业的运营成本。其次，两种系统的数据接口可能会存在兼容性问题，如果处理不当，可能会影响到数据的准确性。