书籍信息
书名：Genomic prediction of complex traits: methods and protocols
出版：New York, NY : Humana Press, [2022]
作者：Nourollah Ahmadi, Jérôme Bartholomé
单位：法国农业国际合作研究发展中心（CIRAD）
概括
本书探讨了在人类医学以及动植物育种领域中进行复杂性状基因组预测的概念框架和相关实际问题。该书分为五个部分。第一部分回顾了旨在预测表型变异的分子遗传学方法。第二部分介绍了复杂性状基因组预测的原理，并审查影响其可靠性的因素。第三部分描述了基因组预测方法，包括考虑不同生物复杂性程度的机器学习方法，并审查相关的计算机软件包。第四部分报告了新兴趋势，如表型预测以及将“组学”数据和作物生长模型纳入基因组预测模型。第五部分专门讨论了人类健康以及动植物育种领域的案例研究中所学到的经验教训，以及基因组预测经济效益分析的方法。本书是Springer protocols的《分子生物学方法》系列的一部分，内容及其丰富详实，全书英文802页。
目录
Genetic Bases of Complex Traits: From Quantitative Trait Loci to Predictions
复杂性状的遗传基础：从数量性状位点到预测
Genomic Prediction of Complex Traits, Principles, Overview of Factors Affecting the Reliability of Genomic Prediction, and Algebra of the Reliability
复杂性状的基因组预测、原理、影响基因组预测可靠性的因素概述、可靠性的代数
Building a Calibration Set for Genomic Prediction, Characteristics to be Considered and Optimization Approaches
构建基因组预测校准集、需要考虑的特征和优化方法
Genotyping, the Usefulness of Imputation to Increase SNP Density, Imputation Methods and Tools
基因分型，插补对增加SNP密度的有用性，插补方法和工具
Overview of Genomic Prediction Methods and the Associated Assumptions on the Variance of Marker Effect, and on the Architecture of the Target Trait
基因组预测方法概述，以及标记效应方差的相关假设，以及目标性状的结构
Overview of Major Computer Packages for Genomic Prediction of Complex Traits
用于复杂性状基因组预测的主要计算机软件包概述
Genome-Enabled Prediction Methods Based on Machine Learning
基于机器学习的基因组预测方法
Genomic Prediction Methods Accounting for Non-Additive Genetic Effects
考虑非加性遗传效应的基因组预测方法
Genome and Environment Based Prediction Models and Methods of Complex Traits Incorporating Genotype × Environment Interaction
基于基因组和环境的结合基因型×环境相互作用的复杂性状预测模型方法
Accounting for Correlation between Traits in Genomic Prediction
在基因组预测中考虑性状之间的相关性
Incorporation of Trait-Specific Genetic Information into Genomic Prediction Models
将性状特异性遗传信息纳入基因组预测模型
Incorporating Omics Data in Genomic Prediction
将组学数据纳入基因组预测
Integration of Crop Growth Models and Genomic Prediction
作物生长模型与基因组预测的整合
Phenomic Selection: A New and Efficient Alternative to Genomic Selection
表型选择：基因组选择的新型有效替代方案
From Genotype to Phenotype: Polygenic Prediction of Complex Human Traits
从基因型到表型：复杂人类性状的多基因预测
Genomic Prediction of Complex Traits in Animal Breeding with Long Breeding History, The Dairy Cattle Case
育种历史悠久的动物育种复杂性状的基因组预测，奶牛案例
Genomic Selection in Aquaculture Species
水产养殖品种的基因组选择
Genomic Prediction of Complex Traits in Perennial Plants: A Case for Forest Trees
多年生植物复杂性状的基因组预测：以森林树木为例
Genomic Prediction of Complex Traits in Forage Plants Species: Perennial Grasses Case
牧草植物复杂性状的基因组预测：多年生草本
Genomic Prediction of Complex Traits in an Allogamous Annual Crop: The Case of Maize Single-Cross Hybrids
同种异体一年生作物复杂性状的基因组预测：以玉米单杂交杂交种为例
Genomic Prediction: Progress and Perspective for Rice Improvement
基因组预测：水稻改良的进展与展望
Analyzing the Economic Effectiveness of Genomic Selection Relative to Conventional Breeding Approaches.
分析基因组选择相对于传统育种方法的经济效益。
免费电子书获取方式
1.将此文转发朋友圈，不设置分组可见，保留3小时以上；
2.关注本公众号：生物信息与育种，后台回复：复杂性状预测。
