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linux/mac使用aspera高速下载

发布时间 2023-08-09 20:54:10作者: 凛海
  1. 安装aspera
  2. （可以跳过）配置.aspera/connect/etc/aspera.conf
  3. asperaweb_id_dsa.openssh文件在.aspera/connect/etc/中
  4. 最好能够从网站直接下载aspera下载的脚本，在ebi的网站上能够找到，而如果下载NCBI是不行的，只能根据NCBI提供的session编号，如PRJNA/GSE/SRR/SRA等等来在EBI上再找到链接然后下载。
ascp -i asperaweb_id_dsa.openssh -P33001 era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/srr/SRR826/003/SRR8260883 ./
  1. 应该是不需要管理员权限的，只需要安装以后，配置好所需的private key的路径应该就可以
    以下是在ebi.ac.uk中下载processed文件时直接提供的aspera脚本，下载下来直接运行就可以
ascp -P33001 -i "asperaweb_id_dsa.openssh" --host=fasp.ebi.ac.uk --user=bsaspera --mode=recv "nfs/E-MTAB-/946/E-MTAB-6946/Files/raw_counts.mtx" ./