001、问题
(base) [sy20223040796@admin1 RepeatModeler-2.0.2a]$ perl configure ## 配置 RepeatModeler，提示缺少 LWP：UserAgent模块 The following perl modules required by RepeatModeler are missing from your system. Please install these first: LWP::UserAgent
002、使用cpan、手动安装 LWP::UserAgent模块， 均不能解决该问题
003、系统中显示已经安装
(base) [sy20223040796@admin1 RepeatModeler-2.0.2a]$ rpm -qa | grep "libwww" perl-libwww-perl-6.05-2.el7.noarch ## 安装该模块在虚拟机中测试可以解决 LWP:UserAgent报错
004、突破口
(base) [sy20223040796@admin1 RepeatModeler-2.0.2a]$ which perl ## 折腾好久发现，系统调用的perl来自conda的安装（据此，推测可能不能调用系统（root)安装的模块）， 因此注释掉conda中的perl调用有望可以解决问题 ~/anaconda3/bin/perl
005、将conda 中 perl 注释掉
(base) [sy20223040796@admin1 RepeatModeler-2.0.2a]$ which perl ~/anaconda3/bin/perl (base) [sy20223040796@admin1 RepeatModeler-2.0.2a]$ mv ~/anaconda3/bin/perl ~/anaconda3/bin/perl_bak ## 注释掉conda中的perl
006、重启一个终端，检测perl的可执行程序
(base) [sy20223040796@admin1 ~]$ which perl ## 是系统的perl /usr/bin/perl
007、重新配置 RepeatModeler
(base) [sy20223040796@admin1 RepeatModeler-2.0.2a]$ perl configure ## 配置
没有缺少模块的提示， 证明了conda下的perl无法调用系统(root）安装的模块。