坐标 碱基 基因组 基因

面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究

面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要:随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
序列 组长 算法 基因 片段

计算画布内旋转元素的边界坐标

> **svg,dom类的图形编辑器,在画布内编辑元素完成后,为了得到只包含元素的部分,去掉画布的留白,或者进行编组时,往往需要计算元素在画布内的边界坐标,重新生成输出元素的坐标** ## 1、对于无旋转等几何变化的基本元素,计算元素的边界坐标是很容易的(以屏幕坐标为准) 如下图,只需遍历每个元素的 ......
画布 坐标 边界 元素

易基因:全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点|mBio

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 细菌编码许多转录因子(transcription factor,TF),这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶(RNAP)全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对TF功能的研究几乎集中 ......
基因 位点 基因组 因子 细菌

速递:惠州学院生科院副院长谢海伟一行莅临易基因科技参观交流

2023年05月26日上午,惠州学院生命科学学院副院长谢海伟教授、陈兆贵教授、陈勇智博士、龚浩博士及生科院本科毕业生陈佳良一行5人莅临深圳市易基因科技有限公司参观交流,并举行“惠州学院实践教学基地“挂牌仪式。易基因总经理王君文、副总经理丁振东等公司领导出席。 交流会现场 “惠州学院实践教学基地“挂牌 ......
惠州学院 基因 院长 一行 学院

使用hiblup计算基因频率和基因型频率

001、测试数据 (base) [root@PC1 test]# ls ## 测试数据, plink格式 outcome.map outcome.ped (base) [root@PC1 test]# cat outcome.map 1 snp1 0 55910 1 snp2 0 85204 1 s ......
基因 频率 hiblup

2023-05-27 量学基础 十八个涨停基因(转)

涨停基因(十四)——大阳双休(双阴洗盘) 涨停基因(十五)——双剑霸天地 涨停基因(十六)——梯四变异 涨停基因(十七)——现场直憋 涨停基因(十八)——咬住峰顶线 涨停基因(十五)——双剑霸天地 一、双剑霸天地的形态。 双剑霸天地的形态是指:首先出现一根带有长上影线的价柱,长上影线的长度大于价柱总 ......
基因 基础 2023 05 27

cartographer代码——世界坐标系点和像素坐标系点的转换

构建栅格地图,要弄清楚坐标之间的关系。本篇根据代码,画出了坐标转换的关系。 如下图: cartographer中的代码如下: // Returns the index of the cell containing the 'point' which may be outside // the map ......
坐标系 坐标 cartographer 像素 代码

易基因:MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在结直肠癌PD-1免疫治疗中的作用|Gut

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 结直肠癌(colorectal cancer ,CRC)是全球最常见的癌症之一,转移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫检查点阻断(Immune checkpoint blockade,ICB)对CRC患者表现出良好疗效,然而只有一 ......
直肠癌 直肠 基因 MeRIP-seq 作用

94关找不同找茬游戏图片及坐标EXCEL数据

找不同找茬类的游戏是最没有门槛的游戏,大人小孩都可以参与的眼力竞技,我就时常与我6岁的孩子比赛,却陪件了孩子,又收获了快乐。需要更多记录的找不同数据可以查看《780关高清找不同找茬图片ACCESS数据库》和《上千个看图找茬游戏数据包含图片》。 坐标字段与分号分隔,分别是X值、Y值、W宽度、高度,具体 ......
游戏图片 坐标 数据 图片 EXCEL

解决echarts柱状图x轴坐标文字显示不完全问题

1、项目中遇到柱状图,x轴文字过多,导致文字显示不完全,影响显示效果。2、可以给xAxis添加interval属性,以及formatter属性。方法一:使文字换行 xAxis: { type: 'category', axisLabel: { show: true, interval: 0,//使x ......
坐标 echarts 文字 问题

易基因:全基因组DNA甲基化分析揭示DNMT1在斑马鱼模型听觉系统发育中的作用 | 胚胎发育

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 听力障碍通常与内耳发育不全或损伤有关,是影响生活质量的严重健康问题。因此研究听觉器官发生过程中的关键基因对于探索听力损伤的潜在策略至关重要。斑马鱼模型在理解内耳发育不良和相关疾病的分子遗传学原理方面得到了越来越多的应用,内耳发育包括遗传 ......
斑马鱼 基因 基因组 胚胎 甲基

使用GPS坐标来计算距离和方位角

https://johnnyqian.net/blog/gps-locator.html 根据地球上任意两地的经纬度,可以计算它们在球面上的最短距离(Great-circle Distance / Orthodromic Distance)及相对始末位置的方位角(Bearing)。 基本概念 行星的 ......
方位角 坐标 方位 GPS

计算两个经纬度坐标之间的距离值

import java.util.*; import java.math.*; /** * 计算两个经纬度坐标之间的距离值 * src: https://blog.csdn.net/zhuxiaoping54532/article/details/53671641 */ public class t ......
经纬度 经纬 坐标 之间 两个

Linux 中 shell 脚本实现根据gff统计每一个基因的转录本数目

001、生成基因名称的列表 awk -F "\t" '$3 == "gene" && $NF ~ /gene=/ {print $NF}' chr1.gff | sed 's/\(.*\)\(gene=[^;]\+\)\(.*\)/\2/' | sort | uniq > gene.list 002 ......
数目 脚本 基因 Linux shell

玉米基因型不同导致其根系微生物群落不同

当进行宏基因组分析时,我们发现不同的玉米基因型可能会导致其根系微生物群落的不同。这种群落的变化可能与许多环境因素相关,例如土壤pH值、温度、湿度和养分含量等。 然而,最近的研究表明,玉米基因型也可能对其根系微生物群落的形成产生影响。例如,在一项研究中,研究人员对20个不同玉米基因型进行了分析,并通过 ......
根系 群落 微生物 基因 玉米

不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析

标题:不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析 摘要: 本研究旨在探究吉林省农科院不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组特征。通过种植三块地,每块地一半种植B73玉米材料,另一半种植Mo17玉米材料,并设置三个生物学重复。分别在第四周、第六周、第八周和第十周采集土壤样本进行测序,以获取 ......
基因组 基因 玉米 地点 材料

吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析

标题:吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析 摘要: 本研究旨在通过对吉林省农科院不同地点种植的B73和Mo17玉米材料进行宏基因组分析,探究它们在不同时间点和地点的土壤微生物群落组成和功能潜力差异。通过在三个地点种植三块地,每块地一半种植B73玉米材料,另一半种植Mo17玉米材料 ......
基因组 农科院 基因 玉米 地点

2023年5月最新全国省市区县和乡镇街道行政区划矢量边界坐标经纬度地图数据 shp geojson json

发现个可以免费下载全国 geojson 数据的网站,推荐一下。支持全国、省级、市级、区/县级、街道/乡镇级以及各级的联动数据,支持导入矢量地图渲染框架中使用,例如:D3、Echarts等 geojson 数据下载地址:https://geojson.hxkj.vip 该项目 github 地址:ht ......
经纬度 行政区划 矢量 区县 经纬

高维数据惩罚回归方法:主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据

全文链接:http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告,包括一些图形和统计输出。 在本文中,我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
数据 高维 基因 弹性 成分

Cesium:坐标系

Cesium中有两种坐标系,WGS84地理坐标系和笛卡尔空间坐标系。 WGS84地理坐标系包括:WGS84经纬度坐标系(没有实际的对象)和 WGS84弧度坐标系(Cartographic); 笛卡尔空间坐标系包括 笛卡尔空间直角坐标系(Cartesian3)、平面坐标系(Cartesian2),4D ......
坐标系 坐标 Cesium

高维数据惩罚回归方法:主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据

全文链接:http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告,包括一些图形和统计输出。 在本文中,我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
数据 高维 基因 弹性 成分

plotly 坐标轴范围截断rangebreaks使用的一个注意点

plotly坐标轴截断混合设置且指定设置截断时间的时候需要注意先后顺序 大范围的时间要在小范围的时间前设置,比如日内时间的截断要设置在日期截断的后面 同范围的规则截断要在指定截断前设置,对日期的截断,规则系截断最好在指定截断前设置,六日截断规则在指定日期截断前 以上两条为测试出来的规律,具体细节尚未 ......
坐标轴 坐标 rangebreaks 范围 plotly

速递:易基因科技应邀在广东药科大学生物信息系讲课分享表观遗传学研究技术

2023年5月8日上午,深圳市易基因科技有限公司高级技术总监王君文应邀至广东药科大学医药信息工程学院生物信息系开展关于“基因组学时代:表观遗传学研究及DNA甲基化技术介绍”的线下讲座。讲座由生物信息系副主任任重鲁主持,众多学生积极响应参与。 表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表 ......
表观 信息系 药科 遗传学 基因

低载波比改进无差拍预测控制,相比传统旋转坐标系下的无差拍,载波比更低,减少了控制延时。

低载波比改进无差拍预测控制,相比传统旋转坐标系下的无差拍,载波比更低,减少了控制延时。适合高速电机控制使用。ID:68127673287011640 ......
坐标系 坐标 传统

Cesium将经纬度转为屏幕坐标系并判断是否在当前视角可见

//1.计算屏幕坐标 let position = Cesium.Cartesiian3.fromDegrees(jd, wd, 0); let chanedc = Cesium.SceneTransforms.wgs84ToWindowCoordinates(viewer.scene, posit ......
经纬度 坐标系 经纬 坐标 视角

易基因:2023年植物表观转录组研究的最新进展(m6A+m5C)|深度综述

大家好这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 被称为表观转录组(epitranscriptome)的RNA修饰正成为基因调控的广泛调控机制。由于绘制转录组范围RNA修饰测序策略的改进,以及分别对沉积、去除和识别RNA修饰的writers、erasers和readers密集表征,表观转 ......
表观 基因 深度 植物 2023

(原创第一篇,踩坑无数得来的,对Ai自动化测试框架很有帮助)appium自动化测试时遇到不能使用element定位的在用坐标点击之后获取焦点如何输入文本

现在开发的前端界面使用vue或者更牛逼技术,导致使用appium或者uiautomator2做自动化测试时不能识别到元素,无法使用传统的id,name或者xpath,这时我们需要使用坐标点击文本框。有获取坐标方法,下期写一篇文章,可以在评论区提醒瑞克。 from appium import webd ......
坐标 框架 文本 element 焦点

YOLOV8显示结果坐标和实现类别计数

YOLOV8显示结果坐标和实现类别计数 ​ 本来5.1号的时候就想发出来的,结果阳了,躺了三天,今天好点了!!!5.1那天有个水友问我,YOLOV8如何实现结果检验框的坐标显示和类别计数,我说YOLOV8和YOLOV5一样都是ultralytics的产物,修改代码的原理是一样的,但是值得注意的是如果 ......
坐标 类别 结果 YOLOV8 YOLOV

02Prodigal基因预测

1、简介 Prodigal是为细菌和古菌基因组进行蛋白编码基因预测的软件 ,其缩写源于PROkaryotic DYnamic Programming Genefinding ALgorithm,表示原核生物基因预测的动态规划算法。 最早在2007年,在美国能源部联合基因组研究所(DOE)的支持下,由 ......
基因 Prodigal 02

6.3.5 平面向量数量积的坐标表示

${\color{Red}{欢迎到学科网下载资料学习 }}$ [ 【基础过关系列】高一数学同步精品讲义与分层练习(人教A版2019)] (https://www.zxxk.com/docpack/2921718.html) ${\color{Red}{ 跟贵哥学数学,so \quad easy!}} ......
向量 坐标 平面 数量