变异
创意无限：火星文和变异字体的魅力世界
在互联网的浩瀚星空里，火星文和变异字体如同璀璨的繁星，照亮了网络世界的角落。它们以独特的创意和视觉冲击力，吸引着无数网友的目光。让我们一起走进这个充满创意和想象力的世界，感受火星文和变异字体的无限魅力。 火星文生成器 | 一个覆盖广泛主题工具的高效在线平台(amd794.com) https://a ......
基因组变异分析
基因组变异分析 基因组变异是指与参考序列相比,基因组中发生的单碱基变异、DNA序列片段插入、缺失、扩增和复杂结构变异等。 目前基于测序方法进行单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism, SNP）、短的插入缺失（Insertion-Deletion, InDel）等 ......
BUUCTF_Crypto_WriteUp | 变异凯撒
题目 加密密文：afZ_r9VYfScOeO_UL^RWUc 格式：flag{ } 分析 先复习一下凯撒密码。 它是一种替换加密的技术，明文中的所有字母都在字母表上向后（或向前）按照一个固定数目进行偏移后被替换成密文。例如，当偏移量是 3 的时候，所有的字母 A 将被替换成 D，B 变成 E，以此类 ......
读图数据库实战笔记04_路径与图变异
1. Groovy 1.1. Java编程语言的一个超集 1.2. Gremlin Console的一个特性是能和Groovy配合使用 1.2.1. Gremlin Console会自动地迭代结果 1.3. 从技术上说，Gremlin Console就是Groovy交互式解释器（read-eval- ......
gatk 实现基于染色体合并gvcf文件，并获取变异
001、基于染色体合并gvcf文件 gatk CombineGVCFs -R reference.fna -V gvcf.list -L chrN -O chrN.merged.g.vcf.gz 其中： referen.fna 是参考基因组； gvcf.list是将要合并的gvcf文件的列表文件，一 ......
数组变异方法和非变异方法的总结
区别：1.操作数组的方法中，分为变异方法和非变异方法。2.其中，变异方法意味着会改变原数组，而非变异方法则只会返回一个新数组，不会修改原始数组 数组变异方法：push() //数组尾部追加一个元素pop() //数组尾部弹出一个元素shift() //数组头部弹出一个元素unshift() //数组 ......
三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容
王院长的报告涵盖了针对三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容。 在基因组组装算法方面，王院长分享了其团队在二代和三代测序数据基因组组装算法设计与分析方面的成果和突破。其中，针对长读长测序的高错误率以及错误分布不均匀等问题，王院长介绍了团队设计的一系列基因组组装和po ......
R语言用GAM广义相加模型研究公交专用道对行程时间变异度数据的影响|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=30508 原文出处：拓端数据部落公众号 最近我们被客户要求撰写关于GAM广义相加模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。 现实情况是，我们经常要处理多个自变量和一个因变量之间的关系，此外，虽然通过做散点图可以发现非线性关系，但很难归因其形式，多项式 ......
Sentieon实战：NGS肿瘤变异检测流程
肿瘤基因突变检测是NGS的一个重要应用，其分析难点主要在于低频变异的准确性。不同于遗传病检测，肿瘤样本类型多样，测序方法和参数复杂，且缺乏对应各种场景的公共标准真集。再加上常用开源软件经常遇到的准确性低，稳定性差，速度慢等问题。这使得广大诊断公司在评估肿瘤变异检测工具、搭建高效稳定的生信流程上，面临 ......
GSVA | 基因集变异分析 | 基因集通路打分
前作 转录相关signalling pathway活性打分 | 常见打分系统 | PROGENy 基于基因表达的打分模型 几种常见的打分方法： mean，最简单 Seurat的AddModuleScore，多了一个背景基因集，消除背景的影响，没什么意义，相当于设置了一个House keeping g ......
mutate-joins {dplyr}：变异联接
可变联接将列从 y 添加到 x，并根据键值匹配行： inner_join()：包括 x 和 y 中的所有行。 left_join()：包括 x 中的所有行。 right_join()：包括 y 中的所有行。 full_join()：包括 x 或 y 中的所有行。 如果 x 中的一行与 y 中的多行匹 ......
生物信息学-新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析
新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析 食硕2201班 汪睿劼 22020080043 食硕2201班 张 琦 22020080063 食硕2201班 孙 允 22020080037 食硕2201班 韩秋雨 22020080043 摘要：新型冠状病毒SARS-CoV-2 引发的 ......
基于第三代测序数据的结构变异检测方法研究
基于第三代测序数据的结构变异检测方法研究 白若飞 北京化工大学 摘要：第三代测序技术的飞速发展使人们能够通过少量较长的读段推测个体的完整染色体序列,同时推动了基因变异检测的发展。结构变异的准确检测对人类遗传多样性和临床疾病的研究至关重要。传统研究结构变异的方法是将手工提取的变异特征进行参数统计来判别 ......
基于长读数和重比对的结构变异检测方法研究
基于长读数和重比对的结构变异检测方法研究 杜彩云 河南理工大学 摘要：人类基因中普遍存在结构变异,一些结构变异的发生会产生重大的基因型疾病,这对人类的健康来说是一个巨大的威胁。为了有效治疗这些基因型疾病,最关键的一步是准确检测相应的结构变异类型和位置。常见的结构变异有插入、缺失、倒位和串联重复。其中 ......
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究 姜涛 哈尔滨工业大学 摘要：随着测序技术的不断成熟和广泛应用,以测序技术为驱动的基因组、转录组等多组学的研究得到了跨越式发展,推动了基因组科学、遗传学、临床医学等多学科的变革。基因组变异检测作为基因组研究中最为核心和关键的环节,对于基因组注释、与疾病和 ......
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要：随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
01.GATK人种系变异最佳实践SnakeMake流程：WorkFlow简介
<~生~信~交~流~与~合~作~请~关~注~公~众~号@生信探索> 学习的第一个GATK找变异流程，人的种系变异的短序列变异，包括SNP和INDEL。写了一个SnakeMake分析流程，从fastq文件到最后的vep注释后的VCF文件，关于VCF的介绍可以参考上一篇推文基因序列变异信息VCF (Va ......
SPSS计算极值、平均值、中位数、方差、偏度、峰度、变异系数
本文介绍基于SPSS软件的经典统计学分析与偏度、峰度等常用统计学指标的计算方法。 首先需要说明，本文所述数据的经典统计学分析，包括计算数据的极值、平均值、中位数、标准差、方差、变异系数、偏度与峰度等常用统计学指标。 首先，打开SPSS软件。 第一步需要将数据导入SPSS中。选择“文件”，然后选择“数 ......
利用snpEff对基因型VCF文件进行变异注释的详细方法
利用snpEff对VCF文件进行变异注释 群体遗传研究中，在获得SNP位点后,我们需要对SNP位点进行注释，对这些SNP位点进行更深的了解。 snpEff是一个用于对基因组单核苷酸多态性(SNP)进行注释的软件，snpEff软件可以用于对VCF文件进行变异注释，使用时需要先进行安装，然后构建参考基因 ......
R语言实现GWAS结果显著SNP位点归类提取与变异类型转化
GWAS结果显著SNP位点归类提取与变异类型转化 根据GWAS得到的Rresult文件信息，能够找出每个snp位点对应的显著性情况和基因变异信息，接下来，需要根据表格中的信息进行归纳总结，对不同显著性层次进行区分，找出可能性最大的点，过程比较繁琐。 这里笔者分享一个算法，使统计SNP和变异类型变的更 ......
3 分散性与变异性的量度：强大的“距”
平均数 = 数据典型值 平均数让我们有办法确定一批数据的中心 量度全距 通过计算全距（也叫极差），是用于量度数据集分散程度的一种方法，我们可以轻易获知数据分散情况。 全距指出数据的扩展范围，有点儿像测量数据的宽度。 全距的计算方法是：用数据集中的最大数减去数据集中的最小数(上界-下界) 最小值称为下 ......
js数组方法之数组变异方法
push、pop、unshift、shift、sort、splice、reverse 以上这些方法都会改变原数组并且 这些方法的返回值是值得注意的有时候可以提高工作效率，比如pop方法的返回值是该元素(删去的第一个) 其他的都不多说了，还有一些非变异方法 了解一下 filter() //过滤数组中某 ......
MATLAB计算变异函数并绘制经验半方差图
本文介绍基于MATLAB求取空间数据的变异函数，并绘制经验半方差图的方法。 由于本文所用的数据并不是我的，因此遗憾不能将数据一并展示给大家；但是依据本篇博客的思想与对代码的详细解释，大家用自己的数据，可以将空间数据变异函数计算与经验半方差图绘制的全部过程与分析方法加以完整重现。 1 数据处理 1.1 ......
【故障公告】它（变异的百度蜘蛛）又来了，雪上加霜又添恐怖的三月
今天12点左右，它又来了，熟悉的恐怖身影（116开头IP段、山西的某个城市），不是cc攻击，是那只让人敬畏的蜘蛛。2022年4月3日，它的首次来访在园子里掀起狂风暴浪，数据库连接数过万，负载均衡带宽跑满，带宽扩容50%依然跑满，当时我们通过限制同一个IP每天的请求数侥幸躲过。 ......
借助Radamsa变异数据（初探）
Radamsa 介绍 Radamsa是一款测试用例生成器，通常用来测试程序对格式错误和潜在恶意输入的承受能力（对程序进行模糊测试）。它通过你的输入来返回变异后的数据。它的主要卖点是，它已经在真正重要的程序中发现了许多错误。 Radamsa 使用方法 1、可以直接喂给它字符，它就会返回变异之后的数据给 ......