ChIP-seq

易基因:ChIP-seq等揭示SETD2介导H3K36me3调控结直肠癌进展的表观遗传机制|CTM研究

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)是一种复杂的多阶段疾病,由基因突变和表观遗传改变相互作用引起。组蛋白H3K36三甲基转移酶SET结构域2 (SETD2)是一种表观遗传信号分子,在结直肠癌中突变率为5%。SETD2在 ......
表观 直肠癌 直肠 基因 ChIP-seq

易基因:人精子H3K4me3 ChIP-seq和DNA甲基化WGBS揭示与生育和发育相关重叠区域

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 目前,六分之一的夫妇患有不孕不育,其中多达一半的病例由男性因素引起,在过去的40年中,精子数量下降了50%。尽管导致精子质量和数量下降的因素知之甚少,但环境-表观基因组相互作用是可能的。暴露于有毒物质、饮食和 BMI 升高与精子表观基因 ......
甲基 精子 基因 ChIP-seq 区域

易基因:MeRIP-seq+ChIP-seq等揭示m6A甲基化在休眠期转录休眠调控中的潜在功能

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 发育通常被认为是遗传程序的顺序展开,复杂程度不断提高,并按固定轨迹随时间进行。然而,调整发育时间可以提高在不利条件下的存活率。在哺乳动物中,这表现为胚胎停育。在小鼠胚泡和胚胎干细胞中,通过抑制mTOR表达以及对Myc转录因子的抑制可诱导 ......
甲基 基因 潜在 MeRIP-seq seq

易基因:ChIP-seq等揭示BRWD3调控KDM5活性以维持H3K4甲基化水平的表观机制|PNAS

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白修饰对调控染色质结构和基因表达至关重要,组蛋白修饰失调可能导致疾病状态和癌症。染色质结合蛋白BRWD3(Bromodomain and WD repeat-containing protein 3)是Cul4-DDB1 E3泛素连 ......
表观 甲基 活性 基因 ChIP-seq

易基因:ChIP-seq揭示组蛋白修饰H3K27me3调控高温下棉花的雄性不育机制|Plant Com

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 气候变化导致极端天气事件更加频繁地发生,包括反常的高温(high temperature,HT),HT胁迫对作物的生长发育和产量有严重的负面影响,如平均生长温度每升高1°C,水稻产量就会下降10%,这一下降主要是由于对生殖发育的影响。棉 ......
雄性 棉花 基因 蛋白 高温

易基因:ChIP-seq等揭示转录因子NRF1调控原始生殖细胞发育、增殖和存活的表观遗传机制

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 原始生殖细胞(Primordial germ cell,PGC)是生殖细胞前体,可以产生卵母细胞和精子,确保生命延续。尽管PGC特化(PGC specification)得到广泛研究,但PGC种群在出生前迁移到胚胎性腺后如何维持和扩大仍 ......
生殖细胞 表观 因子 基因 ChIP-seq

易基因:ChIP-seq等揭示H3K4me1修饰在蜜蜂级型分化中的表观遗传调控机制|科研进展

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 蜜蜂是一种真社会性昆虫,是研究社会性昆虫级型发育和级型分化的重要模式生物,其分工主要基于级型分化(蜂王(queen)和工蜂(worker))。分化后,尽管基因组相同,但蜂王和工蜂具有不同的形态、生理、行为和寿命相关特征,级型分化的背后机 ......
科研进展 表观 蜜蜂 基因 ChIP-seq

易基因:近期染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)研究成果|项目集锦

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作(DNA-Protein Interactions,DPIs)是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。本期以科研内容为序 ......
研究成果 基因 集锦 ChIP-seq 成果

易基因:ChIP-seq等揭示METTL14调控哺乳动物二价结构域的表观遗传机制|科研进展

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白及其翻译后修饰在调控基因表达和其他染色质模板化过程中起着重要作用。组蛋白H3赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)和组蛋白H3K27me3分别在小鼠植入前胚胎的基因激活和基因抑制中发挥重要作用。H3K4me3和H3K27me3组成的染 ......
科研进展 二价 表观 基因 ChIP-seq

易基因:NAR:ChIP-seq等揭示蛋白质酰基化与c-di-GMP协同调控放线菌发育与抗生素合成机制|项目文章

易基因细菌ChIP-seq测序分析结果见刊《Nucleic Acids Research》 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2023年06月07日,华东理工大学生物工程学院和生物反应器工程国家重点实验室叶邦策教授和尤迪副教授为共同通讯作者、博士生符瑜为第一作者以“A ......
放线菌 酰基 抗生素 蛋白质 基因

易基因:全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点|mBio

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 细菌编码许多转录因子(transcription factor,TF),这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶(RNAP)全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对TF功能的研究几乎集中 ......
基因 位点 基因组 因子 细菌

易基因:ChIP-seq等揭示热休克转录因子A1b调控植物高温胁迫响应的分子机制|应激反应

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 在拟南芥中,热休克转录因子A1b(HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b,HSFA1b)通过影响种子产量来调控对环境胁迫的抗性。HSFA1b是生殖适应性的决定性因素,这种调控机制怎么形成的呢? 2018年, ......
应激反应 因子 基因 高温 ChIP-seq

CTCF ChIP-seq

CTCF ChIP-seq CTCF(CCCTC binding factor),是CTCF基因编码的转录因子 ,与绝缘子的活性相关。 CTCF蛋白在印记调控区域(imprinting control region,ICR)和分化甲基化区域1(differentially-methylated re ......
ChIP-seq CTCF ChIP seq

ChIP-seq 分析:Differential Peaks(15)

动动发财的小手,点个赞吧! 1. 寻找差异区域 然而,识别特定于细胞系或条件的峰并不能捕获表观遗传事件的全部变化。 为了识别表观遗传事件的差异,我们可以尝试量化 IP 样本中非冗余峰组中片段丰度的变化。 我们首先必须建立一组区域,在这些区域中量化 IP ed 片段。 一种成熟的技术是产生一组非冗余峰 ......
Differential ChIP-seq Peaks ChIP seq
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