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每日学习记录20230221_purr包 GSEA pandas

发布时间 2023-04-11 08:53:01作者: Mo槑

20230221:purr包 GSEA pandas

  1. purr的map_*函数的使用

    DF = List1 %>% names %>% map_dfr(function(x){   #把List1转化成DataFrame的格式, map_dfr是把结果都按行合并起来.
  return (data.frame(x ,
             List1[[x]]$'all'))
  })
    1. clusterProfile::GSEA调用的是DOSE::GSEA_internal
    2. DOSE::GSEA_internal 调用的是fgea包或者自己写的GSEA_DOSE函数

  3. 总是忘记pandas的操作命令,感觉还是R操作数据框要方便一些

    data1.iloc[i,23]    第i行第23列数据
X1=train_data.iloc[:,:22]   取前23列数据
Y1=train_data.iloc[:,22]    取第23列数据

  4. 学习时长:
    image-20230221221543783