526互联

SNP间的上位效应

发布时间 2023-10-15 10:25:54作者: emanlee

传统的全基因组关联分析（GWAS）计算的是单个SNP与表型的相关性，除此之外，我们还可以进行SNP之间的互作效应与表型的相关性分析。

上位效应的公式为：Y ~ b0 + b1.A + b2.B + b3.AB + e

Y为表型，A和B分别为两个变异位点，在GWAS中通常指SNP，如果b3为显著，则说明存在上位效应。

 

 

REF

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