MNE-Python中的Epoch

发布时间 2023-10-13 14:53:25作者: 谁动了我的奶盖


(图片来自links 视频截图,侵删)

在MNE-Python中,Epoch是指将原始脑电数据按照一定的时间窗口和事件标记进行切割和分类的过程。即将原始数据切割成若干个时间段(通常称为Epochs或Trials),每个时间段对应一个特定的事件(例如视觉刺激、听觉刺激、按键反应等)。

Epoch是脑电数据分析中常用的数据结构,它可以方便地对不同事件的脑电信号进行比较和分析。通常,Epoch的长度是根据实验设计和研究目的而定的,可以是几百毫秒到数秒不等。

在MNE-Python中,可以使用Epochs类来创建Epoch。创建Epochs对象需要提供原始数据、事件标记和Epoch的时间窗口等参数。例如,以下代码创建一个长度为1秒、事件标记为'visual'的Epoch:

import mne

读取.fdt格式的脑电数据

raw = mne.io.read_raw_fif('data.fdt')

读取事件标记

events = mne.find_events(raw)

创建Epochs对象

epochs = mne.Epochs(raw, events, event_id={'visual': 1}, tmin=0, tmax=1, baseline=None)

其中,raw是原始数据的Raw对象,events是通过find_events函数获取的事件标记,event_id是一个字典,用于将事件标记映射为数字编码,tmin和tmax是Epoch的时间窗口,baseline表示是否进行基线校正。

创建Epochs对象后,可以使用该对象的方法和属性对Epoch进行操作和分析,例如:

打印Epochs对象的信息

print(epochs)

从Epochs对象中获取特定事件的数据

visual_epochs = epochs['visual']

对Epochs数据进行平均

evoked = visual_epochs.average()

绘制ERP波形图

evoked.plot()
需要注意的是,创建Epochs对象需要一定的预处理和数据清洗,例如去除伪迹、滤波、去除噪声等。另外,创建Epochs对象时需要根据实验设计和研究目的,选择合适的时间窗口和事件标记。