seqkit 软件的安装及使用

发布时间 2023-09-25 20:47:05作者: 小鲨鱼2018

 

001、安装

下载最新版:

官网:https://github.com/shenwei356/seqkit/releases

 

002、解压、调用测试

(base) [root@pc1 Seqkit]# ls     ## 安装包
seqkit_linux_amd64.tar.gz
(base) [root@pc1 Seqkit]# tar -xzvf seqkit_linux_amd64.tar.gz    ## 解压
seqkit
(base) [root@pc1 Seqkit]# ls
seqkit  seqkit_linux_amd64.tar.gz
(base) [root@pc1 Seqkit]# pwd
/home/software/Seqkit
(base) [root@pc1 Seqkit]# echo "export PATH=$PATH:/home/software/Seqkit" >> ~/.bashrc  ## 添加环境变量
(base) [root@pc1 Seqkit]# source ~/.bashrc                  ## 加载环境变量
(base) [root@pc1 Seqkit]# seqkit --version |head            ## 调用测试
Error: unknown flag: --version
Usage:
  seqkit [command]

Available Commands:
  amplicon        extract amplicon (or specific region around it) via primer(s)
  bam             monitoring and online histograms of BAM record features

 

003、