seqkit

001、 单个删除 (base) [root@pc1 test1]# ls a.fa (base) [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试文件 >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt ......

001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa chr.list [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4 aaaaattt [root@pc1 t ......

1. 背景 在前面小节我们使用了这些软件,因为混合使用比较让人混乱,这里总结理清楚一下. 2. seqtk 功能总览如下图所示. 2.1 seq 这个功能主要是对$.fasta$和$.fastq$格式的文件进行格式化. \(-l\) 主要是让序列每行显示多少个碱基 #每行显示60个氨基酸 seqtk ......

001、安装 下载最新版： 官网：https://github.com/shenwei356/seqkit/releases 002、解压、调用测试 (base) [root@pc1 Seqkit]# ls ## 安装包 seqkit_linux_amd64.tar.gz (base) [root@ ......