染色体
Linux 中 shell脚本统计fasta文件中每一条染色体的长度
001、 借助数组实现 [root@pc1 test]# ls a.fa [root@pc1 test]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 aattccgg ttcc >chr2 ttccc >chr3 tttc cct ## 统计脚本 [root@pc1 test]# aw ......
Linux 中shell脚本实现给fasta文件中重复的染色体名做序号标记
001、测试数据 [root@pc1 test]# ls a.txt [root@pc1 test]# cat a.txt ## 测试数据 >jcf7180003470556 2 7 >jcf7180003470556 3 8 >jcf7180003470552 4 9 6 >jcf71800034 ......
seqkit软件根据染色体名称从fasta文件中批量提取数据
001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa chr.list [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4 aaaaattt [root@pc1 t ......
Linux awk给fasta中重复的染色体名做重复标记
001、 [root@pc1 test1]# ls a.txt [root@pc1 test1]# cat a.txt ## 测试文件 >jcf7180003470556 2 7 >jcf7180003470556 3 8 >jcf7180003470552 4 9 6 >jcf7180003470 ......
gatk 实现基于染色体合并gvcf文件，并获取变异
001、基于染色体合并gvcf文件 gatk CombineGVCFs -R reference.fna -V gvcf.list -L chrN -O chrN.merged.g.vcf.gz 其中： referen.fna 是参考基因组； gvcf.list是将要合并的gvcf文件的列表文件，一 ......
RIdeogram染色体可视化
Circos玩多了难免会视觉疲劳，今天换一个新工具可视化，回到直条的染色体形式。 https://www.jianshu.com/p/07ae1fe18071 https://cran.r-project.org/web/packages/RIdeogram/vignettes/RIdeogram. ......
【高中生物必修二】第二章 基因和染色体
# 第一节 减数分裂与受精作用 减数分裂是两倍体细胞（有性繁殖）产生单倍体配子的过程，简单而言，染色体的数量变为一半。二倍体细胞中每一对染色体大小形态意义类似，一个从母方获得，一个从父方获得，故一对染色体也会有差距。有丝分裂产生复制品，往往用于常被磨损的细胞，例如皮肤。减数分裂的主要目的是增加遗传多 ......
额外小标记染色体-你有吗？
最近去医院做孕前检查，染色体结果令我大吃一惊！47，XY，+mar！大家都知道正常人的染色体数目是23对46条，同样我也非常清楚，所以当时我就楞了一下，我居然是47条？第二反应--我居然是正常人！那问题出在哪里呢？ 当值医生告诉我要我去生殖医学中心进一步咨询，我怎么会就此向命运妥协？回到家后首先研究 ......