丰度perl otu

全面对比 汇编、易语言、Shell、Lua、Ruby、Perl、Erlang、Rust、Scala、Python、Go、VB、PHP、C/C++、C#、.Net、Java、…… 等多种编程语言的区别

1. 语言类型:首先,C/C++、Java 、Python都是强类型的语言。强类型语言的定义如下: 强类型语言是一种强制类型定义的语言,即一旦某一个变量被定义类型,如果不经强制转换,那么它永远就是该数据类型。而弱类型语言是一种弱类型定义的语言,某一个变量被定义类型,该变量可以根据环境变化自动进行转换 ......
语言 编程语言 多种 Erlang Python

R:计算相对丰度最简单的R代码

rm (list = ls ()) #清除所有变量 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\PCoA") #设置工作目录 # 加载必要的库 library(dplyr) # 读取数据,假设您的文件名是 data.txt # 请根据您的文件实际 ......
丰度 代码

相对丰度与绝对丰度

绝对丰度和相对丰度是生态学和生物统计学中常用的两个概念,它们用于描述物种在特定环境中的分布和数量。 绝对丰度(Absolute Abundance): 绝对丰度是指在特定区域或样本中某个物种的实际数量。 它通常用个体数来衡量,比如在一个湖泊中特定鱼类的个体总数。 绝对丰度提供了物种在给定环境中的具体 ......
丰度

[20231130]快速删除大量文件测试(perl版本)3.txt

[20231130]快速删除大量文件测试(perl版本)3.txt--//上上个星期做维护时,发现一台机器累积了大量aud文件,使用find -mtime +30 做保留1个月的删除操作时那个慢简直无法形容。--//我做了一些测试,结果测试遇到一些问题或者疑惑,浪费大量时间,根据以前测试我知道per ......
20231130 版本 文件 perl txt

[ Perl ] 如何打印字符串原始字符

https://www.cnblogs.com/yeungchie/ 有时候需要将字符串的原始字符打印出来,即不转义字符串中的转义字符,例如: my $str = function_xxx(); 从某个接口获取到字符串,现在假设 $str 取到的数据是 "a\nb\nc\n"。 简单打印一下: pr ......
字符 字符串 Perl

perl:mysql binlog iud (insert、update、delete)分析 小脚本:实用程序

1 #!/usr/bin/perl 2 # utf-8 3 4 use strict; 5 use POSIX; 6 use Time::HiRes qw/sleep time/; 7 8 $| = 1; 9 10 my $line='# '; 11 my $debug= 0 ; 12 13 ## ......
脚本 程序 binlog insert delete

Linux下Perl的安装

Linux下Perl的安装 855 2022-07-31 22:31:37 1、在官方网站下载新版本的源码包: http://www.perl.org/get.html,版本自己选择,我下载的是perl-5.34.0.tar.gz cd /backup/soft/ wget https://www. ......
Linux Perl

查看perl中 使用 cpan -i module安装过的模块

001、 (base) [b20223040323@admin1 003_annotation]$ perldoc perllocal | grep "\"Module\"" ## 查看命令 。 ......
模块 module perl cpan

/usr/bin/perl: symbol lookup error: Devel/Size/Size.so: undefined symbol: Perl_xs_apiversion_bootcheck

001、perl报错如下:/usr/bin/perl: symbol lookup error: Devel/Size/Size.so: undefined symbol: Perl_xs_apiversion_bootcheck 002、 ......

Linux 中 安装perl模块 以及 确认

001、系统信息 002、安装CPAN 003、以JSON为例,在未安装状态下查看 004、利用cpan -i JSON安装该模块 005、查看JSON 安装状态 参考: 01、https://www.onitroad.com/jc/linux/faq/find-out-what-perl-modu ......
模块 Linux perl

非root 用户安装perl模块

001、perl 配置RepeatModeler 警告缺少 perl模块如下: (base) [b20223040323@admin1 RepeatModeler-2.0.2a]$ perl configure The following perl modules required by Repea ......
模块 用户 root perl

Can't locate CPAN.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5

001、perl -MCPAN -e shell命令报错: Can't locate CPAN.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5 (以上报错提示没有安装CPAN模块) 002、解决方法 yum -y install perl-CPAN ......
INC contains locate local perl5

The following perl modules required by RepeatModeler are missing from your system. Please install these first: JSON; JSON::PP; File::Which

001、问题 RepeatModeler 编译安装报错如下: 002、尝试逐个安装确实的perl模块; 也是各种问题; 最后不想折腾, 就大力出奇迹,全安装, 可一次解决所有报错; (base) [root@pc1 RepeatModeler-2.0.2a]# yum -y install perl ......

perl 常见错误提示信息

$animal = "camel" syntax error at ReadCount.V3.pl line 15, near "my "Global symbol "%RnaEdits" requires explicit package name at ReadCount.V3.pl line ......
常见 错误 信息 perl

perl判断字符串包含

perl判断字符串包含 perl中没有判断字符串包含的函数,可以用正则表达式来实现这个功能,下面代码判断$str1是否包含$str2。 if($str1 =~/$str2/) { ...} if ($str1 !~/str2/) { #匹配了不包含的 }else { #匹配了包含的 } ......
字符串 字符 perl

命令行中perl程序调试

用-d命令行选项启动Perl解释器,例如 perl -d test.pl 即进入Perl调试器的交互界面。 调试命令如下:(所有命令都在调试提示符下顶格输入,命令要区分大小写) h:显示调试器的帮助信息。 |h:以分页形式显示调试器的帮助信息。 h h:显示一个简要的帮助信息。 h 调试命令:显示某 ......
命令 程序 perl

MaSuRCA 软件安装 swig/perl5/swig_wrap.cpp:342:20: fatal error: string.h: No such file or directory

001、问题 MaSuRCA 软件安装 swig/perl5/swig_wrap.cpp:342:20: fatal error: string.h: No such file or directory 002、原因, 当前环境处于conda的base环境,可能是函数库调用混乱。 003、解决方法, ......
swig directory swig_wrap MaSuRCA string

Can't locate Env.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl

001、问题 Can't locate Env.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl 002、解决方法 (base) [root@pc1 MaSuRCA-4.1.0]# yum -y insta ......
local perl INC usr contains

swig/perl5/swig_wrap.cpp:763:20: fatal error: EXTERN.h: No such file or directory

001、问题 002、解决方法 (base) [root@pc1 MaSuRCA-4.1.0]# yum -y install perl-devel 参考:https://www.likecs.com/ask-702675.html 。 ......
swig directory swig_wrap EXTERN perl5

将每一个OTU拆分成不同的分类级别

import pandas as pd # 读取OTU表 otu_df = pd.read_csv('C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\1.txt', header=None) # 创建一个空的DataFrame来存储结果 df = pd.DataFrame(co ......
级别 OTU

CentOS-7离线安装perl

1、下载相关安装包 CentOS-7 所有rpm包的仓库地址:http://mirror.centos.org/centos/7/os/x86_64/Packages/ perl-5.16.3-297.el7.x86_64.rpm快速下载地址: http://mirror.centos.org/ce ......
CentOS perl

debia12报错 perl: warning: Setting locale failed

目录前奏情景复现官方解释解决以防走丢 前奏 该文档是在Debian12上遇到的问题,特别做个记录 情景复现 perl: warning: Setting locale failed. perl: warning: Please check that your locale settings: LAN ......
Setting warning locale failed debia

用例子学习Perl用法

为了更好地利用Perl,下面为实现对xxx.log的日志,检查当中是否存在fail的字段的目的,逐段给出代码,然后分析 # 实验材料 * xxx.log日志文件 * check_fail.pl脚本 # 读取文件 ``` # check_fail.pl $value; $value = open(fi ......
例子 Perl

Perl脚本 入门基础

## Perl 介绍 Perl是一个强大的脚本语言,主要用于文本处理。由于其强大的文字处理能力,Perl成为了IC行业中常用的脚本语言。 ### Perl变量 * Perl变量只有三种:变量,数组,哈希表,使用时分别对应三个符号$,@,% ``` $var = "str01"; #字符型变量 $va ......
脚本 基础 Perl

论文解读(PERL)《PERL: Pivot-based Domain Adaptation for Pre-trained Deep Contextualized Embedding Models》

Note:[ wechat:Y466551 | 可加勿骚扰,付费咨询 ] 论文信息 论文标题:PERL: Pivot-based Domain Adaptation for Pre-trained Deep Contextualized Embedding Models论文作者:Eyal Ben-D ......

在Windows系统上,给perl安装JSON::parse module

管理员身份打开powershell, 一定以管理员身份打开: 输入下面两行命令即可 cpan App::cpanminuscpanm JSON::Parse JSON::Parse 指南:https://metacpan.org/pod/JSON::Parse perl module安装指南: ht ......
Windows module 系统 parse JSON

Perl:Komodo IDE

1、Strawberry Perl 安装 直接下载安装包后安装,非常简单 2、ActiveState Perl 安装 官网:https://platform.activestate.com/featured-projects 3、Komodo IDE的下载与安装 访问ActiveState官网 ht ......
Komodo Perl IDE

正则表达式(Perl风格)

1、修饰符 修饰符 描述 i 完成不区分大小写的搜索 g 查找所有出现(all occurrences,完成全局搜索) m 将一个字符串视为多行(m就标识多multiple)。默认情况下,^和$字符串匹配字符串中的最开始和最末尾。使用m修饰符将使^和$匹配字符串中每行的开始 s 将一个字符串视为一行 ......
正则 表达式 风格 Perl

perl

perl perl语言解释器 ## 补充说明 **perl命令** 是perl语言解释器,负责解释执行perl语言程序。 ### 语法 ```shell perl(选项)(参数) ``` ### 选项 ```shell -w:输出有用的警告信息; -U:允许不安全的操作; -c:仅检查文件的语法; ......
perl

perl学习笔记13_引用

[TOC] 内容来源: https://www.runoob.com/perl/perl-database-access.html # 1. 说明 Perl引用是一个标量类型可以指向变量, 数组, 哈希表, 甚至子程序, 可以应用在程序的任何地方. # 2. 创建引用 ```perl my $ref ......
笔记 perl 13