HUMAnN
HumanN3安装
一、 软件安装： conda search 仓库是有结果的，安装却死活安装不上，直接pip安装成功了，用的清华的源，执行完pip install humann 等了近20min才显示安装完成。 输入humann出现如下信息表示安装成功，接下来安装相应数据库文件。 usage: humann [-h] ......
HUMAnN与PCoA的一个简单综述
摘要宏基因组分析在现代生态学和农业科学中扮演着重要的角色，通过深入研究土壤微生物群落功能组成的变化，可以为农作物种植提供有益的指导和决策依据。HUMAnN和PCoA在宏基因组学的研究中相辅相成，为我们深入了解微生物群落提供了有力工具。HUMAnN功能组成分析帮助我们理解微生物群落的功能潜力和生态角色 ......
humann详细参数
在 Humann 工具中，-o 是 --output 参数的简写形式，用于指定生成的输出文件的路径和名称。该参数通常用于自定义输出文件的名称和路径。 Humann 可以生成多种类型的输出文件，包括功能注释结果、物种组成结果、代谢通路丰度和覆盖度等。当您运行 Humann 时，使用 -o 参数可以指定 ......