526互联

下载微生物数据（孟德尔随机化）

发布时间 2023-09-09 17:43:27作者: 消失的森林

  1. 登录https://mibiogen.gcc.rug.nl/menu/main/home

  2. 选择TopHits

  3. 暴露因素选择条件0到1e-5 或者5e-8

  4. 作为结局数据选择条件5e-5到1

  5. 根据菌群纲目ID进行分类 ，可以选择MendelR包里面的函数进行切割并自动化SNP模版split_mibiogen_file('刚才下载的文件.csv')

libraray(MendelR)

#在线或者本地数据，多个暴露对应一个或者多个结局
mr_common_batch(c('ieu-a-2','ieu-b-2'),c('ukb-b-212','ieu-b-7'))

mr_common_batch('ieu-a-2.vcf.csv','ukb-b-212.vcf.csv')