电光源显微镜的照明光源，主要有卤素灯（halogen lamp）、汞灯（mercury vapor arc-discharge lamp）、氙灯（xenon short arc plasma lamp）和发光二极管（light-emitting diodes，LED）等类型。如图1，其中，卤素灯的连续光谱主要分布在可见光的暖色区，是传统生物显微镜的主要照明光源。卤素灯使用时，必须配备蓝色滤光片矫正光色。汞灯为非连续光谱，主要发射光谱分布在紫光和绿光附近，波长较短，能量高，一般用于荧光显微镜的激发照明。氙灯与汞灯相比，虽然红外部分占比较高，但可见光区的连续性较好，对需要多色荧光激发的实验更适合。LED光源也非连续光谱，但在多个光色范围内都有发射光谱分布，并具有发热少、寿命长等优势，故可应用于多种类型光学显微镜的照明。在明场显微镜中，LED光源的长寿命和低发热更显优势。
每种光源到底长什么样呢？其实卤素灯和LED等也许大家经常见到。如图2，卤素灯就是个小的真空灯泡，功率从10 W到100 W不等，依显微镜型号而定。换灯泡时，待灯泡冷却后，把旧灯泡拔下来，将新灯泡的两个脚插入灯泡座里就行啦。按持续工作计算（下同），卤素灯泡的寿命大约为90 ~ 200 h，最终以突然熔断结束。如果注意开关灯的方法，且显微镜的电路较稳定，寿命还能再长一些。
高压汞灯一般呈柱状，两头卡在电极上，中段发光，垂直于灯管发射。高压汞灯的寿命一般为300 ~ 400 h，最终发光强度越来越差而不能激发清晰的荧光，但很少熔毁。
LED即发光二极管，生活中常见的阵列小灯珠就是它。LED的寿命可达上千小时，只要电路不出问题，一般不会突然熄灭。但是，LED光源在使用很久以后，有光色改变的问题，肉眼不易察觉。因此，明场光镜使用LED光源比荧光显微镜更合适，对精细观察的实验的影响更小。人眼观察的舒适性方面，LED比卤素灯明亮，看上去更“白”，但看久了更容易疲倦。
