基因组 数据处理 基因 数据
Mysql数据同步至Elasticsearch
方案对比 鉴于Canal是一个基于MySQL二进制日志的高性能数据同步系统， go-mysql-elasticsearch 是一个第三方插件的，虽然都可以同步mysql数据到es，由于es官方文档推荐使用canal工具来同步数据，因此主要将Canal的使用方式提供给用户。 核心概念 名词 解释 my ......
Logstash全量、增量数据同步
Logstash-input-jdbc安装 logstash-input-jdbc插件是logstash 的一个个插件,使用ruby语言开发。所以要先安装ruby,也是为了好使用ruby中的gem安装插件，下载地址: https://rubyinstaller.org/downloads/，下载下来 ......
缓存数据库双写不一致
缓存数据库双写不一致 Redis 缓存与数据库 Mysql 双写不一致如何解决？方案2应该是最好的，也是最复杂的。其他都有很明显的问题。 对于频繁更新的数据不建议加缓存 异步更新缓存（基于订阅 binlog 的同步机制）：binlog 增量订阅消费 + 消息队列 + 增量数据更新到 redis 读 ......
我的设备产生了一些异常数据，如何找到？
对于异常值检测，我们可以使用一种称为"3倍中位数绝对偏差（3 times Median Absolute Deviation，3*MAD）"的方法。 using System; using System.Collections.Generic; using System.Linq; public c ......
选择什么样的数据安全交换系统，才能防止员工泄露数据？
数据泄露可能给企业带来诸多风险：财产损失、身份盗窃、骚扰和诈骗、经济利益受损、客户信任度下降、法律风险和责任等，《2021年度数据泄漏态势分析报告》中显示，在数据泄露的主体中，内部人员导致的数据泄漏事件占比接近60%。 员工数据外泄可能发生在数据生命周期的各个环节，从地理空间来划分，它可能发生在企业 ......
openpyxl模块---读取数据
测试数据： 读取该表格内容： 代码如下： def open(): from openpyxl import load_workbook wb = load_workbook('C:/Users/admin/Desktop/baihuo.xlsx') ###获取工作簿 sh1 = wb.active ......
研发型企业如何选择高效便捷的数据摆渡解决方案？
研发型企业在市场经济发展中发挥着至关重要的作用，研发型企业是指以科技创新为核心，以研发新产品、新技术、新工艺为主要业务的企业。这类企业注重技术创新和研发，持续不断地进行技术创新和产品升级，为经济发展注入新鲜的活力。 研发型企业分布在各行各业，不论是以创新创造为核心的新兴产业，如人工智能、生物制药、高 ......
【开源项目】轻量元数据管理解决方案——Marquez
大家好，我是独孤风。 又到了本周的开源项目推荐。最近推荐的元数据管理项目很多，但是很多元数据管理平台的功能复杂难用。 那么有没有轻量一点的元数据管理项目呢？ 今天为大家推荐的开源项目，就是一个轻量级的元数据管理工具。虽然轻量，但是元数据的收集、展示、数据血缘等功能都是支持的。 让我们一起来看看吧~ ......
一个小巧、快速、轻量级的 .NET NoSQL 嵌入式数据库
前言 今天给大家分享一个小巧、快速、轻量级的 .NET NoSQL 嵌入式数据库：LiteDB。本篇文章主要是介绍LiteDB和在.NET中如何使用。 LiteDB介绍 LiteDB 是一个小巧、快速和轻量级的 .NET NoSQL 嵌入式数据库。 无服务器的 NoSQL 文档存储 简单的 API， ......
在Python中利用内置SQLite3模块进行数据库操作的完整指南
在Python中，使用SQLite非常方便，Python内置了 SQLite3 模块，无需额外安装。SQLite 是一个轻量级的嵌入式数据库，适用于小型项目和单用户应用。以下是一个简单的示例，演示如何在 Python 中使用 SQLite，并提供了常见的查询、增加、修改和删除功能。 首先，确保你的 ......
Applescript成功实现imessage数据筛选,imessage蓝号检测,无痕检测手机号是否注册imessage的原理
一、imessages数据检测的两种方式:1.人工筛选，将要验证的号码输出到文件中，以逗号分隔。再将文件中的号码粘贴到iMessage客户端的地址栏，iMessage客户端会自动逐个检验该号码是否为iMessage账号，检验速度视网速而定。红色表示不是iMessage账号，蓝色表示iMessage账 ......
【python可视化大屏】使用python实现可拖拽数据可视化大屏
介绍： 我在前几期分享了关于爬取weibo评论的爬虫，同时也分享了如何去进行数据可视化的操作。但是之前的可视化都是单独的，没有办法在一个界面上展示的。这样一来呢，大家在看的时候其实是很不方便的，就是没有办法一目了然的看到数据的规律。为了解决这个问题我使用pyecharts实现了一个可视化的大屏。接下 ......
装载数据时报错：Failed to execute spark task, with exception 'org.apache.hadoop.hive.ql.metadata.HiveException(Failed to create spark client.)'
错误还原 hive (edu)> insert into huanhuan values(1,'haoge'); Query ID = root_20240110071417_fe1517ad-3607-41f4-bdcf-d00b98ac443e Total jobs = 1 Launching ......
Mysql 和 Redis 数据一致性问题
Mysql 和 Redis 数据一致性问题 https://www.cnblogs.com/scottyzh/p/17944675 https://juejin.cn/post/7302249560033853480 ......
数据结构查找
折半查找的判定树* 平均查找长度：O（log2n）。 结点的平衡因子定义为 节点的左子树深度与右子树深度之差。对于“平衡二叉树”平衡因子只可能为0,1,-1。若出现非三个值，则不平衡！ 解析折半查找树的步骤 首先就是要了解折半查找的步骤，然后依次将mid指向的值作为树的value。如下展示： 例如： ......
数据结构线性表
线性表的两种存储结构： 1.顺序存储（线性表若采用链式存储结构时，内存中可用存储单元的地址连续或不连续都可以） 2.链式存储（线性表若采用顺序存储结构时，必须占用一片连续的存储单元） 线性表的顺序存储结构 顺序存储结构在存、读数据时，不管是哪个位置，时间复杂度都是O(1)；而插入或删除时，时间复杂度 ......
数据结构树与二叉树
第五章 树及二叉树 书面作业 来源：算法与数据结构复习 第五章 树及二叉树(详解)_二叉树的中序遍历也可以循环地完成。给定循环中堆栈的操作序列如下(其中push为入-CSDN博客 一、判断题 1、某二叉树的前序和中序遍历序列正好一样，则该二叉树中的任何结点一定都无左孩子。 (T) 解析： 二叉树的前 ......
数据结构 图的基本知识
图的基本知识： 在n个结点的无向图中，若该图是连通图,则其边数大于等于n-1， 在n个结点的无向图中，若边数大于(n-2)(n-1)/2+1，则该图必是连通图 就是说连通是比较强的条件 2.用邻接矩阵法存储一个图所需的存储单元数目与图的边数有关。（） 正确 错误 这一题有歧义：如果不考虑邻接矩阵的压 ......
数据结构图的基本知识题
判断题 1.在n个结点的无向图中，若边数大于n-1,则该图必是连通图。 T F 解释： 以下两种说法是对的： 在n个结点的无向图中，若该图是连通图,则其边数大于等于n-1， 在n个结点的无向图中，若边数大于(n-2)(n-1)/2，则该图必是连通图 就是说连通是比较强的条件 2.用邻接矩阵法存储 ......
数据结构
根号算法 1. CF1806E 题意 给定一棵树，树上的每个节点权值给定，设为序列 \(a\)。 当 \(dep_x = dep_y\) 时，定义 \(w(x, y)=w(fa_x, fa_y)+a_xa_y,w(0,0)=0\)，\(q\) 次询问 \(w(x, y)\)。 \(n, q \le ......
基于“小数据”的机器学习
机器学习作为人工智能的一种最重要的实现方式，其历史可以追溯到20世纪50年代。只不过，早期受制于计算机的算力，基本没有什么能够落地的实际应用，更多的是各类算法的研究和发展。 之后，随着硬件的飞速发展，终于迎来了人工智能的春天，各种机器学习的算法在我们的日常生活中得到了广泛应用（很多情况甚至我们都没有 ......
Trends in Plant Science | 王向峰老师综述数据驱动的基因组设计育种
目录摘要将生物数据和知识转化为植物的精准设计育种机器学习（ML）在植物生物学中的应用案例研究：多组学数据关联研究（MODAS）中的数据降维（DR）亮点总结 今天简单回顾下中国农业大学王向峰教授团队2023年上半年发表在Trends in Plant Sicence的综述文章。该文阐释系统全面，值得赏 ......
机器学习应用于基因组预测，以苜蓿为例
目录目的示例代码表型文件预处理基因型文件预处理机器学习建模预测绘图其他结果 利用代码复现一个机器学习应用于基因组预测的项目，张志武老师于2023年发表在《园艺研究》上的一篇文章。 目的 使用 GWAS 和 GP 结合重测序数据和从世界各地收集的 220 份紫花苜蓿种质的秋季休眠（Fall dorma ......
由基因型-组织表达项目（GTEx）联想开去
近日，由丹麦奥胡斯大学、华南农业大学、中国农科院基因组所、美国农业部、马里兰大学、爱丁堡大学和等多家单位联合发起的猪基因型-组织表达计划（PigGTEx）取得阶段性进展，成功构建猪基因型-组织表达图谱，相关文章 “A compendium of genetic regulatory effects ......
GS | Ben Hayes报告：基因型数据基础
本报告是Ben Hayes和Hans Daetwyler合著。 关于Ben Hayes，前文已经介绍。详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基 ......
Omics辅助育种统计方法：基因组遗传力
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节： Genomic heritability。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提取生物学意义。研究目标是利用高维度 ......
基于无人机高通量植物表型大数据分析及应用研究综述
目录数据采集无人机系统数据预处理图像拼接颜色转换和校正图像分割数据分析图像分析关键技术作物株高提取叶面积指数提取技术植物病害检测技术 基于无人机系统的作物表型分析方法集数据采集、处理和分析于一身，大大缩短和精简了作物表型研究的时间和过程。首先，利用小型无人机在作物种植区域进行图像数据的采集；获取完毕 ......
GS | Ben Hayes的基因组选择课程
关于Ben Hayes详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基因组计划的发起者。在牲畜、作物、牧场和水产养殖物种的遗传改良方面拥有丰富的研究经 ......
GS | Julius报告：基因组预测的准确性
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......