序列 组长 算法 基因
【学习笔记】KMP 相关算法
KMP 单模式串匹配，比较平凡所以不说了，比较有借鉴意义的每次拓展一位和 \(nxt\) 数组能极大减少不合法的匹配，时间复杂度 \(O(|s|+|t|)\)。 引出一个定义，记满足 \(s[1,i]=s[|s|-i+1,|s|]\) 的前缀为字符串 \(s\) 的 \(\mathrm{border ......
【算法】【线性表】【链表】反转链表II
1 题目 给你单链表的头指针 head 和两个整数 left 和 right ，其中 left <= right 。请你反转从位置 left 到位置 right 的链表节点，返回 反转后的链表 。 示例 1： 输入：head = [1,2,3,4,5], left = 2, right = 4 输出 ......
读算法霸权笔记13_读后总结与感想兼导读
1. 基本信息 算法霸权：数学杀伤性武器的威胁 [美] 凯西·奥尼尔(Cathy 著 中信出版社,2018年9月出版 1.1. 读薄率 书籍总字数220千字，笔记总字数32359字。 读薄率32359÷220000≈14.71% 1.2. 读厚方向 算法的力量：人类如何共同生存？ 极简算法史：从数学 ......
【算法】【线性表】【链表】反转链表
1 题目 给你单链表的头节点 head ，请你反转链表，并返回反转后的链表。 示例 1： 输入：head = [1,2,3,4,5] 输出：[5,4,3,2,1] 示例 2： 示例 3： 输入：head = [] 输出：[] 提示： 链表中节点的数目范围是 [0, 5000] -5000 <= No ......
（坚持每天都写算法）算法复习与学习part1基础算法1-5
今天是写题，数的的三次方根。 使用二分法，浮点数不能位运算直接/2即可。 //这道题很难想到二分，二分查找是查找，就是找哪个地方有目标数 //一般是用在区间上的， //总结：二分要求是有查找条件且是查找，符合这两个条件就可以考虑 //不过这里可以把从0到n的浮点数当成一个区间，看数值范围的话，n的话 ......
（坚持每天都写算法）算法基础复习part1基础算法1-4——二分
二分使用的前提是有序性的条件如果要找以下情况： 1.找大于等于数的第一个位置 2.找小于等于数的第一个位置 二分使用的前提是无序性的条件下如果要找以下情况： 1.找最大值 2.找最小值 二分法一般有边界问题，如果是有序性的条件下的话只要记住一句话：有加必有减。 这里是示例代码： int mid = ......
Trends in Plant Science | 王向峰老师综述数据驱动的基因组设计育种
目录摘要将生物数据和知识转化为植物的精准设计育种机器学习（ML）在植物生物学中的应用案例研究：多组学数据关联研究（MODAS）中的数据降维（DR）亮点总结 今天简单回顾下中国农业大学王向峰教授团队2023年上半年发表在Trends in Plant Sicence的综述文章。该文阐释系统全面，值得赏 ......
由基因型-组织表达项目（GTEx）联想开去
近日，由丹麦奥胡斯大学、华南农业大学、中国农科院基因组所、美国农业部、马里兰大学、爱丁堡大学和等多家单位联合发起的猪基因型-组织表达计划（PigGTEx）取得阶段性进展，成功构建猪基因型-组织表达图谱，相关文章 “A compendium of genetic regulatory effects ......
机器学习应用于基因组预测，以苜蓿为例
目录目的示例代码表型文件预处理基因型文件预处理机器学习建模预测绘图其他结果 利用代码复现一个机器学习应用于基因组预测的项目，张志武老师于2023年发表在《园艺研究》上的一篇文章。 目的 使用 GWAS 和 GP 结合重测序数据和从世界各地收集的 220 份紫花苜蓿种质的秋季休眠（Fall dorma ......
Omics辅助育种统计方法：基因组遗传力
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节： Genomic heritability。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提取生物学意义。研究目标是利用高维度 ......
GS | Ben Hayes报告：基因型数据基础
本报告是Ben Hayes和Hans Daetwyler合著。 关于Ben Hayes，前文已经介绍。详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基 ......
GS | Ben Hayes的基因组选择课程
关于Ben Hayes详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基因组计划的发起者。在牲畜、作物、牧场和水产养殖物种的遗传改良方面拥有丰富的研究经 ......
GS | Julius报告：基因组预测的准确性
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
GS | Julius报告：利用基因组信息预测遗传变化
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
文心一言 VS 讯飞星火 VS chatgpt （175）-- 算法导论13.3 4题
四、用go语言，Teach 教授担心 RB-INSERT-FIXUP可能将 T.nil.color 设为 RED，这时，当 z 为根时第1行的测试就不会让循环终止。通过讨论 RB-INSERT-FIXUP永远不会将 T.nil.color 设置为 RED，来说明这位教授的担心是没有必要的。 文心一言 ......
R语言用LOESS(局部加权回归)季节趋势分解（STL）进行时间序列异常检测
原文链接：http://tecdat.cn/?p=22632 原文出处：拓端数据部落公众号 这篇文章描述了一种对涉及季节性和趋势成分的时间序列的中点进行建模的方法。我们将对一种叫做STL的算法进行研究，STL是 "使用LOESS(局部加权回归)的季节-趋势分解 "的缩写，以及如何将其应用于异常检测。 ......
MCM_算法篇
from pixiv Cellular Automata 参考文章： 元胞自动机的实现与应用 这篇文章将CA的实现给出，具体实现细节可以看： Python 实现基于元胞自动机的生命游戏 澳洲变燠洲，考拉成烤拉！澳大利亚山火为什么难以控制？ ......
day13 代码随想录算法训练营 347. 前 K 个高频元素 【待梳理】
题目：347. 前 K 个高频元素 我的感悟： 我用hash再排序。 卡尔用的小顶堆。 `heapq`是Python中的一个模块，它提供了堆队列（也称优先队列或者堆）的算法实现。在计算机科学中，堆是一种特殊的完全二叉树数据结构，其中每个父节点的值都小于或等于其子节点的值（在最小堆中）或者父节点的值都 ......
day13 代码随想录算法训练营 239. 滑动窗口最大值
题目：239. 滑动窗口最大值 我的感悟： 来难度了，有点意思， 理解难点： 需要实现自定义队列， 看了国外的解题思路和其他的回答，感觉还是卡尔的思路，更有意思。 实现队列： pop只弹出左边边界且左边界为最大值的时候 push 要维护队列里的大到小的单调性。把队尾小的都卷走 front查询最大值 ......
算法期末复习笔记
分治 基本概念 基本思想 将原始问题分解为若干子问题 逐个解决各个子问题 得到原始问题的解 情况分类 原始问题的解在分解出的子问题中 原始问题的解需要各个子问题的解再经过综合处理得到 如果分解出的子问题和原始问题类型相同，就可以用递归的方法做了 算法示例 查找最大值最小值 O(logn) 二分搜索 ......
KMP 算法
Question: Given two strings needle and haystack, return the index of the first occurrence of needle in haystack, or -1 if needle is not part of haysta ......
计算器算法
目录思路最简单的计算器（好像也不简单，因为有*/）224772 困难计算器 可以通解224 227 和上面的题 先把力扣上5道计算器的题目干了，主要使用双栈法 思路 用一个栈ops存操作，用一个栈nums存数字 然后从前往后做，对遍历到的字符做分情况讨论： 空格 : 跳过 ( : 直接加入 ops ......
mysql底层join算法
暴力 Nested-Loop Join 走索引的 index-Nested-Loop Join 缓冲块的 blocked-Nested-Loop Join mysql join 底层实现_mysql join实现算法-CSDN博客 走index loop join ，说明如果联表走主键，就算条件不走 ......
模型类序列化器
1 原来用的Serilizer跟表模型没有直接联系， 模型类序列化器ModelSerilizer，跟表模型有对应关系 2 使用 class BookModelSerializer(serializers.ModelSerializer): class Meta: model=表模型 # 跟哪个表模型 ......
【算法】【线性表】【链表】链表求和
1 题目 给定两个用链表表示的整数，每个节点包含一个数位。 这些数位是反向存放的，也就是个位排在链表首部。 编写函数对这两个整数求和，并用链表形式返回结果。 示例： 输入：(7 -> 1 -> 6) + (5 -> 9 -> 2)，即617 + 295 输出：2 -> 1 -> 9，即912 进阶： ......
Python用 tslearn 进行时间序列聚类可视化
全文链接：https://tecdat.cn/?p=33484 原文出处：拓端数据部落公众号 我们最近在完成一些时间序列聚类任务，偶然发现了 tslearn 库。我很想看看启动和运行 tslearn 已内置的聚类有多简单，结果发现非常简单直接。 首先，让我们导入我们需要的库： import pand ......
【C#】[Serializable]的作用 序列化--01
定义：序列化 (Serialization)将对象的状态信息转换为可以存储或传输的形式的过程。在序列化期间，对象将其当前状态写入到临时或持久性存储区。以后，可以通过从存储区中读取或反序列化对象的状态，重新创建该对象（百度百科） 序列化的目的：1、以某种存储形式使自定义对象持久化；2、将对象从一个地方 ......
代码随想录算法训练营第二十七天 | 39. 组合总和，40.组合总和II，131.分割回文串
一、39. 组合总和 题目链接： LeetCode 39. 组合总和 学习前： 思路： 无 学习后： 思路： 需要额外定义的成员变量： private List<List<Integer>> res; private List<Integer> list; 调用函数： List<List<Integ ......
Python中关于对象序列化实现和原理
pickle模块可以实现任意的Python对象转换为一系列字节(即序列化对象)的算法。这些字节流可以被传输或存储，接着也可以重构为—个和原先对象具有相同特征的新对象。 注意： pickle的文档清晰的表明它不提供安全保证。实际上，反序列化后可以执行任意代码，所以慎用 pickle来作为内部进程通信或 ......