算法 源码 编码java
PacBio长读纠错算法主要包括以下几种：
PacBio长读纠错算法主要包括以下几种： 1. LoRDEC：该算法使用短读序列对长读进行纠错，通过比对短读到长读上，利用短读的高质量信息对长读中的错误进行校正[10]。 2. Proovread：Proovread算法通过比对短读到长读上，利用短读的高质量信息对长读中的错误进行校正，同时还利用长 ......
以下是几种常见的PacBio长读纠错算法分类
PacBio长读纠错算法可以根据不同的方法和策略进行分类。根据已有研究文献的描述，以下是几种常见的PacBio长读纠错算法分类： 1. 基于短读段的纠错算法：这类算法将同物种的短读段比对到长读段上，并利用能够比对上的、且错误率低的短读段来进行错误纠正[5]。 2. 基于短读段组装的纠错算法：这类算法 ......
Java，反射创建对象的两种方式
Spring源码研读过程中，beanInstance = this.doCreateBean(beanName, mbdToUse, args);方法中创建bean对象中用到了反射实例化对象，特此记录一下。。 ......
关于密码哈希算法BCrypt的编码结果各部分意义分析及其他注意事项
找到一个英文的解析: The bcrypt standard makes storing salts easy - everything it needs to check a password is stored in the output string. The prefix "$2a$" or ......
在只基于长读段的算法中，通过将长读段比对到由这些长读段自己构建的de Bruijn图上，采用何种策略进行错误纠错？
基于长读段的算法可以通过将长读段比对到由这些长读段自己构建的de Bruijn图上来进行错误纠错。在这种算法中，可以采用以下策略进行错误纠错： 1. 比对路径评判：通过比对长读段到de Bruijn图上的路径，可以得到多条比对路径。为了找到正确的比对路径用于纠错，可以采取两种规则来评判比对路径的可信 ......
进程调度算法--引阿秀学习笔记
1.先来先服务 First-come First-serverd（FCFS） 按照请求顺序进行调度，利于长作业，不利短作业，短作业等待前面长作业执行完毕才可执行，造成短作业等待时间长。 2.短作业优先 shortest job first（SJF） 按估计运行时间最短的作业顺序进行调度，长作业可能会 ......
基于短读段的算法中de Bruijn图在错误纠正中的应用
## 基于短读段的算法中de Bruijn图在错误纠正中的应用 在基于短读段的组装和纠错方法中，de Bruijn图被广泛应用于错误纠正过程中[1]。de Bruijn图是一种基于k-mer的图结构，通过将短读段分割成等长的k-mer序列，将每个k-mer作为图中的节点，将相邻k-mer之间的连接关 ......
基于短读段的算法在将短读段比对到长读段上并进行错误纠正时，主要采用以下几种方法
基于短读段的算法在将短读段比对到长读段上并进行错误纠正时，主要采用以下几种方法： 1. 比对和纠错：将同一物种的短读段比对到长读段上，并利用能够比对上的、且错误率低的短读段来进行错误纠正[6]。这种方法通过比对短读段和长读段之间的相似性，识别出长读段中的错误位置，并进行错误纠正。 2. 组装和纠错： ......
长读段纠错算法综述
长读段纠错算法综述 长读段纠错算法主要分为三种类型[6]： 基于短读段的算法：将同一物种的短读段比对到长读段上，并利用能够比对上且错误率低的短读段进行错误纠正。 基于短读段组装的算法：将长读段比对到同一物种的短读段组装后的de Bruijn图上，以此进行错误纠正。 只基于长读段的算法：采用不同策略， ......
Java第十七课_IO流和线程
1.IO流 序列化 public class Practice01 { public static void main(String[] args) throws IOException, ClassNotFoundException { // 一个数据 用变量 // 多个同类型数据 用数组 // ......
docker-compose 快速运行java程序
1、任意目录新建docker-compose.yml touch docker-compose.yml mdkir config touch config/application.yml 2、复制jar文件到docker-compose.yml所在目录 cp 3、修改docker-compose.y ......
Spring提供的实用纯Java工具类合集
在Spring Framework里的spring-core核心包里面，有个org.springframework.util里面有不少非常实用的工具类。 该工具包里面的工具类虽然是被定义在Spring下面的，但是由于Spring框架目前几乎成了JavaEE实际的标准了，因此我们直接使用也是无妨的，很 ......
【算法】【线性表】Trapping Rain Water（接水量）
1 题目 Given n non-negative integers representing an elevation map where the width of each bar is 1, compute how much water it can trap after raining. I ......
【算法】【思想】做算法题中的一些思想总结
1 小技巧 // 数字 char 怎么得到它的 int char c = '5'; int num = c - '0' + 1; 2 思想 2.1 给定数的下一个接近的数 比如 241532 的下一个数 242135，主要是思想，从右往左找到第一个出现降序的，找到 15，然后从右边找到第一个比 1 ......
算法学习Day13单调队列和优先级队列
Day13单调队列和优先级队列 By HQWQF 2023/12/25 笔记 239.滑动窗口最大值 给定一个数组 nums，有一个大小为 k 的滑动窗口从数组的最左侧移动到数组的最右侧。你只可以看到在滑动窗口内的 k 个数字。滑动窗口每次只向右移动一位。 返回滑动窗口中的最大值。 进阶： 你能在线 ......
Go常见限流算法代码
计数器法：https://gitee.com/lymgoforIT/golang-trick/tree/master/08-count-limit-rate令牌桶算法：https://gitee.com/lymgoforIT/golang-trick/tree/master/09-token-buc ......
Java基本结构
Java基本结构 1.顺序结构 Java的基本结构就是顺序结构，除非特别指明，否则代码就是一行一行执行。 2.选择结构 if选择结构 switch选择结构 package com.wenxuan.structure; public class D1Switch { public static v ......
代码随想录算法训练营第二天 | 239. 滑动窗口最大值，347.前 K 个高频元素
一、239. 滑动窗口最大值 题目链接： LeetCode 239. 滑动窗口最大值 学习前： 思路： 无 学习后： 自定义双端队列，实现push、pop、peek方法，使得队列单调非增。peek方法不变；当入队时，若当前元素比队尾元素大，则pop队尾，直到队列为空或当前元素不大于队尾元素；当出队时 ......
Java并发(二十一)----wait notify介绍
1、小故事 - 为什么需要 wait 由于条件不满足（没烟干不了活啊，等小M把烟送过来），小南不能继续进行计算 但小南如果一直占用着锁，其它人就得一直阻塞，效率太低 于是老王单开了一间休息室（调用 wait 方法），让小南到休息室（WaitSet）等着去了，但这时锁释放开，其它人可以由老王随机安排进 ......
Java基础知识总结
Java 是一门面向对象的编程语言，由 Sun Microsystems 公司于 1995 年推出。Java 语言具有以下特点： 面向对象：Java 语言采用面向对象的编程思想，使用类和对象来描述软件。 跨平台：Java 语言的程序可以运行在任何支持 Java 虚拟机 (JVM) 的平台上。 安 ......
Bellman-Ford Algorithm 算法
一、处理问题：负权值有向图单原点最短路径问题 二、算法描述： 假设带权值有向图中没有包含负权值环。 定义一个距离数组，dist[0...n-1]，dis[i]表示从原点到i的最短路径值 初始化数组，假设一开始在原点src出发，终点为dst，那么dist[src] = 0 遍历所有的有向边，当前遍历边 ......
java与算法基础（二） 二分查找
二分查找基本算法 用于查找已排列数组，且一般没有重复数 左闭右开 查找区间为 [ Left , Right ) ,比较Left和Right中间的那个数和Target的。如果中间数大于target,将Left设为Middle-1;如果中间数小于target,将Right设为Middle。 class ......
Java技术得这样进阶，天天CRUD就完蛋了
Java天天CRUD，技术没提高怎么办？技术进阶得这么搞，才能进阶为高级开发和架构师！
资料地址：自学精灵 - IT技术星球（也可以百度搜：自学精灵）。
首先点明，只写业务代码是无法成长技术的。提升技术的两个方法是：
有技术大佬带
有技术大佬的资料
本文介绍靠谱的技术进阶资料，让你比其他人更有... ......
java 17 原生操作 mysql 5.7
环境： JDK: 17 mysql: 5.7 和数据库打交道，在项目开发中是在所难免的。今天简单学习下在 java 中 原生操作 MySQL，demo通过 maven做依赖管理。 依赖 在新建 maven 项目后，加入依赖： <dependencies> <dependency> <groupId> ......
启动springboot的测试类，报红：Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM warning: Sharing is only supported for boot loader classes because bootstrap classpath has been appended
启动springboot的测试类时， 报红：Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM warning: Sharing is only supported for boot loader classes because bootstrap classpath has bee ......
解析RC4加密算法
一、简介 RC4（Rivest Cipher 4）是一种对称加密算法，由Ronald L. Rivest于1987年为其所在的公司RSA Data Security Inc. 开发。作为一种可变密钥长度的序列密码，RC4在加密和解密过程中表现出高效、简洁的特点，被广泛应用于各种网络安全和数据保护场景 ......
记录两种需要秘钥的加密算法
AES和RSA都是公认为安全的加密算法，在秘钥没有泄露的情况下，几乎不可能被破译（密钥的管理至关重要）。 /** * 对称加密 * * @throws Exception */ public static void AES() throws Exception { KeyGenerator keyG ......
十七，JAVA IO 线程
字符流:每次读写一个字符,只能操作文本文 Reader :InputStreamReader 是字节流通向字符流的桥梁 Writer :OutputStreamWriter 是字符流通向字节流的桥梁 便捷流 : FileReader FileWriter FileReader fileReader ......
深度剖析 Spring 框架在 Java 应用开发中的优势与应用
Spring 是用于企业 Java 应用程序开发的最流行的应用程序开发框架。全球数百万开发人员使用 Spring Framework 创建高性能、易于测试和可重用的代码。Spring Framework 是一个开源的 Java 平台。它最初由 Rod Johnson 编写，并于 2003 年 6 月 ......