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LocPatcH An efficient long-read hybrid error correction algorithm based on local pHMM
该文档主要介绍了一种基于装配的方法和概率隐藏马尔科夫模型 (pHMM) 用于纠正长读序列的错误。文档详细描述了对酵母数据进行实验的结果、纠正方法的拓扑结构以及实验设置和数据集。 这种基于装配的纠正方法相对于直接纠正存在哪些优势？ pHMM 的拓扑结构是怎样的？ 在实验中使用了什么样的数据集？ 提示： ......
long-read error correction algorithms”
“long-read error correction algorithms”是指用于纠正长读长测序数据中错误的算法。长读长测序技术能够产生更长的DNA或RNA序列，但也容易受到测序过程中的错误影响。这些算法通过分析测序数据中的错误模式和参考序列信息，识别和纠正错误，从而提高长读长测序数据的准确性和 ......
A Long read hybrid error correction algorithm based on segmented pHMM 基于pHMM的DNA序列分析与错误修正方法研究
基于pHMM的DNA序列分析与错误修正方法研究 这篇论文主要内容是关于DNA序列分析中的错误纠正方法。论文提出了一种基于概率隐马尔可夫模型(pHMM)的错误纠正方法。首先，通过SR-LR对齐和基于短读序列对齐的预处理步骤，对DNA序列进行处理。然后，利用pHMM构建了一个隐藏的马尔可夫模型，并进行前 ......
NOI Linux Sublime Text 使用指南
感觉 noi linux 的vscode还是太鸡肋，所以用了用subline，莫名好用 下面是食用指难。 首先打开，不好看，我们可以点击这里更改相应主题 然后我们要点 file 打开文件夹 打开/关闭侧边栏的快捷键是 Ctrl+K+B (K和B同时按) 然后sublime不能输入，直接用文件输入输出 ......
React 项目启动在 chrome 上报错 之 Uncaught TypeError: Cannot read property ‘forEach‘ of undefined
chrome上报错如下： 原因：安装React Developer Tools导致的，关闭这个插件就行 ......
记录一次openpyx使用rich_text报错AttributeError: 'TextBlock' object has no attribute 'name'
先说解决办法： pip install lxml 报错截图： 当时在两个环境中分别使用相同版本openpyxl，相同的代码，一个环境中能成功，另外一个一直报错。 排查结果如下： 根据报错找到文件： File "\openpyxl\worksheet_writer.py", line 147, in ......
ABAP 用户登录统计信息
CMOD 出口 SUSR0001 *& * *& 包含 ZXUSRU01 *& * DATA LS_ZUSERLOGINFO TYPE ZUSERLOGINFO. DATA LS_ZUSERLOGINFO_TMP TYPE ZUSERLOGINFO. DATA LT_ZUSERLOGINFO TYP ......
从Newtonsoft.Json迁移到 System.Text.Json不简单
一.写在前面# System.Text.Json 是 .NET Core 3 及以上版本内置的 Json 序列化组件，刚推出的时候经常看到踩各种坑的吐槽，现在经过几个版本的迭代优化，提升了易用性，修复了各种问题，是时候考虑使用 System.Text.Json 了。本文将从使用层面来进行对比。 Sy ......
c# - 如何在自定义 System.Text.Json JsonConverter 中使用默认序列化？
我正在写一个 custom System.Text.Json.JsonConverter 将旧数据模型升级到新版本。我已覆盖 Read()并实现了必要的后处理。但是，我根本不需要在 Write() 中做任何自定义操作。方法。如果我根本没有转换器，如何自动生成默认序列化？显然我可以使用不同的 Json ......
.net C# System.Text.Json 如何将 string类型的“true”转换为布尔值 解决方案
直接上解决方法的代码 先定义一个转换顺，代码如下： public sealed class AnhBoolConverter : JsonConverter<bool?> { public override bool? Read(ref Utf8JsonReader reader, Type typ ......
ABAP zmassdownload 批量下载程序
代码来源 https://github.com/palermo-consulting/sap-mass-abap-download-program/blob/master/Z_MASS_ABAP_DOWNLOAD.abap 中文乱码 切换charset=GB2312 APPEND '<meta ht ......
How to Read a Paper
paper.dvi http://ccr.sigcomm.org/online/files/p83-keshavA.pdf https://jyywiki.cn/ISER/2023/1-intro/index.html https://jyywiki.cn/ISER/2023/1-intro/ind ......
MySQL中TEXT和BLOB区别
在MySQL数据库中，TEXT 和 BLOB 是用于存储字符串数据的两种不同的数据类型。它们都可以存储大量的数据，但是主要区别在于它们的存储和检索方式以及如何处理数据。 1. TEXT 类型 TEXT 是用于存储非二进制字符串的数据类型。 它是用来存储可变长度的字符串，适合存储大量的文本数据。 TE ......
java.io.FileInputStream#read(byte[]) 阻塞导致没办法继续执行的问题处理
在对设备节点进行操作的时候，发现读的时候进入阻塞状态（可能是设备节点异常），导致没办法继续执行后面的代码 查看了一下，文件的方式读，是没办法配置超时的自动报异常的 设计了一段代码，针对读阻塞做异常处理 public static String sendCmdToFile(String fromFil ......
MySQL server is running with the --super-read-only option的解决办法
原因 数据库是只读模式 解决办法 修改为读写模式 mysql -uroot -p你的密码 进入mysql select @@read_only; set global read_only=0; # 顺便设置可远程连接（不需要可跳到flush privileges） use mysql; update ......
JavaScript中val()、html()、text()区别
区别 在前端开发中，val()、html()、text()三个方法都是用来获取或设置元素的内容。它们的区别在于： val() 方法用于获取或设置表单元素的 value 属性的值。 html() 方法用于获取或设置元素的 HTML 内容，包括标签和文本。 text() 方法用于获取或设置元素的纯文本内 ......
pwn知识——ret2text进阶
stack smash 造成原因 当进行栈溢出时，触发了__stack_chk_fail，从而拦截了该栈溢出，使程序崩溃 利用原理 我们首先了解一下__stack_chk_fail函数的构成 发现调用了__fortify_fail函数，那我们再看下这个函数 发现有两个参数，一个是msg(信息，也就是 ......
如何在谷歌 Google Chrome 浏览器禁用掉右键菜单中的【使用朗读模式 Reading Mode 打开】
如图1： 如图2（需要重启 Chrome）： 谢谢浏览！ ......
ABAP存取Excel的技术思考
ABAP存取Excel有OLE,DOI,XML好几种技术啊，试了好多次，发现前两者总是出很多bug，决心以后只用基于Open XML技术的API和函数了。 类CL_FDT_XL_SPREADSHEET基于XML技术实现，示例代码如下；当然，SAP官方是不推荐单独使用这个类的，只限制用于BRF+相关功 ......
ssh远程到目标主机报错：ssh_exchange_identification: read: Connection reset by peer 问题的处理
问题描述 通过ssh连接到目标主机，报错如下: #ssh 10.192.121.202 ssh_exchange_identification: read: Connection reset by peer 问题分析 通过报错的信息可以看到，连接是被目标的主机给断了。 问题解决 在网上找了一些解决的 ......
《CLIP：Connecting text and images》论文学习
一、Abstract 尽管深度学习已经彻底改革了计算机视觉领域，但当前的深度学习视觉方案方法存在几个主要问题： 高质量的视觉数据集，制作过程耗时且成本高昂，同时只包含了有限范围的视觉概念 标准的深度学习视觉模型（例如ImageNet、ResNet）擅长完成单一任务，且只能完成一个任务，需要投入巨大的 ......
HTTP事件流 text/event-stream
GitHub All-in-one OpenAI Demo 一、依赖 <dependency> <groupId>org.asynchttpclient</groupId> <artifactId>async-http-client</artifactId> <version>2.12.3</ver ......
HTTP事件流 text/event-stream
GitHub All-in-one OpenAI Demo 一、依赖 <dependency> <groupId>org.asynchttpclient</groupId> <artifactId>async-http-client</artifactId> <version>2.12.3</ver ......
boost beast http::read 一直阻塞不返回,问题解决, 使用parser对象的skip(true) 来解决
用beast 作为客户端发送http请求后读web服务端返回的数据，遇到了http::read 或http::async_read一直阻塞着，不返回，直到连接过期后被强制网络断开后read函数才返回。 看了官方文档，文档里这么描述的，read要一直等到end_of_stream时才回退出阻塞状态。也 ......
2024年 为什么不建议新人学习ABAP
引言 每个应届生都希望自己有良好的职业发展，当他们发现前路难通时，便会寻找更好的出路。 “转码”曾经是个很火热的话题。在互联网行业高速发展的年代，转行学代码，入职大厂，升职加薪，是许多人的可以成真的梦想。而现在，行业进入平台期，不少人也开始迷茫，现在转码还值不值？ 这样重要的人生选择题，我无法替他人 ......
unity text mesh pro 缺字
解决方案 把图集大小从1024改成2048，因为汉字太多了，1024的图集本来就装不下导致的部分缺字 做字体的我们先根据原始字体创建一个 Font Asset 这个为静态，复制一个做动态，修改动态的图集大小 ......
电脑时间不同步导致的上网报错：core/proxy/vmess/encoding: failed to read response header > websocket: close 1006 (abnormal closure): unexpected EOF
报错内容： 2023/12/16 14:08:56 [Warning] [775541588] xxxxx.com/core/app/proxyman/outbound: failed to process outbound traffic > xxxxx.com/core/proxy/vmess/ ......
基因组序列比对（read alignment）
基因组序列比对（read alignment）技术，是将测序得到的read与已有的参考基因组进行比对，找到read与参考基因组匹配的对应位置，继而得到序列比对的详细结果。 由于参考基因组碱基数极多，测序得到的read数据量极大，且测序的DNA序列中存在各种碱基变异和测序错误，因此不能直接将read与 ......
device descriptor read/64, error -11
硬件平台：CM4 8G RAM核心板 Hardware : BCM2711 Revision : d03141 Serial : 100000002297c853 Model : Raspberry Pi Compute Module 4 Rev 1.1 系统：树莓派32位OS 问题背景：核心板是8 ......