blast
2-基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast
下面讲如何在windows系统上用blast做基因家族的鉴定： 1，下载 在NCBI网站上下载blast工具“https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download” 点击进入ftp ......
SP4082 MBLAST - BLAST 题解
几万年前做的 dp 题了，有亿点点水 题意简述 求一个字符串添加多少个空格距离最小 解法 求距离最小，可以考虑动规，其实这题的写法和最长公共子序列的写法类似。 我们设 \(f(i,j)\) 表示 \(a[1] \sim a[i]\) 和 \(b[1] \sim b[j]\) 的距离 不加空格的时候为 ......
blast只保留一个最优结果
使用blast比对时，只保留一个最优结果 代码： blastn -db nt.blast.db -query seq.fa -out blast.nt.result -evalue 1e-5 -outfmt 6 -num_threads 30 -max_hsps 1 -num_alignments ......
blast 流程记录
##### 1. 对小鼠的蛋白序列进行建库 点击查看代码 ``` makeblastdb -in Mus_musculus.GRCm39.pep.all.fa -dbtype prot -parse_seqids -out ./mm.blast.db/index ``` ##### 2. 将自己的物 ......
blast软件比对库nr、nt、swissprot库的下载
001、 002、 003、 004、 005、 006、 007、 链接：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/ 。 ......
linux 中blast序列比对
001、对数据库构建索引 makeblastdb -in protein.faa -dbtype prot -parse_seqids -out database_name -logfile log makeblastdb：构建索引的软件 -in protein.faa： 要构建索引的数据库（这里是 ......
linux 中blast软件的安装
001、进入ncbi官网 002、点击blast 0 003、点击download blast 004、点击如下链接： 005、点击下载linux 64位： 下载链接：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 006、 ......