snpeff

使用snpeff软件构建本地注释库

001、软件下载 官网: 解压即可 002、java环境 003、构建注释库,需要参考基因组xxx.fa和基因组注释文件xxx.gff 004、构建结果 参考: 01、 02、 ......
注释 snpeff 软件

利用snpEff对基因型VCF文件进行变异注释的详细方法

利用snpEff对VCF文件进行变异注释 群体遗传研究中,在获得SNP位点后,我们需要对SNP位点进行注释,对这些SNP位点进行更深的了解。 snpEff是一个用于对基因组单核苷酸多态性(SNP)进行注释的软件,snpEff软件可以用于对VCF文件进行变异注释,使用时需要先进行安装,然后构建参考基因 ......
变异 注释 基因 文件 方法
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