算法 常用
PacBio长读纠错算法主要包括以下几种:
PacBio长读纠错算法主要包括以下几种: 1. LoRDEC:该算法使用短读序列对长读进行纠错,通过比对短读到长读上,利用短读的高质量信息对长读中的错误进行校正[10]。 2. Proovread:Proovread算法通过比对短读到长读上,利用短读的高质量信息对长读中的错误进行校正,同时还利用长 ......
以下是几种常见的PacBio长读纠错算法分类
PacBio长读纠错算法可以根据不同的方法和策略进行分类。根据已有研究文献的描述,以下是几种常见的PacBio长读纠错算法分类: 1. 基于短读段的纠错算法:这类算法将同物种的短读段比对到长读段上,并利用能够比对上的、且错误率低的短读段来进行错误纠正[5]。 2. 基于短读段组装的纠错算法:这类算法 ......
Ubuntu 命令常用命令-汇总(更新)[转]
记录日常使用的命令 1、关机、重启 关机 sudo shutdown -h 18:00 18点关机 sudo shutdown -r now 立即重启 sudo shutdown -h now 立即关机 重启 reboot 2、pid查看/监控 使用top或者htop进行监控,个人偏向与htop,更 ......
关于密码哈希算法BCrypt的编码结果各部分意义分析及其他注意事项
找到一个英文的解析: The bcrypt standard makes storing salts easy - everything it needs to check a password is stored in the output string. The prefix "$2a$" or ......
在只基于长读段的算法中,通过将长读段比对到由这些长读段自己构建的de Bruijn图上,采用何种策略进行错误纠错?
基于长读段的算法可以通过将长读段比对到由这些长读段自己构建的de Bruijn图上来进行错误纠错。在这种算法中,可以采用以下策略进行错误纠错: 1. 比对路径评判:通过比对长读段到de Bruijn图上的路径,可以得到多条比对路径。为了找到正确的比对路径用于纠错,可以采取两种规则来评判比对路径的可信 ......
进程调度算法--引阿秀学习笔记
1.先来先服务 First-come First-serverd(FCFS) 按照请求顺序进行调度,利于长作业,不利短作业,短作业等待前面长作业执行完毕才可执行,造成短作业等待时间长。 2.短作业优先 shortest job first(SJF) 按估计运行时间最短的作业顺序进行调度,长作业可能会 ......
基于短读段的算法中de Bruijn图在错误纠正中的应用
## 基于短读段的算法中de Bruijn图在错误纠正中的应用 在基于短读段的组装和纠错方法中,de Bruijn图被广泛应用于错误纠正过程中[1]。de Bruijn图是一种基于k-mer的图结构,通过将短读段分割成等长的k-mer序列,将每个k-mer作为图中的节点,将相邻k-mer之间的连接关 ......
基于短读段的算法在将短读段比对到长读段上并进行错误纠正时,主要采用以下几种方法
基于短读段的算法在将短读段比对到长读段上并进行错误纠正时,主要采用以下几种方法: 1. 比对和纠错:将同一物种的短读段比对到长读段上,并利用能够比对上的、且错误率低的短读段来进行错误纠正[6]。这种方法通过比对短读段和长读段之间的相似性,识别出长读段中的错误位置,并进行错误纠正。 2. 组装和纠错: ......
长读段纠错算法综述
长读段纠错算法综述 长读段纠错算法主要分为三种类型[6]: 基于短读段的算法:将同一物种的短读段比对到长读段上,并利用能够比对上且错误率低的短读段进行错误纠正。 基于短读段组装的算法:将长读段比对到同一物种的短读段组装后的de Bruijn图上,以此进行错误纠正。 只基于长读段的算法:采用不同策略, ......
【算法】【线性表】Trapping Rain Water(接水量)
1 题目 Given n non-negative integers representing an elevation map where the width of each bar is 1, compute how much water it can trap after raining. I ......
【算法】【思想】做算法题中的一些思想总结
1 小技巧 // 数字 char 怎么得到它的 int char c = '5'; int num = c - '0' + 1; 2 思想 2.1 给定数的下一个接近的数 比如 241532 的下一个数 242135,主要是思想,从右往左找到第一个出现降序的,找到 15,然后从右边找到第一个比 1 ......
算法学习Day13单调队列和优先级队列
Day13单调队列和优先级队列 By HQWQF 2023/12/25 笔记 239.滑动窗口最大值 给定一个数组 nums,有一个大小为 k 的滑动窗口从数组的最左侧移动到数组的最右侧。你只可以看到在滑动窗口内的 k 个数字。滑动窗口每次只向右移动一位。 返回滑动窗口中的最大值。 进阶: 你能在线 ......
Go常见限流算法代码
计数器法:https://gitee.com/lymgoforIT/golang-trick/tree/master/08-count-limit-rate令牌桶算法:https://gitee.com/lymgoforIT/golang-trick/tree/master/09-token-buc ......
代码随想录算法训练营第二天 | 239. 滑动窗口最大值,347.前 K 个高频元素
一、239. 滑动窗口最大值 题目链接: LeetCode 239. 滑动窗口最大值 学习前: 思路: 无 学习后: 自定义双端队列,实现push、pop、peek方法,使得队列单调非增。peek方法不变;当入队时,若当前元素比队尾元素大,则pop队尾,直到队列为空或当前元素不大于队尾元素;当出队时 ......
Android 常用注解一览
注解的使用有助于减少样板代码的编写,并提供了一种声明性的方法来描述代码的意图和行为。可以用于实现依赖注入,数据库映射、运行时权限处理等功能。 ......
Docker常用基础命令
Docker常用命令 常规帮助启动类命令 启|停|重启|状态|开机自启命令 systemctl start|stop|restart|status|enable docker 查看docker概要信息 docker info 查看docker总体帮助文档 docker --help 查看docker ......
pikafish引擎常用选项指令
设置日志文件 setoption name Debug Log File value E:\刘永富\皮卡鱼230218\log.txt 设置线程数 1-1024 默认1setoption name Threads value 2 设置哈希值 默认16setoption name Hash value ......
Bellman-Ford Algorithm 算法
一、处理问题:负权值有向图单原点最短路径问题 二、算法描述: 假设带权值有向图中没有包含负权值环。 定义一个距离数组,dist[0...n-1],dis[i]表示从原点到i的最短路径值 初始化数组,假设一开始在原点src出发,终点为dst,那么dist[src] = 0 遍历所有的有向边,当前遍历边 ......
java与算法基础(二) 二分查找
二分查找基本算法 用于查找已排列数组,且一般没有重复数 左闭右开 查找区间为 [ Left , Right ) ,比较Left和Right中间的那个数和Target的。如果中间数大于target,将Left设为Middle-1;如果中间数小于target,将Right设为Middle。 class ......
解析RC4加密算法
一、简介 RC4(Rivest Cipher 4)是一种对称加密算法,由Ronald L. Rivest于1987年为其所在的公司RSA Data Security Inc. 开发。作为一种可变密钥长度的序列密码,RC4在加密和解密过程中表现出高效、简洁的特点,被广泛应用于各种网络安全和数据保护场景 ......
记录两种需要秘钥的加密算法
AES和RSA都是公认为安全的加密算法,在秘钥没有泄露的情况下,几乎不可能被破译(密钥的管理至关重要)。 /** * 对称加密 * * @throws Exception */ public static void AES() throws Exception { KeyGenerator keyG ......
EasyCVR无人机推流+人数统计AI算法,助力公共场所人群密度管控
在公园、体育场馆、景区等公共场所,区域人数统计AI算法发挥着重要的作用。通过实时监控各个区域的人数密度,管理人员可以及时采取措施,如分流、限流等,有效防范人员拥挤、踩踏等安全事故的发生。 ......
docker常用命令
以下是一些常用的 Docker 命令,以帮助您管理 Docker 容器和镜像: 容器生命周期管理: 启动容器:docker start <容器ID或名称> 停止容器:docker stop <容器ID或名称> 重启容器:docker restart <容器ID或名称> 进入容器:docker exe ......
tmux的各种常用命令
1.创建tmux tmux new -s <sessions的名字> 效果:创建了一个session,里面初始时自带一个session 2.查看session列表 tmux ls 效果:系统将会列出所有正在运行的session 3.进入对应的session tmux attach -t <sessi ......
Qt 常用快捷键
F1 : 打开帮助 F2 : 跳到声明/定义 F4 : .cpp 和 .h 之间转换 F5 : 调试运行程序 F9 : 设置/取消断点 F10 : 单步调试 F11 : 进入函数调试 alt+ enter : 在类字段上点击,出现该字段所在的 include ; Ctrl + / :注释/取消注释行 ......
基于MIMO+16QAM系统的VBLAST译码算法matlab仿真
1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 matlab2022a 3.算法理论概述 基于MIMO+16QAM系统的VBLAST(Vertical Bell Laboratories Layered Space-Time)译码算法是一种用于提高无线通信系统性能的技术。 MIMO(多输入多输出)技术 ......
软件安全测试包含哪些测试内容?专业测试机构常用的测试方法有哪些?
编辑 软件测试的方法 软件安全测试是为了评估和验证软件系统中存在的潜在安全漏洞和风险而进行的一系列测试活动。它的目的是发现和修复软件系统中的漏洞,以确保系统的安全性和可靠性。 一、软件安全测试包含以下几个主要内容: 1. 静态代码分析:通过检查源代码或二进制文件来发现潜在的安全漏洞,如缓冲区 ......
羚通视频智能分析平台安防监控视频平台森林烟火识别明火算法检测预警
随着科技的不断发展,人工智能技术在各个领域都取得了显著的成果。在安防监控领域,羚通视频智能分析平台凭借其强大的功能和优越的性能,为森林防火工作提供了有力的技术支持。本文将详细介绍羚通视频智能分析平台的森林烟火识别明火算法检测预警功能,以及如何利用这一技术手段保护我们的绿色家园。 一、羚通视频智能分析 ......
oracle常用命令
--1、查看数据文件表结构SELECT * FROM V$DATAFILE; --2、查看分区信息表结构SELECT * FROM dba_extents WHERE ROWNUM <10; --3、查看对象物理存储空间表结构SELECT * FROM DBA_SEGMENTS WHERE SEGM ......