AlphaFold2

alphafold2安装

有两种安装方式,官网提供的是docker版本,这里就以官网安装教程为主。 硬件:CPU:i9-13900k GPU:RTX 4090 内存:64G 硬盘:16T 系统&环境:Ubuntu 22.04.3 LTS,【gcc,g++,gfortran】10.5.0,CUDA 11.2,cmake 3.2 ......
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AlphaFold2无痛安装教程(超级详细)

介绍 AlphaFlod2作为最近在生物领域非常的火的AI,给生物医药领域带来了划时代的影响,许多研究者都开始尝试使用AlphaFold2介入各自的工作。 但是由于AlphaFold2涉及到了很多模块和细节,在我安装过很多次之后(踩过很多坑之后),希望通过这篇文章让大家能够无痛的安装和使用Alpha ......
AlphaFold2 AlphaFold 教程

AlphaFold2中的残基刚体表示

本文主要通过MindSpore复现了一个AlphaFold2文章中的算法21,该算法可以用于将蛋白质构象中的每一个氨基酸转化成一个归一化的空间三角形表示,更方便用于深度学习模型中的参数优化。有了这样一个抽象的模型,再定义一系列的梯度优化和损失函数,就可以得到一个用于预测蛋白质构象的生成模型。 ......
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