sra
sra format SRA文件的格式
http://www.ebi.ac.uk/ena/about/sra_format Read metadata format Metadata is represented using XML documents. For detailed information about the metadat ......
根据sra号从ncbi下载标准fastq数据
001、ncbi官网 002、SRA Lite和SRA Normalized 的 区别： https://www.omicsclass.com/article/2178 如下图： sra.lite的磁盘占用小于标准sra的，以SRR3156163为例。 003、sra.lite 和 sra标准数据下 ......
linux 中 prefetch命令批量下载sra测序数据
001、 prefetch的安装 002、准备下载sra号的列表 003、设置下载存储目录 004、下载命令 。 参考： https://codeleading.com/article/83981102254/ ......
根据SRA号和参考基因组统计测序的X数
以SRR1770413 为例： 001、测序的碱基数目 测序碱基数目为：387.2M。 002、参考基因组的大小 a、下载参考基因组，并统计基因组的大小 [root@PC1 test01]# ls GCF_000005845.2_ASM584v2_genomic.fna.gz [root@PC1 t ......