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基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析 吕利王晓利张文娟韩芝侠 宝鸡文理学院电子电气工程学院 摘要：目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷，并提出改进措施，以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法，包括基于“校正后组装”策略的FA ......
Longley数据集——强共线性的宏观经济数据,包含GNP deflator(GNP平减指数)、GNP(国民生产总值)、Unemployed(失业率)、ArmedForces(武装力量)、Population(人口)、year(年份)，Emlpoyed(就业率)。LongLey数据集因存在严重的多重共线性问题，在早期经常用来检验各种算法或计算机的计算精度
Longley数据集来自J．W．Longley（1967）发表在JASA上的一篇论文，是强共线性的宏观经济数据,包含GNP deflator(GNP平减指数)、GNP(国民生产总值)、Unemployed(失业率)、ArmedForces(武装力量)、Population(人口)、year(年份)， ......
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要：随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现 何欣雨 北京交通大学 摘要：基因测序的意义是使人类从根本上认知疾病发生的原因,做到正确的治疗疾病、尽早的预防疾病。例如肿瘤和红斑狼疮等疾病都是和基因变异有关,如果能过通过测序技术知道变异点,对精准治疗,攻克难题有重大意义。第三代测序技术是Pac ......
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要：随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
针对第三代RNA测序长读段的比对算法研究
针对第三代RNA测序长读段的比对算法研究 李琪 桂林电子科技大学 摘要：随着第三代测序技术的日益成熟以及广泛应用,长序列比对成为正在兴起的研究领域。在转录组学研究中,将RNA长读段比对定位到参考基因组中,是对第三代RNA测序数据进行分析的关键一步,其准确性对差异基因表达、RNA编辑和融合基因的检测等 ......
强化学习：连续控制问题中Actor-Critic算法的linear baseline
最近在看连续控制问题，看到了一个Actor-Critic算法中手动扩展features和设置linear baseline的方法，这些方法源自论文：《Benchmarking Deep Reinforcement Learning for Continuous Control》。 对于低维的feat ......
【视频】支持向量机算法原理和Python用户流失数据挖掘SVM实例
全文链接：http://tecdat.cn/?p=32604 原文出处：拓端数据部落公众号 分析师：Bailey Zheng和Lijie Zhang 即使是同一种植物，由于生长的地理环境的不同，它们的特征会有所差异。例如鸢尾花，可分为山鸢尾、杂色鸢尾、维吉尼亚鸢尾。 假设此时您得到了一朵鸢尾花，如何 ......
SSTF算法
oj: https://codefun2000.com/p/P1269 学一个新东西 multiset 里面是排好序的 可以存重复的值 但是里面的值不能被修改 否则就不能排序了 可以用lower_bound(x)，得到multiset中大于等于x的最小的数的位置 auto ri = q.lower_ ......
算法学习day34贪心part03-1005、134、135
package LeetCode.greedypart03; /** * 1005. K 次取反后最大化的数组和 * 给你一个整数数组 nums 和一个整数 k ，按以下方法修改该数组： * 选择某个下标 i并将 nums[i] 替换为 -nums[i] 。 * 重复这个过程恰好 k 次。可以多次选 ......
算法学习day32贪心part02-122、55、45
package LeetCode.greedypart02; /** * 122. 买卖股票的最佳时机 II * 给你一个整数数组 prices ，其中prices[i] 表示某支股票第 i 天的价格。 * 在每一天，你可以决定是否购买和/或出售股票。 * 你在任何时候最多只能持有 一股 股票。你也 ......
算法刷题记录：[NOIP2000]计算器的改良（未AC）
###题目链接 https://ac.nowcoder.com/acm/contest/19306/1043 ###题目分析 模拟就完事，代码写的很屎山，估计哪里死循环了，要不就是TLE，明天改。 ###未AC代码 ```c++ #include #include #include using na ......
基于FPGA的LFSR16位伪随机数产生算法实现,可以配置不同的随机数种子和改生成多项式,包含testbench
1.算法仿真效果 vivado2019.2仿真结果如下： 2.算法涉及理论知识概要 LFSR（线性反馈移位寄存器）提供了一种在微控制器上快速生成非序列数字列表的简单方法。生成伪随机数只需要右移操作和 XOR 操作。LFSR 完全由其多项式指定。例如，6千-次多项式与每个项存在用方程 x 表示6+ x ......
2023.5.30——软件工程站立会议（阶段二）
站立会议内容： 1.整个项目预期的任务量： 目前已经花的时间： 剩余的时间： 2.任务看板照片： 3.团队照片： 4.产品状态： 最新做好的功能： 正在完成中 5.燃尽图： ......
文心一言 VS 讯飞星火 VS chatgpt （26）-- 算法导论5.1 1题
## 一、证明:假设在过程 HIRE-ASSISTANT 的第 4 行中，我们总能决定哪一个应聘者最佳。则意味着我们知道应聘者排名的全部次序。 ## 文心一言： 证明: 假设在过程 HIRE-ASSISTANT 的第 4 行中，我们总能决定哪一个应聘者最佳。则意味着我们知道应聘者排名的全部次序。 在 ......
springboot 雪花算法生成的发送到前端id精度丢失
添加注解： @JsonFormat(shape = JsonFormat.Shape.STRING) 用法： ......
算法刷题记录：[NOIP2017]图书管理员
###题目链接 https://ac.nowcoder.com/acm/contest/19306/1050 ###题目分析 因为要求最小编号，并且该编号是以读者的编号结尾，这边直接排序+翻转，找开头的数。 记录是因为看到某个大佬非常好的思路，直接对编号进行取模，就是末尾的数。 **如果想得到末尾的 ......
第五课 朴素贝叶斯算法
1、贝叶斯定理 大学时学习的《概率论与数理统计》，其中有一个很重要的公式是贝叶斯公式： 同理，将A、B的位置互换一下，上面的公式仍然成立，即： 通过P(AB)为桥梁，联立以上2个公式，可得到下式： 贝叶斯公式看起来非常简单，但它其实是一个非常伟大的思想，简单说，有些条件概率不容易或无法计算求出，比如 ......
算法刷题记录：译码
###题目链接 https://ac.nowcoder.com/acm/contest/19306/1046 ###解题思路： 10进制转x进制，只要反复`%x、/x`即可。 `%x`取出末尾的数字，因为末尾的数字已经取出，所以将该数字`\`掉 可以一起算也可以循环，**取模不会影响除数**。 ## ......
机器学习-KNN算法
##### 1. 算法原理（K-Nearest Neighbor） - 本质是通过距离判断两个样本是否相似，如果距离够近就认为他们足够相似属于同一类别 - 找到离其最近的 k 个样本，并将这些样本称之 为「**近邻**」(nearest neighbor)。 - 对这 k 个近邻，查看它们的都属于何 ......
MegEngine 使用小技巧：如何解读 MegCC 编译模型几个阶段 Pass 的作用
MegCC 是一个真真实实的深度学习模型编译器，具备极其轻量的 Runtime 二进制体积，高性能，方便移植，极低内存使用以及快启动等核心特点。用户可在 MLIR 上进行计算图优化，内存规划，最后通过预先写好的 code 模版进行代码生成。 ......
Elastic：倒排索引的两种压缩算法：FOR算法和RBM算法
位（bit）、字节(Byte)、MB(兆位)之间的换算关系在java基本数据类型中，一个int是4个字节，也就是32个比特位；一个short类型占用的是2个字节也就是16个字节 B是Byte的缩写，B就是Byte，也就是字节（Byte）；b是bit的缩写，b就是bit，也就是比特位（bit）。 B与 ......
IO调度算法的简单学习与整理
# IO调度算法的简单学习与整理 ## 前言 ``` 前几天整理了 /sys/block/sda/queue/nr_requests 以及 /sys/block/sda/device/queue_depth 的两个参数 # 没别的意思 我就是再背一遍,怕自己记性不好记不住. 其实队列数量和队列参数之 ......
hmac(md5,sha256) 魔改算法逆向
2bebb2b85345bac93a790d1a6986b3d5 经验1 貌似特征码，需要在从伪代码切换到汇编模式 ，再点击看具体值2 找出特征码，然后google 再带 算法，再带c source 如 md5 0x242070DB c source 3 md5 和sha1 在transfrom 4 ......
代码随想录算法训练营第二十一天|530. 二叉搜索树的最小绝对差、
【参考链接】 530. 二叉搜索树的最小绝对差 【注意】 1.二叉搜索树采用中序遍历，其实就是一个有序数组。 2.使用双指针，更快。 【代码】 1 # Definition for a binary tree node. 2 # class TreeNode(object): 3 # def __i ......
第四课 KNN最近邻算法
中国有句俗语“近朱者赤，近墨者黑”，这句话非常精准地点出了KNN最近邻算法的精髓。 1、算法思想 KNN算法在分类任务和回归任务上有稍许不同，但主流程是相同的，下面分别阐述。 1）分类任务 对于某个待分类点P，先找出距离P点最近的N个邻居，然后使用投票的方式统计出P点对应的分类，即统计这N个邻居分属 ......
深度学习算法预测（LSTM）
深度学习算法预测（LSTM） LSTM在时间序列预测领域有着不错的表现，在进行时间序列预测时，既可以对单变量序列进行预测，也可以对多变量序列进行有效地输出。 LSTM搭建将使用tensorflow的keras模块搭建，已高度封装，可直接取用。 共封装了3个主要的函数： fit用于模型训练； eval ......
每天一颓: 均摊分析, pi函数和KMP算法
资料内容: https://oi-wiki.org/string/kmp/ *** 很久以前学过,写一些笔记作复习资料 一些概念: 真前缀, 真后缀等等不作介绍 (**真前后缀匹配函数**)前缀函数(pi函数): $$ \pi[i] = \max_{k = 0 \dots i}\{k: s[0 \d ......
【数据结构与算法】树专题
# 树 > 树（Tree）是n（n≥0）个结点的有限集。n=0时称为空树。 > > 在任意一棵非空树中： > > （1）有且仅有一个特定的称为根（Root）的结点； > > （2）当 n＞1 时，其余结点可分为 m（m＞0）个互不相交的有限集 T1、T2、……、Tm，其中每一个集合本身又是一棵树，并 ......