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第三代测序中基于德布鲁因图的长读错误纠正算法
第三代测序中基于德布鲁因图的长读错误纠正算法摘要——PacBio单分子实时测序平台可以产生大量的长读序列，这对基因组的从头组装非常重要。尽管这些长读取具有15%的高错误率，但是由于它们的高错误率而放弃它们是不明智的。Illumina测序平台产生了长度在100 bp左右的短读，错误率低，成本低。但是组 ......
最小二乘法的矩阵正则化改进——“岭回归”和“LASSO回归”算法
看代码过程中发现了一个很奇怪的概念，叫做“最小二乘法的矩阵正则化”，这个词汇十分的陌生，虽然最小二乘法是知道的，但是用了矩阵正则化的最小二乘法是个什么东西呢？ 相关代码见： 强化学习：连续控制问题中Actor-Critic算法的linear baseline 后来在网上一通查才知道，原来“最小二乘法 ......
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析 吕利王晓利张文娟韩芝侠 宝鸡文理学院电子电气工程学院 摘要：目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷，并提出改进措施，以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法，包括基于“校正后组装”策略的FA ......
Longley数据集——强共线性的宏观经济数据,包含GNP deflator(GNP平减指数)、GNP(国民生产总值)、Unemployed(失业率)、ArmedForces(武装力量)、Population(人口)、year(年份)，Emlpoyed(就业率)。LongLey数据集因存在严重的多重共线性问题，在早期经常用来检验各种算法或计算机的计算精度
Longley数据集来自J．W．Longley（1967）发表在JASA上的一篇论文，是强共线性的宏观经济数据,包含GNP deflator(GNP平减指数)、GNP(国民生产总值)、Unemployed(失业率)、ArmedForces(武装力量)、Population(人口)、year(年份)， ......
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要：随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现 何欣雨 北京交通大学 摘要：基因测序的意义是使人类从根本上认知疾病发生的原因,做到正确的治疗疾病、尽早的预防疾病。例如肿瘤和红斑狼疮等疾病都是和基因变异有关,如果能过通过测序技术知道变异点,对精准治疗,攻克难题有重大意义。第三代测序技术是Pac ......
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要：随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
针对第三代RNA测序长读段的比对算法研究
针对第三代RNA测序长读段的比对算法研究 李琪 桂林电子科技大学 摘要：随着第三代测序技术的日益成熟以及广泛应用,长序列比对成为正在兴起的研究领域。在转录组学研究中,将RNA长读段比对定位到参考基因组中,是对第三代RNA测序数据进行分析的关键一步,其准确性对差异基因表达、RNA编辑和融合基因的检测等 ......
DB - 数据仓库原理
2023年5月31日 01:13:14，刷B站的时候，刷到了李鹏程大佬的B站作品。 数据仓库的诞生原因 数据仓库的基本概述 数据仓库的特点 数据仓库 vs 数据库 数据仓库的诞生原因 1、历史数据积存；2、企业数据分析需要。 历史数据积存：历史数据使用频率低，堆积在业务库中，导致性能下降 企业数据分 ......
强化学习：连续控制问题中Actor-Critic算法的linear baseline
最近在看连续控制问题，看到了一个Actor-Critic算法中手动扩展features和设置linear baseline的方法，这些方法源自论文：《Benchmarking Deep Reinforcement Learning for Continuous Control》。 对于低维的feat ......
雷达原理与系统 第八讲 固态雷达发射机
雷达原理与系统 第八讲 固态雷达发射机 1. 雷达发射机所采用的放大器件，主要有两类—— 1). 电真空器件—— A. 早起雷达采用电真空器件放大器。 B. 自动1948年半导体二极管发明之后，晶体管使用的频率从VHF, UHF向微波波段推进，功率电平水平在不断提高。 C. 固态雷达发射机的发展就是 ......
计算机组成原理之存储系统
时间紧，任务重，争取在6月前把计组学完吧.....老天保佑！  本章的结构导图。  是一种统计数据，用于量化公司、投资组合在特定时间范围内可能发生的财务损失程度 什么是风险价值（VaR）？ 该指标最常被投资银行和商业银行用来确定 ......
SSTF算法
oj: https://codefun2000.com/p/P1269 学一个新东西 multiset 里面是排好序的 可以存重复的值 但是里面的值不能被修改 否则就不能排序了 可以用lower_bound(x)，得到multiset中大于等于x的最小的数的位置 auto ri = q.lower_ ......
算法学习day34贪心part03-1005、134、135
package LeetCode.greedypart03; /** * 1005. K 次取反后最大化的数组和 * 给你一个整数数组 nums 和一个整数 k ，按以下方法修改该数组： * 选择某个下标 i并将 nums[i] 替换为 -nums[i] 。 * 重复这个过程恰好 k 次。可以多次选 ......
算法学习day32贪心part02-122、55、45
package LeetCode.greedypart02; /** * 122. 买卖股票的最佳时机 II * 给你一个整数数组 prices ，其中prices[i] 表示某支股票第 i 天的价格。 * 在每一天，你可以决定是否购买和/或出售股票。 * 你在任何时候最多只能持有 一股 股票。你也 ......
算法刷题记录：[NOIP2000]计算器的改良（未AC）
###题目链接 https://ac.nowcoder.com/acm/contest/19306/1043 ###题目分析 模拟就完事，代码写的很屎山，估计哪里死循环了，要不就是TLE，明天改。 ###未AC代码 ```c++ #include #include #include using na ......
基于FPGA的LFSR16位伪随机数产生算法实现,可以配置不同的随机数种子和改生成多项式,包含testbench
1.算法仿真效果 vivado2019.2仿真结果如下： 2.算法涉及理论知识概要 LFSR（线性反馈移位寄存器）提供了一种在微控制器上快速生成非序列数字列表的简单方法。生成伪随机数只需要右移操作和 XOR 操作。LFSR 完全由其多项式指定。例如，6千-次多项式与每个项存在用方程 x 表示6+ x ......
文心一言 VS 讯飞星火 VS chatgpt （26）-- 算法导论5.1 1题
## 一、证明:假设在过程 HIRE-ASSISTANT 的第 4 行中，我们总能决定哪一个应聘者最佳。则意味着我们知道应聘者排名的全部次序。 ## 文心一言： 证明: 假设在过程 HIRE-ASSISTANT 的第 4 行中，我们总能决定哪一个应聘者最佳。则意味着我们知道应聘者排名的全部次序。 在 ......
随机森林模型 的数学原理
随机森林是一种基于决策树的集成学习方法，其基本思想是通过构建多个决策树来进行分类和回归。随机森林中的每一棵决策树都是在随机样本和随机特征的条件下构建出来的，整个建模过程相当于将多个弱分类器组合成一个强分类器。其主要数学原理如下： 1. 决策树： 随机森林是由多个决策树构成的集成模型，而决策树是一种树 ......
springboot 雪花算法生成的发送到前端id精度丢失
添加注解： @JsonFormat(shape = JsonFormat.Shape.STRING) 用法： ......
算法刷题记录：[NOIP2017]图书管理员
###题目链接 https://ac.nowcoder.com/acm/contest/19306/1050 ###题目分析 因为要求最小编号，并且该编号是以读者的编号结尾，这边直接排序+翻转，找开头的数。 记录是因为看到某个大佬非常好的思路，直接对编号进行取模，就是末尾的数。 **如果想得到末尾的 ......
第五课 朴素贝叶斯算法
1、贝叶斯定理 大学时学习的《概率论与数理统计》，其中有一个很重要的公式是贝叶斯公式： 同理，将A、B的位置互换一下，上面的公式仍然成立，即： 通过P(AB)为桥梁，联立以上2个公式，可得到下式： 贝叶斯公式看起来非常简单，但它其实是一个非常伟大的思想，简单说，有些条件概率不容易或无法计算求出，比如 ......
ASEMI代理KY可控硅BT169的工作原理及应用领域
编辑-Z 本文主要介绍了可控硅BT169的工作原理及其在各个领域的用。首先，我们将详细阐述可控硅BT169的工作原理，包括结构特点、工作过程等；其次，我们将探讨可控硅BT169在家用电器、工业控制、电力电子等领域的应用。 1、可控硅BT169的工作原理 可控硅BT169是一种三端双向可控硅，具有结构 ......
算法刷题记录：译码
###题目链接 https://ac.nowcoder.com/acm/contest/19306/1046 ###解题思路： 10进制转x进制，只要反复`%x、/x`即可。 `%x`取出末尾的数字，因为末尾的数字已经取出，所以将该数字`\`掉 可以一起算也可以循环，**取模不会影响除数**。 ## ......
机器学习-KNN算法
##### 1. 算法原理（K-Nearest Neighbor） - 本质是通过距离判断两个样本是否相似，如果距离够近就认为他们足够相似属于同一类别 - 找到离其最近的 k 个样本，并将这些样本称之 为「**近邻**」(nearest neighbor)。 - 对这 k 个近邻，查看它们的都属于何 ......
redis.conf 7.0 配置和原理全解，生产王者必备
# 5.5 redis.conf 配置详解 我是 Redis， 当程序员用指令 `./redis-server /path/to/redis.conf` 把我启动的时候，第一个参数必须是`redis.conf` 文件的路径。 这个文件很重要，就好像是你们的 DNA，它能控制我的运行情况，不同的配置会 ......
列级约束和标记约束
1.列级约束在定义列语句中，例 sno int primary key auto_increment , --（学生表学号，int型，约束：主键（非空且唯一）+自增） sex char(1) default '男' check(sex='男' or sex='女')， --(性别默认为男，性别只能为 ......