BIO
Java网络IO-BIO
Java BIO 就是传统的 Java I/O 编程 BIO(BlockingI/O)：同步阻塞，服务器实现：一个连接一个线程，即客户端有连接请求时服务器端就需要启动一个线程进行处理。 单线程情况下，只有一个线程可以处理客户端请求，也就是同时只能连接一个客户端。 优化点：可以通过线程池机制改善，实现 ......
【Base64】二进制数据编码解码（OpenSSL BIO）
1.问题引出 计算机中数据使用ascii码存储，而ascii码在128~255之间是不可见字符，网络上传输数据时往往经过多个路由设备，不同设备不同的处理方式也可能导致数据传输过程中处理出现问题。所以我们通过Base64将数据全部编码成可见字符（A-Z, a-z, 0-9, +, / 共64个）可以降 ......
Bio.SeqIO.parse()一次性迭代器
Bio.SeqIO.parse()是一次性迭代器，当用下列语句迭代过一次后，再迭代就为空： 1 import Bio 2 filename = "test.fasta" 3 seqs = Bio.SeqIO.parse(filename, "fasta") 4 # 第一次迭代，会正常输出seq id ......
JAVA中三种I/O框架——BIO、NIO、AIO
一、BIO(Blocking I/O) BIO，同步阻塞IO模型，应用程序发起系统调用后会一直等待数据的请求，直至内核从磁盘获取到数据并拷贝到用户空间； 在一般的场景中，多线程模型下的BIO是成本较低、收益较高的方式。但是，如果在高并发的场景下，过多的创建线程，会严重占据系统资源，降低系统对外界响应 ......
BIO
# BIO ## 1BIO介绍 传统阻塞Java IO编程，其相关的类和接口在Java.io 包中 BIO(blocking I/O)同步阻塞，服务器实现模式为一个连接一个线程，即客户端有连接请求时服务器端就需要启动一个线程进行处理，如果这个连接不做任何事情会造成不必要的线程开销，可以通过线程池机制 ......
BIO、NIO、AIO是什么有什么区别
BIO、NIO、AIO是Java编程语言中的三种不同的I/O模型。 1. BIO（Blocking I/O）同步阻塞式，是传统的阻塞式I/O模型，它是单线程的，每个I/O操作都会阻塞当前线程，直到数据准备好或者操作完成。在BIO模型中，每个连接都需要一个独立的线程来处理，因此在高并发场景下，线程数量 ......
bio、nio、aio，同步和阻塞的区别
java从程序从网络中读取一组数据,首先从用户态发出IO请求，申请系统调用。操作系统内核收到系统调用，执行对应的IO操作。 1.首先由DMA从网卡缓存区将数据拷贝到系统的内核缓冲区。 2.再由内核讲内核缓存区的数据拷贝到用户态的用户缓冲区当中。此时，数据拷贝完成依次返回。 这个过程中存在这么几个步骤 ......
BIO、NIO、AIO、Netty
1.首先了解什么是IO? Java中I/O是以流为基础进行数据的输入输出的，所有数据被串行化(所谓串行化就是数据要按"顺序"进行输入输出)写入输出流。简单来说就是java通过io流方式和外部设备进行交互。 在Java类库中，IO部分的内容是很庞大的，因为它涉及的领域很广泛：标准输入输出，文件的操作， ......
网络IO模型：BIO、NIO、AIO的区别
1.BIO，即Blocking IO，同步阻塞IO，最原始的实现方式，每个socket在进行IO请求时（发送数据或接收数据）都会阻塞线程，所以有多少个IO请求就需要多少个线程； 这里同步和异步是一种逻辑概念，比如我调用某个接口是异步接口，即对方不会等处理完业务后告诉我业务处理结果，而是直接就返回了， ......
python 中 Bio中SeqIO模块处理fastq数据
001、输出fastq的ID [root@PC1 test02]# ls a.fastq test.py [root@PC1 test02]# cat a.fastq ## 测试fasq数据，一共两个reads @SRR8442980.988/2 AAGG + :FFF @SRR8442980.11 ......
I/O模式（BIO/NIO/AIO）
I/O过程 对于一次IO访问（这回以read举例），数据会先被拷贝到操作系统内核的缓冲区中，然后才会从操作系统内核的缓冲区拷贝到应用程序的缓冲区，最后交给进程。所以说，当一个read操作发生时，它会经历两个阶段： 1. 等待数据准备 (Waiting for the data to be ready ......
标注BIO-精灵标注助手
[TOC] ### 准备待标注数据 创建 raw_data.txt 待标注数据 ``` 如何预防高血压？高血压的防治高血压的防治 我是小三阳，有糖尿病，高血脂，我该怎么吃药？糖尿病患者能吃减肥药吗. 糖尿病的的危害,糖尿病怎样治疗呢 医院糖尿病肾病治疗怎么样,糖尿病如何防治? 糖尿病人能吃蜂王浆吗, ......
BIO、NIO、AIO区别详解
###BIO：同步阻塞 主线程发起io请求后，需要等待当前io操作完成，才能继续执行。 ###NIO：同步非阻塞 引入selector、channel、等概念，当主线程发起io请求后，轮询的查看系统是否准备好执行io操作，没有准备好则主线程不会阻塞会继续执行，准备好主线程会阻塞等待io操作完成。 # ......
I/O模型：BIO、NIO、AIO
Java共支持3种网络编程的I/O模型：BIO、NIO、AIO BIO： 同步并阻塞（传统阻塞型），服务器实现模式为一个连接一个线程，即客户端有连接请求时服务器端就需要启动一个线程进行处理，如果这个连接不做任何事情会造成不必要的线程开销 NIO： 同步非阻塞，服务器实现模式为一个线程处理多个请求（连 ......
Java BIO，NIO，AIO
一丶IO模型&Java IO Unix为程序员提供了以下5种基本的io模型： blocking io： 阻塞io nonblocking io： 非阻塞io I/O multiplexing： io多路复用 signal driven I/O：信号驱动io asynchronous I/O：异步io ......
biopython Bio.Alphabet
参考：https://biopython.org/wiki/Alphabet 作用： 1. 记录序列的分子类型(DNA, RNA或蛋白质)， 2. 在序列、alignment、motif等中声明预期的字符。 在Biopython 1.78及以后的版本中删除了Bio.Alphabet模块。 #old ......