SeqIO

Bio.SeqIO.parse()是一次性迭代器，当用下列语句迭代过一次后，再迭代就为空： 1 import Bio 2 filename = "test.fasta" 3 seqs = Bio.SeqIO.parse(filename, "fasta") 4 # 第一次迭代，会正常输出seq id ......

001、分别输出染色体ID、序列和序列的长度 [root@PC1 test02]# ls a.fa test.py [root@PC1 test02]# cat a.fa ## 测试数据 >seq1 AGAAGGGG >seq2 AAACCTTTT >seq3 AAATTTCCGG [root@PC ......

001、输出fastq的ID [root@PC1 test02]# ls a.fastq test.py [root@PC1 test02]# cat a.fastq ## 测试fasq数据，一共两个reads @SRR8442980.988/2 AAGG + :FFF @SRR8442980.11 ......