Sentieon
Sentieon | 每周文献-Epidemiology-第五期
流行病学系列文章-1 标题(英文):Rare Variants in Inborn Errors of Immunity Genes Associated With Covid-19 Severity 标题(中文):与Covid-19严重程度相关的免疫基因先天性缺陷的罕见变异 发表期刊:《Front ......
Sentieon安装时 jemalloc error 解决办法
背景 Sentieon建议使用jemalloc来改善Sentieon应用程序中的内存管理和整体性能,尤其是Sentieon bwa-mem。有时在安装运行过程中会出现报错: ERROR: ld.so: object '/usr/lib64/libjemalloc.so.2' from LD_PREL ......
Sentieon | 每周文献-Agrigenomics-第四期
农业系列文章-1 标题(英文):Genomic footprints of sorghum domestication and breeding selection for multiple end uses 标题(中文):高粱驯化的基因组足迹和多种最终用途的育种选择 发表期刊:《Molecular ......
Sentieon实战:NGS肿瘤变异检测流程
肿瘤基因突变检测是NGS的一个重要应用,其分析难点主要在于低频变异的准确性。不同于遗传病检测,肿瘤样本类型多样,测序方法和参数复杂,且缺乏对应各种场景的公共标准真集。再加上常用开源软件经常遇到的准确性低,稳定性差,速度慢等问题。这使得广大诊断公司在评估肿瘤变异检测工具、搭建高效稳定的生信流程上,面临 ......
Sentieon | 每周文献-Population Sequencing-第一期
群体基因组系列文章-1 标题(英文):The Impact of ACEs on BMI: An Investigation of the Genotype-Environment Effects of BMI 标题(中文):ACEs对BMI的影响:探究BMI的基因型-环境效应 发表期刊:Behav ......
Sentieon | 每周文献-Genetic Disease-第二期
遗传病系列文章-1 标题(英文):Answer ALS, a large-scale resource for sporadic and familial ALS combining clinical and multi-omics data from induced pluripotent cel ......
Sentieon | 每周文献-Tumor Sequencing-第三期
肿瘤测序系列文章-1 标题(英文):The relationship between genetic characteristics and clinical characteristics and the efficacy of 131I therapy in children and adole ......
使用Sentieon加速甲基化(WGBS)分析
全基因组甲基化测序(WGBS)是一种研究DNA甲基化的方法,以全面了解在基因组水平上的表观遗传变化。在进行WGBS数据分析时,通常需要使用专门的比对工具,因为这些工具需要能够处理亚硫酸盐转化后的数据。 以下是四个不同的WGBS比对分析流程: Bismark:Bismark是一个基于Bowtie2或H ......