k-mer

全文链接：https://tecdat.cn/?p=34394 原文出处：拓端数据部落公众号 分析师：Xiaoqi Wu 科学技术的发展为各个领域都带来了深刻的变革，在生物学领域，随着计算机的应用，生物学与信息学的结合诞生了一门新的融合学科——生物信息学。作为生物信息学的重要研究内容之一，生物序列比 ......

k-mer是一种用于描述序列数据的概念。在生物信息学中，k-mer通常指的是长度为k的连续子序列。例如，在dna序列中，4-mer（k=4）是四个连续的碱基；在蛋白质序列中，3-mer（k=3）是三个相邻的氨基酸。 k-mer在基因组学、转录组学和蛋白质组学等领域中广泛使用。它们可以用于许多任务，例 ......

Jellyfish: 快速统计长序列中每个K-mers出现次数 一个老工具，2011 发表于Bioinformatics，目前引用1018次。因为需要用所以看了一下原文。 Jellyfish，是此研究开发的，可以快速统计长序列中每个K-mers出现次数的软件。 基于K-mers的应用很广，包括基因组 ......