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DNA甲基化是在半个多世纪前在细菌中发现的。DNA碱基可以作为一个表观遗传调节因子——也就是说，它可以赋予相同的基因序列不同的和可逆的调控状态。在真核生物中，表观遗传调控可以发生在多个水平上：DNA甲基化、核小体定位、组蛋白变异和组蛋白修饰。相比之下，细菌缺乏组蛋白和核小体；因此，DNA甲基化是微生物表观遗传基因调控的主要手段。原核生物中的DNA甲基化修饰为宿主适应变化多端的环境提供了独立于DNA序列变化的表观遗传学调控机制，正成为微生物耐药性、抗逆性、致病性等诸多菌种特殊性能研究以及微生物与环境相互作用研究的热点前沿。
近年来，深度测序可以对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析，为我们对核酸序列的高通量理解提供了单碱基水平的精度。原核转录组测序可以从基因表达量、基因结构和sRNA调控功能三维度揭示不同生物性状的分子调控机制。如通过计算各组间的差异基因并对差异基因进行富集分析，获得对生物性状影响较大的通路信息；通过预测基因的反义转录本，丰富基因组注释内容；研究sRNA对mRNA的相互作用，从分子调控角度解释生物性状之间的差异。
课程主题
- 细菌微生物基因表达调控表观研究
直播时间
- 2023年9月21日，19：00-19:45
课程要点
- 细菌全基因组甲基化纳米孔测序(ONT)
- 原核转录组测序(mRNA+sRNA)
- 原核甲基化+原核转录组组学关联分析
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