基因 表观 微生物 细菌
Trends in Plant Science | 王向峰老师综述数据驱动的基因组设计育种
目录摘要将生物数据和知识转化为植物的精准设计育种机器学习（ML）在植物生物学中的应用案例研究：多组学数据关联研究（MODAS）中的数据降维（DR）亮点总结 今天简单回顾下中国农业大学王向峰教授团队2023年上半年发表在Trends in Plant Sicence的综述文章。该文阐释系统全面，值得赏 ......
由基因型-组织表达项目（GTEx）联想开去
近日，由丹麦奥胡斯大学、华南农业大学、中国农科院基因组所、美国农业部、马里兰大学、爱丁堡大学和等多家单位联合发起的猪基因型-组织表达计划（PigGTEx）取得阶段性进展，成功构建猪基因型-组织表达图谱，相关文章 “A compendium of genetic regulatory effects ......
机器学习应用于基因组预测，以苜蓿为例
目录目的示例代码表型文件预处理基因型文件预处理机器学习建模预测绘图其他结果 利用代码复现一个机器学习应用于基因组预测的项目，张志武老师于2023年发表在《园艺研究》上的一篇文章。 目的 使用 GWAS 和 GP 结合重测序数据和从世界各地收集的 220 份紫花苜蓿种质的秋季休眠（Fall dorma ......
生物农学就业投票结果出炉
前段时间发牢骚写了一篇推文：论农业院校对于农学人才培养的缺失，引发了大家对于生物和农学方向就业问题的一些讨论（虽然推文并不是说这个问题）。随后，为了解大家具体的就业情况，小编随便设计了几个简单的问题来进行投票：关于生物农学方向就业情况的调查。截止目前，共有179人参与投票。让我们一起来看看结果吧。 ......
推荐 | 现代生物学的现代统计学
上世纪30年代，受Fisher关于显著性和假设检验的影响，统计数据分析流程一般如下图所示。 70年代，Tukey推荐使用探索性数据分析（EDA）进行统计分析。EDA 建立在数据可视化的基础上，然后辅以验证性数据分析 （CDA）：假设驱动的推理方法，理想情况下应该是稳健的，而不是依赖于复杂的假设。 9 ......
Omics辅助育种统计方法：基因组遗传力
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节： Genomic heritability。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提取生物学意义。研究目标是利用高维度 ......
GS | Ben Hayes报告：基因型数据基础
本报告是Ben Hayes和Hans Daetwyler合著。 关于Ben Hayes，前文已经介绍。详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基 ......
GS | Ben Hayes的基因组选择课程
关于Ben Hayes详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基因组计划的发起者。在牲畜、作物、牧场和水产养殖物种的遗传改良方面拥有丰富的研究经 ......
GS | Julius报告：基因组预测的准确性
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
GS | Julius报告：利用基因组信息预测遗传变化
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
20-有参转录组实战6-差异基因绘制火山图
#本教程仿自于B站的15天入门生物信息视频，若有疑惑请以视频为准。若侵请联。 #上一个教程我们得到了genes.counts.matrix.OE_vs_WT.DESeq2.DE_results文件，接下来对差异基因绘制火山图，我们这一步在Windows系统上的R进行即可，若需要安装Windows的R ......
南阳理工大学 生物与化学工程学院
生物与化学工程学院专业简介 应用化学专业（本科） 培养目标 本专业立足河南、面向全国，服务于区域经济建设和精细化工行业发展，培养德、智、体、美、劳全面发展，具有应用化学专业基本知识和理论、综合素质全面、工程实践能力突出，具备创新精神、国际视野和持续学习能力，能够在医药中间体、新能源材料等精细化工领域 ......
南阳师范大学 生物工程 硕士
生物工程领域工程硕士专业基本要求 作者：张林 时间：2016-02-26 点击数：198 生物工程领域工程硕士专业学位基本要求 第一部分 概况 生物工程领域工程硕士专业学位是与本工程领域任职资格相联系的专业性学位。学位获得者应成为基础扎实、素质全面、工程实践能力强并具有一定创新能力的生物工程应用型、 ......
易基因｜全基因组DNA甲基化测序（WGBS）揭示衰老对肝再生的表观基因组调控机制
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 众所周知，衰老会对肝脏再生产生影响。随着时间的推移，肝脏再生能力显著下降。肝脏体积、血流量和代谢等肝脏生理参数，以及损伤后的再生能力在人类和模型系统中均在老年时表现出下降，其中涉及许多分子机制，包括DNA甲基化依赖性基因组重塑。那么DN ......
生物统计复习
1. 绪论 1.1 统计学 研究数据的 收集、 整理 、 分析 和 解释 的科学，是处理数据中 变异性 的科学和艺术。 统计分析可分为 统计描述和统计推断两部分 统计描述：用统计图表、统计指标或几个特征数描述资料的数据特征和分布规律 统计推断：用样本信息来推断总体特征 目的：求得可靠的结果 任务：在 ......
易基因：DNA甲基化和转录组分析揭示番茄黄化曲叶病毒感染过程中的转录和表观遗传学变化
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 双生病毒（Geminiviruses）是一种DNA植物病毒，可引起影响全球作物的高度破坏性疾病。在感染过程中，双生病毒调控细胞过程，抑制植物防御，并导致感染细胞的大量重编程，导致整个植物稳态重大变化。测序技术进步允许大规模同时分析病毒感 ......
生物信息学
生物信息学 常用医学生物信息学数据库 / 生物信息学(第二版) / 生物信息学 基因和蛋白质分析的实用指南 / 医学生物信息学 / 简明生物信息学 / 生物信息学网络资源与应用 / 生物信息学手册 / 生物信息学 / 生物信息学：序列与基因组分析 / 生物信息学与功能基因组学 / 生物信息学算法导论 ......
《生物信息学算法导论》是2007年化学工业出版社出版的图书，作者是(美)N.C.琼斯 ，(美)P.A.帕夫纳。
目前，可供本科学生使用的生物信息学著作为数不多，本书恰恰是其中的一本。国内生物信息学，计算生物学、计算数学等领域的本科生、研究生和其他研究人员，会从书中汲取基本的算法原理、解决实际问题的方法和技巧，进而更好地从事相关研究工作。 目录 播报 编辑 1 绪论 2 算法与复杂性 2.1 算法是什么？ 2. ......
与生物学有关的职业
与生物学有关的职业 2017-09-07 14:49 生活中随处可以发现生物学知识，生物源于生活；但不仅于此，生物又回归生活，造福生活，最直接的体现就是在职业生涯中。与生物学有关的职业都有哪些呢？让我们一起来了解一下吧！ 医院里的检验师 就业单位： 医院检验科或化验室。 学历要求： 医学院校大学专科 ......
生物统计学(第5版十二五普通高等教育本科国家级规划教材)
李春喜、姜丽娜、邵云、张黛静编著的《生物统计学(第5版）》较为系统地介绍了生物统计学的基本原理和方法，在简要叙述了生物统计学的产生、发展及其研究对象与作用以及生物学研究中抽样方法、资料的整理、特征数的计算、概率和概率分布、抽样分布的基础上，着重介绍平均数的统计推断、X2检验、方差分析、直线回归与相关 ......
《计算生物学导论 : 图谱、序列和基因组》是2009年8月科学出版社出版的图书，作者是(美)Michael S. Waterman。 [1]
本书介绍分子生物学的基本常识、限制图谱和多重图谱，研究克隆和克隆图谱，讨论DNA序列相关的话题，涉及序列中模式计数的统计问题等。 [1] 图书目录 编辑 播报 《生物数学丛书》序 前言 数学符号 第0章 引言 第1章 分子生物学一些知识 第2章 限制图谱 第3章 多重图谱 第4章 求解DDP的算法 ......
生物信息学（第2版）简介，目录书摘
本书适合作为生命科学或医学相关专业的生物信息学课程教材，也适合从事生物信息学相关研究的专业人员参考阅读。 内容简介: 本书以生物学问题为导向，以具体的案例来演示如何用信息学方法处理各种生物学数据，并对目前研究中存在的问题和未来的发展方向进行了展望。全书从介绍生物信息学的研究历史和发展现状入手，第2章 ......
易基因2023年度DNA甲基化研究项目文章精选
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2023年，易基因参与的DNA甲基化研究成果层出不穷，小编选取其中5篇不同方向的论文与您一起来回顾。 01、易基因微量DNA甲基化测序助力中国科学家成功构建胚胎干细胞嵌合体猴，登上《细胞》封面 （cell / IF 64.5） 02、o ......
河南科技大学 生物信息学
生物信息学是生物科学类、农林类及医学类等本科专业的一门专业课程，主要培养学习者具备初步的生物信息学综合分析技能和创新创业能力。河南科技大学《生物信息学》课程于2018年度被遴选为河南省省级精品在线开放课程。 —— 课程团队 课程概述 生物信息学是生物学、计算机科学及应用数学等学科相互交叉而形成的一门 ......
易基因： RNA m7G甲基化修饰的生物学功能及其在癌症中的作用｜综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 m7G修饰是RNA转录后修饰之一，存在于许多不同类型的RNA中。通过对RNA中m7G修饰的准确鉴定，揭示了m7G在基因表达调控和不同生理功能中的作用。越来越多的证据表明，m7G修饰在癌症发生中至关重要。本文综述了m7G的检测技术、分布、 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
生物信息学 入门教材
李衍达 - 生物信息学基因和蛋白质分析的实用指南 王晶晶 蔡赫 生物信息学 2014 郝柏林 - 生物信息学手册 生物信息学中的计算机技术(2002年科学出版社... - 百度百科 分类：书籍作者：[美]Cyntbia Gibas、[美]Per Jambeck Bioinformatics%2C M ......
安阳工学院 生物信息学
生物信息学 —— 课程团队 安阳市生物信息重点实验室 2016年03月24日 11:35 点击：[229] “安阳市生物信息学重点实验室”于2015年12月经安阳市科学技术局批准成立，以安阳工学院生物与食品工程学院为依托建设。实验室主要研究方向为分子相互作用网络、基因组数据分析、蛋白质结构与分子模拟 ......
生物信息测验
第一章 生物信息学概论 第一章 生物信息概论测验 1、 问题:生物信息学从什么时候进入飞速发展阶段选项：A:1990年人类基因组计划开始之后B:1977年Sanger测序技术出现之后C:1971年PDB数据库创建之后D:1970年Unix操作系统发布之后答案: 【1990年人类基因组计划开始之后】 ......