干细胞
CytoTRACE推测细胞分化状态
<~生~信~交~流~与~合~作~请~关~注~公~众~号@生信探索> python环境 CytoTRACE的iCytoTRACE函数需要调用python去除批次效应,因此需要先设置好python环境 mamba create -n SC && mamba activate SC mamba insta ......
易基因:METTL3介导的m6A甲基化谱调控肌肉干细胞成肌细胞状态转换|发育分化
2020年9月29日,《Cell Death Discovery》(IF: 7.109)杂志发表了题为“A defined N6-methyladenosine (m6A) profile conferred by METTL3 regulates muscle stem cell/myoblast ......
单细胞转录组分析新篇章:挖掘人类胚胎基因表达的神秘密码
在这份报告中,我们使用了更新的Scanpy软件包对同一数据集(GEO number GSE109555)单细胞数据进行分析。相较于鄙人2021年发表的论文《Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in ......
禄米 干细胞实验室建设
干细胞实验室主要是进行干细胞基础研究、临床应用研究及干细胞技术服务,包括各种组织细胞的来源干细胞体外鉴别、分离、纯化、扩增和培养等实验研究。 主要检测项目: 干细胞培养、细胞检测、细胞扩增 干细胞实验室建设注意事项: 1、从保温角度考虑实验室的围护及吊顶结构采用厚度为50mm的净化实验室专用聚苯乙烯 ......
易基因-单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 易基因单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序 高通量单细胞DNA甲基化测序简介 单细胞DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术,传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。目前单细胞甲基化研究主要受 ......
m基于WOA优化的SVM乳腺癌细胞和正常细胞分类识别算法matlab仿真,对比BP网络,SVM,PSO+SVM
1.算法描述 SVM 是有监督的学习模型,我们需要事先对数据打上分类标签,通过求解最大分类间隔来求解二分类问题。如果要求解多分类问题,可以将多个二分类器组合起来形成一个多分类器。 WOA算法设计的既精妙又富有特色,它源于对自然界中座头鲸群体狩猎行为的模拟, 通过鲸鱼群体搜索、包围、追捕和攻击猎物等过 ......
单细胞转录组测序数据生物信息分析进展综述
摘要:随着单细胞测序技术的发展,生物信息学在单细胞数据分析方面取得了重要进展。本文将为生物和医学科研工作者介绍单细胞转录组测序数据生物信息分析的进展,重点介绍该领域的最新研究成果和常用软件包。 引言 单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术已经成为研究细胞异质性和功能的重要手段。为了从海量的单细胞 ......
单细胞转录组学:新时代的生物医学研究工具
摘要:单细胞转录组学是一种基于高通量测序技术的单细胞基因表达研究方法。近年来,随着测序技术的快速发展,单细胞转录组学已成为生物医学领域的重要研究手段。本文将介绍单细胞转录组学的基本原理、技术发展、应用以及存在的挑战。 引言 在传统转录组学研究中,研究者通常使用大量细胞的平均基因表达数据。然而,这种方 ......
易基因:m6A mRNA甲基化修饰调控CTNNB1促进肝母细胞瘤增殖的机制研究|Mol Cancer
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2019年12月23日,国家儿童医学中心(上海)、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心潘秋辉教授团队在《Molecular Cancer》(IF:41.444/Q1)杂志上发表了题为“m6A mRNA methylation regu ......
引用的: 本篇主要和大家分享有关NGS检测体细胞突变时判断DNA污染的方法。
来自https://mp.weixin.qq.com/s?src=11×tamp=1679887356&ver=4431&signature=FISeM4PGVyZ-AGQmG7Aib6zDiSV7B1TvaBgc41rLNE-ofmYD1pw2Nu46xLzgY5AsBI261SsCp* ......