课程学习

20230321:Bert Bert 词嵌入(word embedding): 词嵌入是词的表示. 是一种词的类型表示，具有相似意义的词具有相似的表示，是将词汇映射到实数向量的方法总称。 之所以希望把每个单词都变成一个向量，目的还是为了方便计算，比如“猫”，“狗”，“爱情”三个词。对于我们人而言，我 ......

20230328:pycharmDebug 今天学了pycharm的debug,非常有用,主要是上面几个键. ......

20230403:yum yum provides :是反查询，用于搜索某个文件在哪个软件包里面。 rpm 与 yum 的区别 rpm 软件包之间的依赖性问题往往会很繁琐,尤其是软件由多个 rpm 包组成时。 yum 基于 RPM 包管理，能够从指定的服务器自动下载 RPM 包并且安装，可以自动处理 ......

20230410:Bert Huggingface 今天运行python -c 'from transformers import TFBertForTokenClassification'的时候有一个报错: Could not load dynamic library 'libcudart.so. ......

20230322:Bert安装与使用 Bert安装与使用 安装教程:地址 需要python版本大于等于3.5, tensorflow版本大于等于1.10.1,但是我经过测试发现,3.7.6版本不行,报错说缺少glib23,只能是使用这个教程的方法. R的一个function: file.path,用 ......

20230407:tensorflow transformer tf.name_scope: 这个函数会规定对象和操作属于那个范围,但是不会对“对象”的“作用域”产生任何影响,也就是不是全局变和局部变量的概念. 这个东西有很多种用法: with tf.name_scope("loss"): #这个名 ......

学习OpenGL、OpenTK 1、接上篇投影矩阵的源码分析 glm::ortho和Matrix4.CreateOrthographicOffCenter源码一致，根据示例里面的进行代码翻译改造 改造如下： public Matrix4 GLMOrthographic(float left , fl ......

20230217 R的匿名函数 (function(x, y){ z <- x^2 + y^2; return (x+y+z) })(0:7,1) #[1] 2 4 8 14 22 32 44 58 给R的list添加新的元素的时候,需要用双括号,用单括号容易报错| list1[['firstEle ......

20230228:mzR,Norm,Regression mzR: mzML格式读取是使用proteowizard C++库. 常用函数:读入数据的openMSfile，提取数据矩阵的header以及提取峰图谱的peaks Norm范数 L0 Norm:c(0,0)的L0 Norm等于0,c(1,0 ......

20230301:质谱解卷积 质谱信号根本就没有卷积，解卷积也无从谈起，但因为Colby这篇文章，后面三十年大家就都默认了解卷积等同于重构质谱峰的意义了。不过在蛋白质质谱领域，解卷积还有另外一个概念，就是把多电荷峰反解回分子量，此处最流行的是一种利用最大似然度求解的maxent算法，同样也跟卷积的原 ......

20230303:心磷脂解析 心磷脂四条链解析 这篇文献用的DDA方法,MS1数据用于心磷脂的定性和定量,MS2数据用于提取和解析PA的profiles.一个心磷脂在二级中会被打碎,会从下面这三个位置上打碎,所以一个经CL打碎生成的PA会有三个m/z. ​ 步骤: 1. 使用MZmine2处理mzM ......

20230306:培养基 细菌培养基 M9培养基和lb培养基. 细菌对数生长期(logarithmic growth phase) 微生物生长曲线完整周期示意图 ​ 测试原理是:不同的细菌个数对光的反射和折射不同,导致吸光系数不同,进而测量细菌不同生长状态下的OD值. Molecular struc ......

20230308:PNSA代码解析 PNAS和YF代码比较 | 特征 | PNAS | YF | | | | | | 输入数据 | DDA | DIA | | 算法 | 线性回归 | LASSO | | FA数据 | | | If we want to issue a package, what i ......

20230316:转录组测序 转录组测序数据分析 最根本的是基础知识,不然给你数据你都不知道是干啥的.要多看综述,并且要多看几遍. 下载GEO数据之前,需要先下载参考基因组数据.可以在三个平台上下载:ucsc,ncbi和ensemble,使用下面的检索式在搜索引擎中检索: hg38 ftp ucsc ......

20230221:purr包 GSEA pandas purr的map_*函数的使用 DF = List1 %>% names %>% map_dfr(function(x){ #把List1转化成DataFrame的格式, map_dfr是把结果都按行合并起来. return (data.fram ......

20230220:tibble gseDO and limma R的tibble格式数据需要转成dataframe才能去除格式,得到某一列纯粹的数据 gseDO是DOSE包里面的函数,用于 Disease Ontology (DO) 分析和富集分析 Q：为什么将FPKM转换为TPM去做转录组差异分析 ......

 ![](https://img2023.cnblogs.com/blog/2204133/202304/2204... ......

word2vec 单词向量化表示 word2vec 下分为两个模型CBOW与Skip-gram ，分别包含Hierarchical Softmax和 Negative Sampling两个方法； 1. 连续词袋模型（CBOW）与跳字模型（Skip-gram） 单词W; 词典D = {W1, W2, ......

启动VS2022 C++就是CPP 排版方式更改 更换主题 点工具 工具点完点常规 常规点完点颜色主题 创建用于写代码的文件 找到源文件 点添加 点新建项 新建项里点C++ 文件 什么都不写直接点编译 会出现以下报错 编译F5 调试F7 在运行的时候需要调用main函数 C++严格区分大小写 头文件 ......

Git入门学习思维导图 这几天看了一下《Pro Git》这本书，强烈建议大家去看这本书学习git，是git的官方文档，比较形象，在官网就能看到，有中文版。 下图是我简单画的一张思维导图： ......

z-score归一化 通过正态分布来放缩范围， 注意任何放缩 在x缩小完范围以后都要改变原先的公式即y，不能只改变x的范围。 缩放基本没有副作用。 多项式回归 表明 特征值的数量不一定等于曲线公式中x的数量，如上图，有两个x但是特征值只有一个，其实之所以会产生这个疑问还是在于x没有加下标，其实这两个 ......

1、IoC的理念 IoC全称为Inversion of Control，中文翻译为控制反转，同时还有一个别名叫 依赖注入DI(Dependency Injection)。大多将IoC与DI看作同等概念，也有部分观点认为 依赖注入可以看作IoC的一种实现方式。 在没有Spring的时候，当我们需要依赖 ......

在今天我学会了分页查询的操作： 以下是部分代码： index.jsp <%@ taglib prefix="c" uri="http://java.sun.com/jsp/jstl/core" %> <%@ page import="java.util.ArrayList" %> <%@ page ......

unittest 单元测试框架是受到 JUnit 的启发，与其他语言中的主流单元测试框架有着相似的风格。其支持测试自动化，配置共享和关机代码测试。支持将测试样例聚合到测试集中，并将测试与报告框架独立。 官方文档：https://docs.python.org/zh-cn/3/library/unit ......

重点： 1. 不要生气，不要发火 2.把大的带好 3.把晚上的时间都给孩子 4.33%个人+33%家长+33%学校=才能取得好的成绩 准备 1.提前学 2.8-9年级的叛逆 家庭氛围 1.孩子学习的时光，自己完全陪伴，不做其他家务 2.如孩子在学习的时候，学习他们的知识 3.当孩子有情绪时， -与孩 ......

计算机的硬件组成 控制器：计算机的指挥系统（类似人脑） 运算器：数学运算和逻辑运算（类似人脑） 储存器：分为 内存和外存 内存：相当于人脑的短期记忆，速度快，存储能力差，只能识别 2进制 外存：相当于记事簿 永久保存，储存大，速度慢 输入设备：例如键盘鼠标 输出设备：例如 音响，显示屏 与运行程序有 ......

1）\t：一个制表位，实现对齐的功能 注：一个Tab键 2）\n：换行符 注：New Line,新的一行，相当于一个Enter，回车键 3）\\：一个\ 4）\"：一个" 5）\'：一个' 6）\r：一个回车 注：Carriage return，第一次看可能会疑惑，我第一次看就迷惑了 实际它的是意思 ......

抽象队列同步器AQS AQS介绍 AQS提供一套框架用于实现锁同步机制，其通过一个 FIFO队列 维护线程的同步状态，实现类只需要继承 AbstractQueuedSynchronizer ，并重写指定方法(tryAcquire, tryRelease等)即可实现线程同步机制。 AQS 继承结构 p ......

我的英语水平很差，可能缺乏语言天赋吧，曾经读高中和大学时期，英语怎么学都没什么提高，即使是大学考英语四级也是考了N次才勉强通过，毕业后没怎么用过英语，更加荒废了，现在想学习英语，就是想锻炼自己，养成一个好的学习习惯，同时通过阅读英文新闻增长见识。 学习英语是一条漫长而充满挑战的道路，需要我们持之以恒 ......

本文相关的TryHackMe实验房间链接：https://tryhackme.com/room/burpsuiterepeater 本文相关内容：了解如何使用 Repeater 在 Burp Suite 中重放请求。 什么是Repeater？ 在我们开始使用 Repeater 之前，了解它的作用对我 ......