基因组 图谱 导论 生物学
易基因：METTL3介导的m6A甲基化谱调控肌肉干细胞成肌细胞状态转换｜发育分化
2020年9月29日，《Cell Death Discovery》（IF: 7.109）杂志发表了题为“A defined N6-methyladenosine (m6A) profile conferred by METTL3 regulates muscle stem cell/myoblast ......
生物技术在医疗领域的应用
随着科技的不断发展，生物技术在医疗领域的应用越来越广泛。生物技术是指利用生物学、化学、物理学等多学科知识，通过对生物体的分子、细胞、组织、器官等进行研究和改造，以达到治疗疾病、改善人类生活质量的目的。 生物技术在医疗领域的应用主要包括以下几个方面： 1. 基因治疗 基因治疗是指通过改变人体细胞的 ......
算法导论-第3章-描述运行时间
第3章 描述运行时间 本章研究算法的**渐近（asymptotic）**效率。我们关心的是，当输入规模足够大时，算法运行时间与随着输入规模的增大发生怎样的变化，即研究$T(n)$随着$n$的增大发生怎样的变化。 3.1 $\Omicron$符号，$\Omega$符号，$\Theta$符号 $\Omi ......
单细胞转录组分析新篇章：挖掘人类胚胎基因表达的神秘密码
在这份报告中，我们使用了更新的Scanpy软件包对同一数据集（GEO number GSE109555）单细胞数据进行分析。相较于鄙人2021年发表的论文《Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in ......
学习数据库的第一天（导论）
数据库就是用来存放和管理数据的，是整个系统的核心 mysql是一个用来存放和操作数据库的软件，操作语言为sql语句。 作为一个数据库大佬应用掌握 sql————>事务、存储引擎、索引、SQL优化、锁、日志、主从复制、读写分离、分库分表十大技术。 1.弄清sql、DB（数据库）、DBMS（数据库管理系 ......
易基因：群体分析揭示了DNA甲基化在番茄驯化和代谢多样性中的作用｜组学研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2023年3月23日，海南大学三亚南繁研究院/热带作物学院博士研究生郭昊等为第一作者、王守创教授为通讯作者在《Science China Life Sciences》杂志发表题为“Population analysis reveals ......
大神之路-起始篇 | 第4章.计算机科学导论之【数据运算】学习笔记
主要讲解存储在计算机中的数据上是如何进行运算，数据的运算可以分为三大类：算术运算、移位运算和逻辑运算。
逻辑运算：计算机中的数据是以位模式存储的，逻辑运算是指那些应用于模式中的一个二进制位，或在两个模式中相应的两个二进制位的相同基本运算，说人话就是分别针对二进制位进行与、或、非、异或等操作。
移位运... ......
自然语言处理: 知识图谱的十年
动动发财的小手，点个赞吧！ NLP 中结合结构化和非结构化知识的研究概况 自 2012 年谷歌推出知识图谱 (KG) 以来，知识图谱 (KGs) 在学术界和工业界都引起了广泛关注 (Singhal, 2012)。作为实体之间语义关系的表示，知识图谱已被证明与自然语言处理（NLP）特别相关，并且在最近 ......
生物医学信息学的重要性和应用领域
生物医学信息学是一个跨学科领域，它结合了生物学、医学、信息学、计算机科学等多个学科的知识和技术。生物医学信息学的重要性主要体现在以下几个方面： 1.2.1 提高研究效率 生物医学信息学的方法和技术可以帮助研究人员更快速、更准确地分析和解释大量生物医学数据，从而提高研究效率。例如，基因组学中的基因预测 ......
保护隐私安全，移动端生物识别技术成新宠
移动信息技术的不断发展，越来越多的人使用手机进行日常生活和工作中的各种操作，如支付、网购、社交等。这也带来了移动安全问题的挑战。为了解决这些问题，移动端生物识别技术应运而生，成为当前移动安全技术的新宠。 一、生物识别技术的基本原理 生物识别技术是指通过对人体生理特征或行为特征进行识别，验证其身份的技 ......
对眼，傻是遗传与基因的问题吗
今天是4月5日，因老家旧房子翻新装修，陪我的母亲去逛石材店铺，在城中村的一家石材店铺，见到一位1米5的老板，挺着大肚子，衣衫不整，他的家中破败不堪，似窝棚搭起的房子中，用纸隔板隔离出了几个房间，他家有3个儿子，无一例外每个儿子都是对眼儿，更有甚至，其中的2个儿子明显傻乎乎的，行为举止有异于常人。 如 ......
生物医学信息学的起源与发展
生物医学信息学（Bioinformatics）是一门研究生物学信息的学科，它起源于20世纪50年代，随着分子生物学的发展，生物医学信息学逐渐成为一门独立的学科。它的发展历程可分为几个阶段： 早期阶段（20世纪50-60年代） 这一阶段的生物医学信息学主要集中在对生物学信息的收集、整理和分析。1953 ......
P3886 [JLOI2009]神秘的生物
第一次接触连通块的插头dp 用最小表示法表示每个连通块，由于数据范围知道连通块最多为5个，所以用8进制即可 状态转移照模板推一推 需要注意的是对于上面来的连通块如果不连通的话需要考虑其是否还有其它地方与下方相连，如果没有则必须在此点往下相连，否则上方那个连通块将被孤立，不符合题意 但是左边而来的连通 ......
易基因： oxRRBS+RRBS揭示炎症性肠病导致发育异常的表观遗传机制｜甲基化研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2020年12月31日，美国明尼苏达大学Natalia Y. Tretyakova教授团队在《Int J Mol Sci》杂志发表题为“Multi-Omics Characterization of Inflammatory Bowel ......
02142数据结构导论复习笔记
第一章 概论 概论⭐⭐ 数据结构：计算机组织数据和存储数据的方式。 数据结构：指一组相互之间存在一种或多种特定关系的数据的组织方式和它们在计算机内的存储方式，以及定义在该组数据上的一组操作。 引言⭐⭐ 算法+数据结构=程序 数据、数据元素和数据项⭐⭐⭐ 数据：所有被计算机存储、处理的对象。 数据元素 ......
易基因-单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 易基因单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序 高通量单细胞DNA甲基化测序简介 单细胞DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术，传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。目前单细胞甲基化研究主要受 ......
单细胞转录组测序数据生物信息分析进展综述
摘要：随着单细胞测序技术的发展，生物信息学在单细胞数据分析方面取得了重要进展。本文将为生物和医学科研工作者介绍单细胞转录组测序数据生物信息分析的进展，重点介绍该领域的最新研究成果和常用软件包。 引言 单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术已经成为研究细胞异质性和功能的重要手段。为了从海量的单细胞 ......
02142数据结构导论-考试大纲思维导图
第一章 第二章 第三章 第四章 第五章 第六章 第七章 思维导图下载地址（MindMaster绘制）： 链接: https://pan.baidu.com/s/1kaoT394M-EG3w05sdC9eqQ?pwd=6060 提取码: 6060 ......
单细胞转录组学：新时代的生物医学研究工具
摘要：单细胞转录组学是一种基于高通量测序技术的单细胞基因表达研究方法。近年来，随着测序技术的快速发展，单细胞转录组学已成为生物医学领域的重要研究手段。本文将介绍单细胞转录组学的基本原理、技术发展、应用以及存在的挑战。 引言 在传统转录组学研究中，研究者通常使用大量细胞的平均基因表达数据。然而，这种方 ......
转录组学：解析基因表达的新视角
摘要：转录组学是一门研究全套转录产物（包括 mRNA、非编码 RNA 和其他 RNA 类型）的科学，旨在揭示基因表达调控机制及其在生物过程和疾病中的功能。本文将对转录组学的发展历程、主要技术方法、研究领域以及面临的挑战进行概述，以期为生物和医学科研工作者提供一个全面的转录组学认识。 1.引言随着高通 ......
算法导论-第2章-算法基础
第2章 算法基础 2.1 插入排序（Insertion sort） 输入：$n$个数的序列$<a_1,a_2,\cdots,a_n>$ 输出：输入序列的一个排列$<a_1^{'},a_2^{'},\cdots,a_n^{'}>$，满足$a_1^{'} \le a_2^{'} \le \cdots \ ......
算法导论-第1章-算法在计算中的作用
第1章 算法在计算中的作用 1.1 算法（Algorithms） 非形式地说，算法（algorithm）是任何明确定义的计算过程，该过程取某个值或值的集合作为输入并产生某个值或某个值的集合作为输出。因此算法就是将输入转换为输出的一系列计算步骤。 Informally, an algorithm is ......
OpenKE:知识图谱表示学习工具包
OpenKE是THUNLP基于TensorFlow,PyTorch开发的用于将知识图谱嵌入到低维连续向量空间进行表示的开源框架。在OpenKE中，我们提供了快速且稳定的各类接口，也实现了诸多经典的知识表示学习模型。该框架易于扩展，基于框架设计新的知识表示模型也十分的方便。具体来说，OpenKE具有如 ......
易基因： m6A RNA甲基化研究的前期探索性实验思路｜干货系列
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 近年来，m6A RNA甲基化作为国家自然科学基金表观遗传学研究的热门领域，相关研究成果层出不穷，高分文章不断。研究方向包括疾病发生发展、发育和分化、环境暴露与响应等。 研究人员为m6A甲基化课题申请作准备以及为降低m6A甲基化实验风险， ......
魔法导论
总是要留下一点什么的吧。 如果运气好没有 AFO 的话会持续更新（划掉）。 下面就记录一点~~没啥用~~的东西。 时间系 败者食尘 一个非常经典的 $Trick$。 由于需要对时间进行回溯，所以考虑使用败者食尘。 当然，败者食尘是不能用来维护数列的，所以线段树必不可少。 具体的，首先用普通线段树维护 ......
【杂谈3】企业中项目管理常见的问题，PMO视角（欢迎大家追加，我将会借此梳理我的知识图谱，总结后输出）
【需求】 1：什么需求都紧急，什么需求都重要。 2：做之前评估很有意义，做完之后效果平平。 3：有些商业指标一直在说优化，投入很多资源。但没次等到上线就出问题，大型活动就降级。出问题就说是别人的问题（无解耦），有效果就是自己的提升。 4：总有需求在项目启动中后期要插入，大领导总认为大家在瞎忙活，他那 ......
易基因：m6A mRNA甲基化修饰调控CTNNB1促进肝母细胞瘤增殖的机制研究｜Mol Cancer
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2019年12月23日，国家儿童医学中心（上海）、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心潘秋辉教授团队在《Molecular Cancer》（IF:41.444/Q1）杂志上发表了题为“m6A mRNA methylation regu ......