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基于短读段的算法中de Bruijn图在错误纠正中的应用
## 基于短读段的算法中de Bruijn图在错误纠正中的应用 在基于短读段的组装和纠错方法中，de Bruijn图被广泛应用于错误纠正过程中[1]。de Bruijn图是一种基于k-mer的图结构，通过将短读段分割成等长的k-mer序列，将每个k-mer作为图中的节点，将相邻k-mer之间的连接关 ......
基于短读段的算法在将短读段比对到长读段上并进行错误纠正时，主要采用以下几种方法
基于短读段的算法在将短读段比对到长读段上并进行错误纠正时，主要采用以下几种方法： 1. 比对和纠错：将同一物种的短读段比对到长读段上，并利用能够比对上的、且错误率低的短读段来进行错误纠正[6]。这种方法通过比对短读段和长读段之间的相似性，识别出长读段中的错误位置，并进行错误纠正。 2. 组装和纠错： ......
神经网络优化篇：如何理解 dropout（Understanding Dropout）
理解 dropout Dropout可以随机删除网络中的神经单元，为什么可以通过正则化发挥如此大的作用呢？ 直观上理解：不要依赖于任何一个特征，因为该单元的输入可能随时被清除，因此该单元通过这种方式传播下去，并为单元的四个输入增加一点权重，通过传播所有权重，dropout将产生收缩权重的平方范数的效 ......
长读段纠错算法综述
长读段纠错算法综述 长读段纠错算法主要分为三种类型[6]： 基于短读段的算法：将同一物种的短读段比对到长读段上，并利用能够比对上且错误率低的短读段进行错误纠正。 基于短读段组装的算法：将长读段比对到同一物种的短读段组装后的de Bruijn图上，以此进行错误纠正。 只基于长读段的算法：采用不同策略， ......
【算法】【线性表】Trapping Rain Water（接水量）
1 题目 Given n non-negative integers representing an elevation map where the width of each bar is 1, compute how much water it can trap after raining. I ......
【算法】【思想】做算法题中的一些思想总结
1 小技巧 // 数字 char 怎么得到它的 int char c = '5'; int num = c - '0' + 1; 2 思想 2.1 给定数的下一个接近的数 比如 241532 的下一个数 242135，主要是思想，从右往左找到第一个出现降序的，找到 15，然后从右边找到第一个比 1 ......
算法学习Day13单调队列和优先级队列
Day13单调队列和优先级队列 By HQWQF 2023/12/25 笔记 239.滑动窗口最大值 给定一个数组 nums，有一个大小为 k 的滑动窗口从数组的最左侧移动到数组的最右侧。你只可以看到在滑动窗口内的 k 个数字。滑动窗口每次只向右移动一位。 返回滑动窗口中的最大值。 进阶： 你能在线 ......
机器学习-无监督机器学习-图聚类-21
目录1. AP聚类算法2. Spectral Clustering 谱聚类 1. AP聚类算法 affinity 相似度 propgaption 传播 exemplars 模范 代表 Affinity Propagation Clustering特别适合高维、多类数据快速聚类，相比传统的聚类算法，该 ......
Go常见限流算法代码
计数器法：https://gitee.com/lymgoforIT/golang-trick/tree/master/08-count-limit-rate令牌桶算法：https://gitee.com/lymgoforIT/golang-trick/tree/master/09-token-buc ......
代码随想录算法训练营第二天 | 239. 滑动窗口最大值，347.前 K 个高频元素
一、239. 滑动窗口最大值 题目链接： LeetCode 239. 滑动窗口最大值 学习前： 思路： 无 学习后： 自定义双端队列，实现push、pop、peek方法，使得队列单调非增。peek方法不变；当入队时，若当前元素比队尾元素大，则pop队尾，直到队列为空或当前元素不大于队尾元素；当出队时 ......
Maven学习笔记 - git-commit-id-plugin插件
转载自：https://blog.csdn.net/mytt_10566/article/details/100116670 参考： 插件GitHub地址：https://github.com/git-commit-id/maven-git-commit-id-plugin git-commit-i ......
网络 - 什么是 CIDR
什么是 CIDR？ 无类别域间路由 (CIDR) 是一种 IP 地址分配方法，可提高互联网上的数据路由效率。每台连接到互联网的计算机、服务器和最终用户设备都有一个与之关联的唯一编号，称为 IP 地址。设备通过使用这些 IP 地址相互查找和通信。组织使用 CIDR 在其网络中灵活高效地分配 IP 地址 ......
网络最大流
关于 vector 存图 很多网上的资料（视频、题解）的最大流算法为了方便找反边，都使用了链式前向星。 但是！ vector 党表示不服！ 于是在进行学习后，笔者归纳出了两种 vector 存图并快速找反边的方法。 存储反边编号 一般 vector 实现邻接表是形如这样的：（在最大流相关算法中） s ......
12.15数学学习笔记——1.1集合的概念
把研究对象统称为元素，把一些元素组成的总体叫做集合。 给定一个集合，那么一个元素在或者不在这个集合中就确定了。 一个给定集合中的元素是互不相同的（集合中的元素是不重复出现的）。 只要构成两个集合的元素是一样的，我们就称这两个集合是相等的。 如果说a是集合A的元素，就说a属于集合A，记作a∈A； 如果 ......
Bellman-Ford Algorithm 算法
一、处理问题：负权值有向图单原点最短路径问题 二、算法描述： 假设带权值有向图中没有包含负权值环。 定义一个距离数组，dist[0...n-1]，dis[i]表示从原点到i的最短路径值 初始化数组，假设一开始在原点src出发，终点为dst，那么dist[src] = 0 遍历所有的有向边，当前遍历边 ......
1.Linux是什么与如何学习
第 1 章 Linux 是什么与如何学习 历史部分略过。 1.2.5 Linux的内核版本 Linux的内核版本编号有点类似如下的样子： 3.10.0-123.el7.x86_64 主版本.次版本.发布版本-修改版本 虽然编号就是如上的方式来编的，不过依据 Linux 内核的发展期程，内核版本的定义 ......
java与算法基础（二） 二分查找
二分查找基本算法 用于查找已排列数组，且一般没有重复数 左闭右开 查找区间为 [ Left , Right ) ,比较Left和Right中间的那个数和Target的。如果中间数大于target,将Left设为Middle-1;如果中间数小于target,将Right设为Middle。 class ......
2023"安洵杯"第六届网络安全挑战赛-Misc WP
dacongのsecret 题目 我的解答： 题目给出一张png图片和一个加密压缩包，压缩包里面还存在另一张jpg图片 看名字就知道是盲水印。由于压缩包里的图片提不出来，因此是单图盲水印，我们使用工具得密码 d@C0ng 1s cUt3!!! 解压得到另一张图片，010分析一下得到一串字符 一眼丁真 ......
Markdown学习
Markdown 学习 标题 control+1-6 字体 Hello, World! 两个星号 Hello, World! 两侧一个星号 Hello, World! 三个 Hello, World! 两个波浪线 引用 可爱小宝最可爱！ 箭头符号空格 分割线 三个星号/减号 图片 超链接 点击跳转到 ......
水星 SG108 PRO/1.0 网络端口镜像 使用流程
水星 SG108 PRO/1.0 网络端口镜像 使用流程 购买链接 https://item.jd.com/100001913315.html 水星智能网管交换机客户端应用程序 1.0.3 https://service.mercurycom.com.cn/download-1830.html 如上 ......
解析RC4加密算法
一、简介 RC4（Rivest Cipher 4）是一种对称加密算法，由Ronald L. Rivest于1987年为其所在的公司RSA Data Security Inc. 开发。作为一种可变密钥长度的序列密码，RC4在加密和解密过程中表现出高效、简洁的特点，被广泛应用于各种网络安全和数据保护场景 ......
2023-2024-1学期20232412《网络空间安全导论》第六周学习总结
教材学习总结 初步认知应用安全在不同领域的应用 了解身份认证与信任管理的方式 认识隐私的定义及隐私保护方法 了解云计算、物联网、人工智能的相关知识 思维导图 教材学习中的问题及解决方法 问题1：对差分隐私的知识不够理解 解决方式：向ChatGPT询问，寻求清晰的解释 问题2：对比特币比较感兴趣，但书 ......
Markdown 语法学习
Markdown学习 标题的添加 一级标题：# 一级标题内容 二级标题：## 二级标题内容 三级标题：###三级标题内容 以此内推 文字格式 划线 ：~~ + 文字内容 + ~~ 粗体文字 ：** + 文字内容 + ** 斜体文字 ：* + 文字内容 + * 斜粗体文 ......
记录两种需要秘钥的加密算法
AES和RSA都是公认为安全的加密算法，在秘钥没有泄露的情况下，几乎不可能被破译（密钥的管理至关重要）。 /** * 对称加密 * * @throws Exception */ public static void AES() throws Exception { KeyGenerator keyG ......
VMware的网络环境
虚拟机网络： 1.检查虚拟机网络编辑器 - 以管理员方式运行VMware - 打开虚拟网络编辑器 - 查看NAT方式下，虚拟子网的网段 流程： 打开VM虚拟机 》选择`Edit`下的`Virtual Network Editor` 》查看NAT方式下，虚拟子网的网段 2.检查虚拟网卡 3.检查虚拟机 ......
EasyCVR无人机推流+人数统计AI算法，助力公共场所人群密度管控
在公园、体育场馆、景区等公共场所，区域人数统计AI算法发挥着重要的作用。通过实时监控各个区域的人数密度，管理人员可以及时采取措施，如分流、限流等，有效防范人员拥挤、踩踏等安全事故的发生。 ......
机器学习笔记（三）简单手写识别
目标 实现一个简单的手写识别的脚本，同样的，流程分五步走： 读入数据 初始化模型 训练模型 训练样本集乱序 校验数据有效性 前期准备 前期需要将库导入，还需要进行一些初始化操作 数据处理部分之前的代码，加入部分数据处理的库 点击查看代码 #加载飞桨和相关类库 import paddle from p ......
网络入门初学第三期
本期重点围绕网络基础协议进行简单讲解 回顾一下上期，我们讲解了各个网络设备的工作原理 那么本期就是在解决我们网络设备直接所存在的问题，和拓展的功能 举个例子，我们一开始手机只作为可以通讯的要求，后面因为时代需求，手机内部有了很多的功能 可以拍照、可以玩游戏等等 你也可以这样子想一个浏览器，一开始只能 ......
首个离散元仿真软件EDEM好学吗？有什么学习技巧？
EDEM是一款首个离散元仿真软件，它被广泛应用于工程领域，特别是在颗粒材料的模拟和分析方面。对于初学者来说，EDEM可能会有一定的学习曲线，但是只要掌握了一些学习技巧，就能够很快上手并熟练运用这款软件。 首先，对于初学者来说，最重要的是要了解EDEM软件的基本原理和功能。可以通过阅读EDEM官方网站 ......