位点 区间 基因snp

从国家基因组科学数据中心下载数据

001、官方网站:https://ngdc.cncb.ac.cn/ 002、入口: 003、输入数据编号: 004、 005、 06、 linux下载说明 ......
数据 基因组 数据中心 基因 科学

【题解】P6292 区间本质不同子串个数

原题链接 区间本质不同子串个数 题目描述 给定一个长度为 $n$ 的字符串 $S$,$m$ 次询问由 $S$ 的第 $L$ 到第 $R$ 个字符组成的字符串包含多少个本质不同的子串。 定义两个字符串 $a,b$ 相同当且仅当 $|a|=|b|$ 并且对于 $i\in[1,|a|]$ 都有 $a_i= ......
题解 区间 个数 本质 P6292

宏基因组学是如何出现的?它的出现对微生物学领域有多大的改变?

宏基因组学是在生物技术和计算机科学的帮助下发展起来的,它的出现可以追溯到上世纪90年代后期。传统微生物学侧重于使用培养方法研究单个微生物菌落,而宏基因组学则通过分析环境中的dna,可以同时研究数百万个微生物群体。这种方法能够提供关于整个微生物群落的结构、功用潜力和相互作用等信息。 宏基因组学对于微生 ......
基因组 微生物学 基因 领域

sequence (牛客多校) (区间包含某个值的最大最小, 和那个东西)

思路: 一步一步的拆解分析 有一个min(al...r) 通过这个东西那么就可以 根据这个ai值分区间, 可以通过单调zhai处理 当然也可以去利用启发式合并处理, 在处理区间的时候, 因为这个有正负, 要分类讨论 正 就是最大 负数 就是最小 遇到区间包含某个值的区间最大最小 那么就利用前缀和+s ......
区间 sequence 东西

JS数字区间比较大小的写法

正确的写法: if (realValue >= 0 && realValue <= 5) { console.log('正确写法'); } 错误的写法: if (0 <= realValue <= 5) { console.log('错误写法'); } ......
写法 区间 大小 数字

P4069 [SDOI2016]游戏 李超线段树 维护区间优势线段的线段树

传送门 #include <iostream> #include <algorithm> #include <cstring> typedef long long ll; typedef std::pair<double, int> PDI; const int N = 1e5, M = 2e5 + ......
线段 区间 优势 P4069 4069

易基因:全基因组CpG密度和DNA甲基化分析方法比较(MeDIP、RRBS和WGBS)| 研究综述

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 CpG密度(CpG density)与各种组织中的DNA甲基化相关。基因组按CpG密度分为:CpG岛(CpG island,CGI)、CpG岛上下游2kb以内的区域(CpG shore ,CpG岛岸)、CpG岛岸上下游2kb以内的区域( ......
基因 基因组 甲基 密度 方法

高通量测序的数据处理与分析指北(二)-宏基因组篇

宏基因组篇 前言 之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理,这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前,我们先来认识一下什么是宏基因组。以我的理解,宏基因组就是某环境中所有生物的基因组的合集,这个环境可以是下水道,河流等自然环境,也可以是人体内肠道,口腔等 ......
基因组 数据处理 基因 数据

poj2750(线段树+复杂区间合并)

Potted Flower POJ - 2750 思路:我们将题目简单化,假设我们要求的是序列的最大连续子段和,且可以包括所有数。 我们的线段树需要维护这段区间的最大前缀和pre,最大后缀和suf,区间和sum,区间连续最大和mx。 那么难点就在于如何由子节点更新父节点。 我们可以知道,tr[p]. ......
线段 区间 2750 poj

区间DP

区间DP 区间类动态规划是线性动态规划的扩展,它在分阶段地划分问题时,与阶段中元素出现的顺序和由前一阶段的哪些元素合并而来有很大的关系。 例题 石子合并 洛谷1880 #include<bits/stdc++.h> using namespace std; int n,i,j,k,l,ma,mi,a ......
区间

线段树(单点修改,区间查询)

题目描述 如题,已知一个数列,你需要进行下面两种操作: 将某一个数加上 x 求出某区间每一个数的和 输入格式 第一行包含两个正整数 n,m,分别表示该数列数字的个数和操作的总个数。 第二行包含 n 个用空格分隔的整数,其中第 i 个数字表示数列第 i 项的初始值。 接下来 m 行每行包含 33 个整 ......
线段 区间

寻找连续区间 华为OD机试

本期题目:寻找连续区间 题目 给定一个含有 N 个正整数的数组, 求出有多少个连续区间(包括单个正整数), 它们的和大于等于 x 。 输入 第一行两个整数 N x (0 < N <= 100000 ,0 <= x <= 10000000) 第二行有 N 个正整数(每个正整数小于等于 100 )。 输 ......
区间

高维数据惩罚回归方法:主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据

全文链接:http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告,包括一些图形和统计输出。 在本文中,我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
数据 高维 基因 弹性 成分

线段树区间和,区间修改,区间查询板子

#include <bits/stdc++.h> using namespace std; using LL = long long; #define lson (nd<<1) #define rson (nd<<1|1) #define mid (l+r>>1) const int N = 1e5 ......
区间 线段 板子

易基因:METTL3介导的m6A甲基化谱调控肌肉干细胞成肌细胞状态转换|发育分化

2020年9月29日,《Cell Death Discovery》(IF: 7.109)杂志发表了题为“A defined N6-methyladenosine (m6A) profile conferred by METTL3 regulates muscle stem cell/myoblast ......
干细胞 甲基 基因 肌肉 细胞

hdu-4533(线段树+区间合并)

约会安排 HDU - 4553 跟hdu-1540(线段树+区间合并) - 魏老6 - 博客园 (cnblogs.com)是一样,但是要写两个线段树。 线段树维护,最长前缀pre,最长后缀suf,以及最大连续连续区间sum。 1代表空,0代表时间被占了 还有几个注意事项: 当是DS时,只能查询和修改 ......
线段 区间 4533 hdu

单细胞转录组分析新篇章:挖掘人类胚胎基因表达的神秘密码

在这份报告中,我们使用了更新的Scanpy软件包对同一数据集(GEO number GSE109555)单细胞数据进行分析。相较于鄙人2021年发表的论文《Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in ......
单细胞 新篇 新篇章 胚胎 基因

leetcode56.合并区间-java

1 class Solution { 2 public int[][] merge(int[][] intervals) { 3 /* 4 思路:左区间排序,若intervals[i][0] >= intervals[i-1][1]; 则重叠 5 将重叠区间新建放入res数组里,没重叠则放入原数组 ......
区间 leetcode java 56

线段树历史区间最值

前情提要 本来是想去打可持久化线段树的,然后发现线段树还有一个类型,就先去打这个了,没想到一打就是一周啊QAQ。 P6242 【模板】线段树 3 1 l r k:对于所有的 $i\in[l,r]$,将 $A_i$ 加上 $k$($k$ 可以为负数)。 2 l r v:对于所有的 $i\in[l,r] ......
线段 区间 历史

poj-3367(线段树+区间合并)

Hotel POJ - 3667 思路:与hdu-1540(线段树+区间合并) - 魏老6 - 博客园 (cnblogs.com)类似,只不过是区间修改,多维护一个最大连续区间sum。 #define _CRT_SECURE_NO_WARNINGS 1 #include<algorithm> #in ......
线段 区间 3367 poj

【牛客小白月赛70】A-F题解【小d和超级泡泡堂】【小d和孤独的区间】【小d的博弈】【小d和送外卖】

比赛传送门:https://ac.nowcoder.com/acm/contest/53366 难度适中。 🎈 作者:Eriktse 🎈 简介:19岁,211计算机在读,现役ACM银牌选手🏆力争以通俗易懂的方式讲解算法!❤️欢迎关注我,一起交流C++/Python算法。(优质好文持续更新中…… ......
题解 泡泡堂 区间 泡泡 A-F

石子合并 - 区间 DP

石子合并 - 区间动态规划 题意 设有 $N$ 堆石子排成一排,其编号为 $1 \sim N$。 每堆石子有一定的质量,可以用一个整数来描述,现在要将这 $N$ 堆石子合并成为一堆。 每次只能合并相邻的两堆,合并的代价为这两堆石子的质量之和,合并后与这两堆石子相邻的石子将和新堆相邻,合并时由于选择的 ......
区间 石子 DP

区间合并 acwing803

link code #include<bits/stdc++.h> using namespace std; typedef long long ll; int main(){ int n; int ans = 1, tpr = 0; vector<pair<int,int>>v; int l, r ......
区间 acwing 803

易基因:群体分析揭示了DNA甲基化在番茄驯化和代谢多样性中的作用|组学研究

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2023年3月23日,海南大学三亚南繁研究院/热带作物学院博士研究生郭昊等为第一作者、王守创教授为通讯作者在《Science China Life Sciences》杂志发表题为“Population analysis reveals ......
甲基 多样性 番茄 基因 群体

hdu-1540(线段树+区间合并)

Tunnel Warfare HDU - 1540 思路: 没被摧毁的村庄为1,否则为0,用len记录 线段树维护区间的两个信息: 前缀最长1的序列pre 后缀最长1的序列suf 父节点与左右子节点的关系: //lc为左节点,rc为右节点 1.若左右结点都不满1,则tr[p].pre = tr[lc ......
线段 区间 1540 hdu

K倍区间

link 代码 #include<iostream> using namespace std; const int N = 100010; int cnt[N]; int main(){ int n, k; cin >> n >> k; long long ans = 0; long long su ......
区间

代码随想 day36 435. 无重叠区间 | 763.划分字母区间 | 56. 合并区间

给定一个区间的集合,找到需要移除区间的最小数量,使剩余区间互不重叠。 注意: 可以认为区间的终点总是大于它的起点。 区间 [1,2] 和 [2,3] 的边界相互“接触”,但没有相互重叠。 示例 1: 输入: [ [1,2], [2,3], [3,4], [1,3] ] 输出: 1 解释: 移除 [1 ......
区间 随想 字母 代码 day

区间和线段树封装模板

区间和线段树封装模板,开箱即用 注意:线段树大小最多支持$2^{30}-1$个数 声明方法: SegSumTree<typename>st,typename为线段树存储的类型(建议只填写整数类型),建立一颗空线段树,后续必须先用rebuild或resize初始化 SegSumTree<typenam ......
线段 区间 模板

Disjoint-Set-Union Sum (诈骗题)(区间DP, 位置顺序!!!!)

题目大意: 给出一个序列P , n 个点 每次可以选择2个 相邻区间进行合并, 会产生一个贡献值,当然合并n-1就合并完了, 问在所有的情况下, 贡献和是多少 思路: 易错点: 这个所有情况, 你枚举的合并的那个先后顺序是有关系的!!! 因此直接去区间dp只能把各个合并的情况给弄出来,但是他的先后顺 ......

hdu-5306(区间最值+线段树)

hdu Gorgeous Sequence HDU - 5306 题意: 给定一个长度为n的区间,做m次操作,三种操作 对于序列[L,R]区间中的每个a~i~,用min(a~i~,x)替换。 打印序列[L,R]区间的最大值 打印序列[L,R]区间和 因为区间和与区间最值无关,所以无法直接用简单的标记 ......
线段 区间 5306 hdu