坐标 碱基 基因组 基因
[转]地心地固坐标系-WGS84坐标系-东北天坐标系-以及坐标系转换
本文转自：https://zhuanlan.zhihu.com/p/383633619 一、简介 1.1 ECEF坐标系 也叫地心地固直角坐标系。其原点为地球的质心，x轴延伸通过本初子午线（0度经度）和赤道（0deglatitude）的交点。 z轴延伸通过的北极（即，与地球旋转轴重合）。 y轴完成右 ......
shader 一步一步 日记累月 ----极坐标
学习shader 就是在考察 数学知识极坐标 复习一下极坐标的点的位置是靠theta（角度）和r(距离)两个信息（二维空间） shader： // 直角坐标转极坐标方法 float2 RectToPolar(float2 uv, float2 centerUV) { uv = uv - center ......
ES--地理坐标查询
所谓的地理坐标查询，其实就是根据经纬度查询，官方文档：https://www.elastic.co/guide/en/elasticsearch/reference/current/geo-queries.html 常见的使用场景包括： 携程：搜索我附近的酒店 滴滴：搜索我附近的出租车 微信：搜索我 ......
ECharts极坐标散点图：如何展示数据分布情况
Laravel是一个流行的PHP框架，它具有出色的可测试性，可以帮助开发人员在更短的时间内编写可靠的代码。但是，即使使用了这个框架，也可能会出现测试覆盖率较低的情况。测试覆盖率是指代码中已由测试案例覆盖的部分比例。测试覆盖率越高，代码质量越高。在本文中，我们将分享几种技巧，帮助您提高Laravel应 ......
如何在ECharts中使用极坐标系展示数据
Laravel是一个流行的PHP框架，它具有出色的可测试性，可以帮助开发人员在更短的时间内编写可靠的代码。但是，即使使用了这个框架，也可能会出现测试覆盖率较低的情况。测试覆盖率是指代码中已由测试案例覆盖的部分比例。测试覆盖率越高，代码质量越高。在本文中，我们将分享几种技巧，帮助您提高Laravel应 ......
格网点坐标转栅格(极地格网渲染)
需求 要将25km的格网4326点坐标转换为栅格图层以便进行渲染查看 解决办法 首先，得明确4326坐标为地理坐标系，而25km为投影坐标单位。 所以，如果要保证分辨率为25km×25km，我们需要将地理坐标转成投影坐标系，在进行点转栅格，像元大小填25000，即可完美将点转换为栅格。 ......
GIS坐标系与投影
GIS坐标系与投影 笛卡尔坐标系 空间直角坐标系 空间直角坐标系是指坐标原点位于参考椭球的中心，Z轴指向参考椭球的北极，X轴指向起始子午面与赤道的交点， Y轴位于赤道面与X轴成90度夹角，并指向东， 形成右手系。 空间直角坐标系有右手系和左手系的区分: 右手系 右手系有两种表示方法， 第一种是利用三 ......
根据两点坐标和半径返回圆点坐标
GetCircleCenter(x1,y1,x2,y2,r){ let c1 = (x2 * x2 - x1 * x1 + y2 * y2 - y1 * y1) / (2 * (x2 - x1)); let c2 = (y2 - y1) / (x2 - x1); let A = c2 * c2 + ......
Trends in Plant Science | 王向峰老师综述数据驱动的基因组设计育种
目录摘要将生物数据和知识转化为植物的精准设计育种机器学习（ML）在植物生物学中的应用案例研究：多组学数据关联研究（MODAS）中的数据降维（DR）亮点总结 今天简单回顾下中国农业大学王向峰教授团队2023年上半年发表在Trends in Plant Sicence的综述文章。该文阐释系统全面，值得赏 ......
机器学习应用于基因组预测，以苜蓿为例
目录目的示例代码表型文件预处理基因型文件预处理机器学习建模预测绘图其他结果 利用代码复现一个机器学习应用于基因组预测的项目，张志武老师于2023年发表在《园艺研究》上的一篇文章。 目的 使用 GWAS 和 GP 结合重测序数据和从世界各地收集的 220 份紫花苜蓿种质的秋季休眠（Fall dorma ......
由基因型-组织表达项目（GTEx）联想开去
近日，由丹麦奥胡斯大学、华南农业大学、中国农科院基因组所、美国农业部、马里兰大学、爱丁堡大学和等多家单位联合发起的猪基因型-组织表达计划（PigGTEx）取得阶段性进展，成功构建猪基因型-组织表达图谱，相关文章 “A compendium of genetic regulatory effects ......
Omics辅助育种统计方法：基因组遗传力
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节： Genomic heritability。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提取生物学意义。研究目标是利用高维度 ......
GS | Ben Hayes报告：基因型数据基础
本报告是Ben Hayes和Hans Daetwyler合著。 关于Ben Hayes，前文已经介绍。详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基 ......
GS | Ben Hayes的基因组选择课程
关于Ben Hayes详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基因组计划的发起者。在牲畜、作物、牧场和水产养殖物种的遗传改良方面拥有丰富的研究经 ......
GS | Julius报告：基因组预测的准确性
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
GS | Julius报告：利用基因组信息预测遗传变化
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
Matlab plot画图 坐标字体、字号、范围、间隔等的设置
坐标轴显示间隔设置： x = (1:50); y = sin(x); plot(x,y,'-r*'); xlabel('x name');% x轴名称 ylabel('y name'); legend('xxx'); %线条注释,多条的话:legend('xxx','xxx2','xxx3'） xl ......
20-有参转录组实战6-差异基因绘制火山图
#本教程仿自于B站的15天入门生物信息视频，若有疑惑请以视频为准。若侵请联。 #上一个教程我们得到了genes.counts.matrix.OE_vs_WT.DESeq2.DE_results文件，接下来对差异基因绘制火山图，我们这一步在Windows系统上的R进行即可，若需要安装Windows的R ......
echars x轴坐标显示不全处理方式
显示不全的效果 xAxis中添加 axisLabel: { //x轴文字的配置 show: true, interval: 0,//使x轴文字显示全 } axisLabel中添加以下进行格式化 axisLabel: { //x轴文字的配置 show: true, interval: 0,//使x轴文 ......
三维模型的几何坐标纠正应用探讨
三维工厂K3DMaker是一款三维模型浏览、分析、轻量化、顶层合并构建、几何校正、格式转换、调色裁切等功能专业处理软件。可以进行三维模型的网格简化、纹理压缩、层级优化等操作，从而实现三维模型轻量化。轻量化压缩比大，模型轻量化效率高，自动化处理能力高；采用多种算法对三维模型进行几何精纠正处理，精度高，... ......
三维模型数据的几何坐标变换的点云重建并行计算技术方法分析
三维工厂K3DMaker是一款三维模型浏览、分析、轻量化、顶层合并构建、几何校正、格式转换、调色裁切等功能专业处理软件。可以进行三维模型的网格简化、纹理压缩、层级优化等操作，从而实现三维模型轻量化。轻量化压缩比大，模型轻量化效率高，自动化处理能力高；采用多种算法对三维模型进行几何精纠正处理，精度高，... ......
【Maven】Maven作用、Maven仓库、Maven坐标、Maven常用命令、Maven依赖管理和依赖范围
Maven作用（提供了一套标准化的项目结构；提供了一套标准化的构建流程；提供了一套依赖管理机制）、Maven仓库、Maven坐标、Maven常用命令（IDEA中Maven命令的使用；Maven Helper插件；Maven生命周期）、Maven依赖管理和依赖范围 ......
matlab 绘图坐标轴设置
matlab 坐标轴设置： 简单的曲线：y=sin (x); %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% x=-pi/2:0.01:pi/2; y=sin(x); plot(x,y); %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 上面的图坐标轴 ......
三维模型数据的几何坐标变换的点云重建并行计算技术方法分析
三维工厂K3DMaker是一款三维模型浏览、分析、轻量化、顶层合并构建、几何校正、格式转换、调色裁切等功能专业处理软件。可以进行三维模型的网格简化、纹理压缩、层级优化等操作，从而实现三维模型轻量化。轻量化压缩比大，模型轻量化效率高，自动化处理能力高；采用多种算法对三维模型进行几何精纠正处理，精度高，... ......
求相对坐标轴的AABB包围盒大小
abs(旋转矩阵) * halfSize可以用来求相对坐标轴的AABB包围盒halfSize。 下面的代码也能求出AABB包围盒的size。 public static Vector2 GetAABBSize(Vector2 boxHalfSize, B2_Mat22 rot) { Vector2[ ......
blender 纹理坐标 生成vs物体
建议看视频：https://www.bilibili.com/video/BV1HA411r7om 生成：物体边界范围的左下角为原点，按世界坐标算距离 物体：将物体原点做原点，按世界坐标算距离 UV：按UV尺度算距离 反射：光线从摄像头中心射出，射到物体面上反射，若反射后的光线朝向z轴则为蓝色，y轴 ......
python GDAL 经纬度转像素坐标（包括投影坐标）
# -*- encoding: utf-8 -*- from osgeo import gdal from osgeo import osr import numpy as np def getSRSPair(dataset): ''' 获得给定数据的投影参考系和地理参考系 :param datas ......
易基因｜全基因组DNA甲基化测序（WGBS）揭示衰老对肝再生的表观基因组调控机制
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 众所周知，衰老会对肝脏再生产生影响。随着时间的推移，肝脏再生能力显著下降。肝脏体积、血流量和代谢等肝脏生理参数，以及损伤后的再生能力在人类和模型系统中均在老年时表现出下降，其中涉及许多分子机制，包括DNA甲基化依赖性基因组重塑。那么DN ......
三种地球坐标系的区别
WGS-84：是国际标准，GPS坐标（Google Earth使用、或者GPS模块） GCJ-02：中国坐标偏移标准，Google Map、高德、腾讯使用 BD-09：百度坐标偏移标准，Baidu Map使用 具体解释： WGS84坐标系 即地球坐标系，国际上通用的坐标系。 设备一般包含GPS芯片或 ......