坐标 碱基 基因组 基因

3-基因家族的鉴定-基于Windows系统上的HMMER

下面讲如何在windows系统上用HMMER做基因家族的鉴定: 1, 下载 我们电脑首先要有个迅雷,然后复制这个链接,用迅雷打开(http://hmmer.janelia.org/static/binaries/hmmer3.0_windows.zip),下载到本地,解压。 2, 案例分析 HMME ......
基因 家族 Windows 系统 HMMER

2-基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast

下面讲如何在windows系统上用blast做基因家族的鉴定: 1,下载 在NCBI网站上下载blast工具“https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download” 点击进入ftp ......
基因 家族 windows 系统 blast

搭建GDAL JAVA环境;DXF转KML;坐标转换;PROJ: proj_create_from_database 错误解决

搭建JAVA GDAL环境 GDAL是一个栅格和矢量地理空间数据格式的转换库,由开源地理空间基金会按照MIT开源协议发布。作为一个库,它向应用程序为所有支持的数据格式提供统一的栅格抽象数据模型和矢量抽象数据模型。它还提供了用于数据转换和处理的各种有用的命令行实用工具。 GDAL官网: GDAL — ......

库卡机器人坐标系修改

库卡机器人坐标系临时赋值 .dat文件 &ACCESS RVP&REL 24DEFDAT right_frameDECL FRAME RIGHT_SIDE = {X -10173.6,Y -2136.14,Z 496.633,A 180.0,B 0.0,C 90.0}ENDDAT .src文件 &A ......
坐标系 坐标 机器人 机器

Cocos Creator 教程 : 坐标系统

主要简单讲解下坐标系统,由于Creator是基于Cocos2dx,也就是使用OpenGL的坐标系,即原点在屏幕左下角,x轴向右,y轴向上。然后讲解下本地坐标与世界坐标,最后讲下坐标转换。 点击链接加入群聊【unity/cocos交流二群】 坐标系 基于OpenGL坐标,也就是原点在屏幕左下角,x轴向 ......
坐标 Creator 教程 系统 Cocos

易基因:oxBS揭示口腔鳞癌的启动子区甲基化和羟甲基化变化及基因差异表达|项目文章

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 口腔鳞状细胞癌(Oral squamous cell carcinoma, OSCC)是世界范围内最常见的癌症类型之一。尽管已有研究表明5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, 5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxym ......
甲基 基因 口腔 差异 项目

结论:绕固定坐标轴旋转与绕自身坐标轴旋转一致性

总结一下就是,如果是坐标系或者向量绕着固定的坐标轴旋转,相当于每转一次产生一个旋转矩阵,然后按旋转顺序将这些旋转矩阵左乘起来.如果是坐标系或者向量绕着自身的坐标轴旋转,相当于每转一次产生一个旋转矩阵,然后按旋转顺序将这些矩阵右乘起来.要注意后者的每一步旋转产生的旋转矩阵,不要以世界坐标系为基准去算, ......
坐标轴 坐标 一致性 结论

相机坐标转换为世界坐标的几点注意

1、先进行工具标定,使用6点法进行标定 2、定好工作平台上的4个点位,取工具的中心点(如:刀中心点)为对标点 3、在世界坐标系下,切换到工具坐标,移到4个点位,姿态没有要求,使工具中心点分别与4个点位对齐,记录数值。 ......
坐标 相机 世界

【misc】[CISCN 2021初赛]robot --流量包数据提取,坐标画图

打开附件的流量包 可以发现有很多的tcp协议数据,追踪tcp协议数据看看 可以发现tcp数据流中有很多类似坐标的东西,先把这些数据另存为txt保存,如何用正则表达式提取这些数据,提取脚本如下: import re with open("data.txt", "r", encoding="utf-8" ......
初赛 坐标 流量 数据 CISCN

ACGTU 碱基的英文相关

远古文。当个搬运工。 最近生物课学了 ACGTU 一堆碱基,名字更是 confusing,鸟嘌呤、胸腺嘧啶……突发奇想这些的英文是什么? 腺嘌呤:adenine 胞嘧啶:cytosine 鸟嘌呤:guanine 胸腺嘧啶:thymine 尿嘧啶:uracil 然后可以发现前四个的英文名称都有 -in ......
碱基 ACGTU

三维模型几何坐标偏差修正(纠正)的常用方法分析

三维工厂K3DMaker是一款三维模型浏览、分析、轻量化、顶层合并构建、几何校正、格式转换、调色裁切等功能专业处理软件。可以进行三维模型的网格简化、纹理压缩、层级优化等操作,从而实现三维模型轻量化。轻量化压缩比大,模型轻量化效率高,自动化处理能力高;采用多种算法对三维模型进行几何精纠正处理,精度高,... ......
偏差 坐标 几何 模型 常用

数学基础:三角形重心坐标插值公式的证明

在快速Phong明暗处理(Blinn-Phong明暗处理)时,出现了三角形重心坐标插值公式,但没有给出证明. 网上也鲜有证明过程,这里给出证明. 问题描述:在三角形ABC中,三顶点A、B、C坐标分别为\((x_1,y_1,z_1)、(x_2,y_2,z_2)、(x_3,y_3,z_3)\). 则三角 ......
数学基础 三角形 坐标 重心 公式

易基因:oxBS揭示复发性膀胱癌的DNA甲基化和羟甲基化变化并鉴定预测PD-L1表达标记物

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 近日,徐州市中心医院(徐州医科大学徐州临床学院)史振铎等为第一作者、韩从辉教授为通讯作者在《Biomarker Research》杂志发表题为“Integrative multi-Omics analysis depicts the m ......
甲基 膀胱癌 膀胱 基因 标记

易基因:综合全基因组DNA甲基化和转录组学分析鉴定调控骨骼肌发育潜在基因 | 研究进展

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化是骨骼肌发育中关键的表观遗传调控机制。但胚胎鸭骨骼肌发育中负责DNA甲基化的调控因子仍然未知。 2023年10月23日,南京农业大学动物科技学院于敏莉副教授团队在《Int J Mol Sci》杂志发表题为“The Integ ......

js 计算两个地点坐标之间的间距

/** * 计算两个地点坐标之间的间距 * @param {array} location1 [lon: string, lat: string] 地点坐标 * @param {array} location2 [lon: string, lat: string] 地点坐标 */ export fu ......
间距 坐标 地点 之间 两个

易基因:MeRIP-seq+ChIP-seq等揭示m6A甲基化在休眠期转录休眠调控中的潜在功能

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 发育通常被认为是遗传程序的顺序展开,复杂程度不断提高,并按固定轨迹随时间进行。然而,调整发育时间可以提高在不利条件下的存活率。在哺乳动物中,这表现为胚胎停育。在小鼠胚泡和胚胎干细胞中,通过抑制mTOR表达以及对Myc转录因子的抑制可诱导 ......
甲基 基因 潜在 MeRIP-seq seq

View坐标系和Clip坐标系

OpenGL中的坐标系统:https://zhuanlan.zhihu.com/p/354200548 NDC:Normalized Device Coordinates。所谓的PerspectiveProjection 其实就是将顶点从view 坐标系下,转换到NDC下(https://zhuan ......
坐标系 坐标 View Clip

fgui 怎么将"UI空间下的世界坐标"转换成"fgui空间下的世界坐标( global pos )" cocoscreator坐标转换

嗨~ 如果本文对你有帮助,点个推荐吧!这样能让文章在搜索中更靠前,帮助到更多有需要的人! 首先通过坐标系转换一步步地进行计算我尝试过,但卡在了将 屏幕坐标转换为fgui空间的全局坐标上。 但发现了一个巧妙的做法。 // 随便的一个 Cocoscreator 的 Node var anyCCUINod ......
坐标 quot 世界 空间 fgui

坐标转换:从图像坐标到世界坐标的旅程

本文来自公众号“AI大道理”。 —————— ​ 三维空间中的点如何一一对应到图像上? 图像上的点又如何反映射到三维空间的点上? 这就涉及世界坐标到像素坐标的转换。 1、坐标系 确定空间某点的三维几何位置与其在图像中对应点之间的相互关系,必须建立相机成像的几何模型,这些坐标系之间的转换参数就是相机参 ......
坐标 旅程 图像 世界

T2T组装时代的多基因组比对MGA

多基因组比对 (multiple genome alignment, MGA)首先要定义多序列比对 (multiple sequence alignment, MSA)。MSA 是将同源关系分配给 3 个或更多序列的方法(对于 2 个序列,使用“成对”而非“多个”),其中一组核苷酸是同源的,如果它们 ......
基因组 基因 时代 T2T MGA

哪个才是首个(中国)大豆的T2T基因组版本?

目录主要结果主要方法数据策略工具问题来了 2023年9月29日,哈尔滨工业大学王亚东团队联合中国农科院韩天富团队在bioRxiv发表了题为“A telomere-to-telomere genome assembly of Zhonghuang 13, a widely-grown soybean ......
基因组 大豆 基因 版本 T2T

植物基因组学和作物改良中的深度学习

目录深度学习:概念、工具和注意事项沿着分子生物学的中心法则进行深度学习DNA和基因特性蛋白质特性模型和数据共享理解基因组变异:从关联到因果关系和分子机制深度学习育种4.0:编辑育种结论 植物基因组学取得了巨大进步,其特点是高通量技术的爆炸式增长,以低成本识别多维全基因组分子表型。更重要的是,基因组学 ......
基因组 作物 基因 深度 植物

康奈尔大学生物信息中心主任关于基因组组装报告

Dr. Qi Sun是康奈尔大学高级研究员和生物信息学中心主任,长期以来从事生物信息学工作,在大数据的管理与分析上,特别是Genotype-By-Sequence (GBS),RNA-seq,ChIP-seq,small RNA,基因调控网络等方面积累了丰富的经验。在Science,Cell,Nat ......
基因组 基因 主任 生物 报告

基因注释软件SNAP的安装

001、下载软件包: 官网:http://korflab.ucdavis.edu/software.html 002、下载安装包、及安装 wget -c http://korflab.ucdavis.edu/Software/snap-2013-11-29.tar.gz tar -xzf snap- ......
注释 基因 软件 SNAP

threejs的坐标渲染和着色

点击查看代码 function createBasic() { // 目标:了解顶点坐标绘制正方形 // 1. 准备 BufferGemotry 缓冲几何图形 // 2. 准备 32 位浮点数的数组,定义矩形的顶点位置 // 3. 准备 BufferAttribute 属性缓冲对象,保存几何图形的属 ......
坐标 threejs

易基因:家禽中的DNA甲基化研究应用(繁殖性状+肌肉发育+疾病+产蛋量等)

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,参与动物细胞分化、胚胎发育、基因组印记和性染色体失活等生物学过程。随着DNA甲基化测序变得越来越复杂,用它来解决更多的动物学问题成为可能。2023年11月5日,华南农业大学动物遗传育种与繁殖系聂庆 ......
产蛋量 性状 家禽 甲基 基因

左右手坐标系以及逆时针正方向的判断

A 判断三维坐标系旋转正方向的简单方法_x y z三个轴的方向图片-CSDN博客 判断三维坐标系旋转正方向的简单方法 引言 做iOS开发,不免要接触到一些特效,其中不乏3D特效,这时候就要对iOS所使用的坐标系了解才行。若不限于iOS开发,还有MacOS开发,若不知道它们所使用坐标系的不同,初学者会 ......
坐标系 逆时针 左右手 坐标 方向

matplotlib网格坐标刻度

matplotlib网格坐标刻度 目录matplotlib网格坐标刻度概要网格设置坐标轴坐标轴范围双坐标轴反转坐标轴坐标轴的位置刻度主次刻度颜色大小角度样式刻度标签文本刻度密度中文乱码处理参考资料 概要 plt.title() # 标题 plt.grid() # 网格 plt.xlabel() # ......
刻度 网格 坐标 matplotlib

基因表达谱数据分析简介

基因表达谱数据分析是一种研究基因表达模式的技术,它可以帮助科学家了解基因在不同情况下的表达情况。什么是基因表达谱数据分析?基因表达谱数据分析是一种研究基因表达模式的技术,它可以帮助科学家了解基因在不同情况下的表达情况。它可以帮助科学家了解基因在不同情况下的表达情况,从而更好地理解基因如何影响生物体的 ......
数据分析 基因 简介 数据

牛客[编程题]坐标移动

https://www.nowcoder.com/questionTerminal/119bcca3befb405fbe58abe9c532eb29 public class Program { public static void Main() { string line; while ((lin ......
坐标