基因组 基因 玉米 地点
python爬虫------------旅游的地点的爬取和可视化
选题背景 我国旅游行业的极速发展，因为之前疫情原因，使得国内旅游成为新风潮，由于国内疫情控解封，使得中国成为最先开放旅游的国家， 本次项目可视化就是分析国内旅游的数据，分析适合出行旅游的时间与地点信息。 设计方案 1.向目标网络发送请求 2.获取数据 网页源码 3.筛选我们需要的数据 网页源代码 4 ......
易基因：小檗碱通过介导m6A mRNA甲基化调控斑马鱼肝细胞氧化应激、凋亡和自噬
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 中药小檗碱（Berberine，BBR，化学式C20H18NO4）是从几种药用植物中分离出的一种异喹啉季生物碱，包括小檗（Berberis aristata）和黄连（Coptis chinensis）。小檗碱可改善脂质代谢紊乱诱导的细胞 ......
R：Wilcoxon秩和检验，比较两组样本中的基因表达差异
setwd("E:\\20220927宏基因组教学\\02后期分析\\05willcox")library(doBy)gene <- read.table('table.l5.relative-SE.txt', sep = '\t', row.names = 1, header = TRUE, st ......
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析 吕利王晓利张文娟韩芝侠 宝鸡文理学院电子电气工程学院 摘要：目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷，并提出改进措施，以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法，包括基于“校正后组装”策略的FA ......
基于长读的基因组重复序列查找技术研究
基于长读的基因组重复序列查找技术研究 郭睿 深圳大学 摘要：基因组中出现两次或者两次以上基本相同的序列称为重复序列。重复序列信息可以用来可以分析物种的进化,减少基因比对歧义,降低序列拼接数据缺失。与标准重复序列库对比,基于短读序列数据的重复序列查找技术得到的结果并不完整,平均长度较短。长读数据平均长 ......
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究 姜涛 哈尔滨工业大学 摘要：随着测序技术的不断成熟和广泛应用,以测序技术为驱动的基因组、转录组等多组学的研究得到了跨越式发展,推动了基因组科学、遗传学、临床医学等多学科的变革。基因组变异检测作为基因组研究中最为核心和关键的环节,对于基因组注释、与疾病和 ......
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现 何欣雨 北京交通大学 摘要：基因测序的意义是使人类从根本上认知疾病发生的原因,做到正确的治疗疾病、尽早的预防疾病。例如肿瘤和红斑狼疮等疾病都是和基因变异有关,如果能过通过测序技术知道变异点,对精准治疗,攻克难题有重大意义。第三代测序技术是Pac ......
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要：随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要：随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
易基因：全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点｜mBio
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 细菌编码许多转录因子（transcription factor，TF），这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶（RNAP）全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对TF功能的研究几乎集中 ......
速递：惠州学院生科院副院长谢海伟一行莅临易基因科技参观交流
2023年05月26日上午，惠州学院生命科学学院副院长谢海伟教授、陈兆贵教授、陈勇智博士、龚浩博士及生科院本科毕业生陈佳良一行5人莅临深圳市易基因科技有限公司参观交流，并举行“惠州学院实践教学基地“挂牌仪式。易基因总经理王君文、副总经理丁振东等公司领导出席。 交流会现场 “惠州学院实践教学基地“挂牌 ......
使用hiblup计算基因频率和基因型频率
001、测试数据 (base) [root@PC1 test]# ls ## 测试数据， plink格式 outcome.map outcome.ped (base) [root@PC1 test]# cat outcome.map 1 snp1 0 55910 1 snp2 0 85204 1 s ......
2023-05-27 量学基础 十八个涨停基因（转）
涨停基因（十四）——大阳双休（双阴洗盘） 涨停基因（十五）——双剑霸天地 涨停基因（十六）——梯四变异 涨停基因（十七）——现场直憋 涨停基因（十八）——咬住峰顶线 涨停基因（十五）——双剑霸天地 一、双剑霸天地的形态。 双剑霸天地的形态是指：首先出现一根带有长上影线的价柱，长上影线的长度大于价柱总 ......
易基因：MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在结直肠癌PD-1免疫治疗中的作用｜Gut
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 结直肠癌（colorectal cancer ，CRC）是全球最常见的癌症之一，转移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫检查点阻断（Immune checkpoint blockade，ICB）对CRC患者表现出良好疗效，然而只有一 ......
易基因：全基因组DNA甲基化分析揭示DNMT1在斑马鱼模型听觉系统发育中的作用 | 胚胎发育
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 听力障碍通常与内耳发育不全或损伤有关，是影响生活质量的严重健康问题。因此研究听觉器官发生过程中的关键基因对于探索听力损伤的潜在策略至关重要。斑马鱼模型在理解内耳发育不良和相关疾病的分子遗传学原理方面得到了越来越多的应用，内耳发育包括遗传 ......
玉米根际微生物可分解土壤有机质、促进植物的养分吸收，还可以做什么？
除了分解土壤有机质和促进植物的养分吸收，玉米根际微生物还可以发挥以下功能： 生物控制植物病原菌：一些根际微生物具有抗菌活性，可以抑制植物病原菌的生长和繁殖，从而减少植物病害的发生。这些有益微生物可以通过竞争营养资源、产生抗生素和产生抗菌物质等方式发挥生物防治的作用。 促进植物生长激素的合成：一些根际 ......
玉米根系分泌物
玉米根系分泌物是指在植物根系周围与土壤微生物和土壤中其它成分交互作用的过程中由根部释放的一些化合物。这些化合物包括有机物质、激素、氧化还原物、酶和氨基酸等。它们不仅对玉米的生长发育和产量影响显著，而且也对土壤微生物群落及生物多样性起着重要的作用。 玉米根系分泌物的主要功能如下： 促进植物的生长发育 ......
Linux 中 shell 脚本实现根据gff统计每一个基因的转录本数目
001、生成基因名称的列表 awk -F "\t" '$3 == "gene" && $NF ~ /gene=/ {print $NF}' chr1.gff | sed 's/\(.*\)\(gene=[^;]\+\)\(.*\)/\2/' | sort | uniq > gene.list 002 ......
玉米的根系微生物
当涉及到宏基因组的研究时，微生物群落是一个非常重要的话题。玉米的根系与其中的微生物密切相关，以下是一些关于玉米根系微生物的信息： 玉米根系区域的微生物群落主要包括细菌和真菌等多种微生物。 这些微生物可分解土壤有机质、促进植物的养分吸收及固氮等。 研究表明，玉米根系区域微生物群落随栽培时间而变化，并受 ......
玉米不同生长发育时期的根系微生物群落不同
近年来，越来越多的研究表明，根系微生物群落与植物在不同生长发育时期之间存在着密切的关联。尤其是对于玉米这类重要经济作物来说，了解其不同生长发育阶段的根系微生物群落变化规律对于其高产优质的种植具有重要意义。 在早期生长发育阶段，玉米根系主要受到诸如放线菌门、拟杆菌门和链霉菌门等细菌的影响，这些细菌能够 ......
玉米生长的第四周、第六周、第八周、第十周取材
在进行玉米根系微生物群落的宏基因组分析时，选取不同生长发育阶段的样本是非常重要的。通常选择第四周、第六周、第八周和第十周这几个时间点比较常见，原因如下： 首先，玉米在不同生长发育阶段会受到不同类型的环境影响，包括生长条件、土壤pH值、氮素含量等，这些因素可能会对根系微生物群落的组成产生重要影响，因此 ......
玉米基因型不同导致其根系微生物群落不同
当进行宏基因组分析时，我们发现不同的玉米基因型可能会导致其根系微生物群落的不同。这种群落的变化可能与许多环境因素相关，例如土壤pH值、温度、湿度和养分含量等。 然而，最近的研究表明，玉米基因型也可能对其根系微生物群落的形成产生影响。例如，在一项研究中，研究人员对20个不同玉米基因型进行了分析，并通过 ......
玉米的生长发育V1、V2、V4、V6、V10、V12时期分别对应着生长发育的第几周
玉米的生长发育周期通常与V1、V2、V4、V6、V10和V12等标志性生长期相关联。这些“V”代表不同的可见生长点（或叫叶片发育阶段），其对应的生长时间如下所示： V1：一片真叶展开，生长时间为3-4周。 V2：两片真叶展开，生长时间为3-4周。 V4：四片真叶展开（包括两片颖叶），生长时间为3-4 ......
不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析
标题：不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析 摘要： 本研究旨在探究吉林省农科院不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组特征。通过种植三块地，每块地一半种植B73玉米材料，另一半种植Mo17玉米材料，并设置三个生物学重复。分别在第四周、第六周、第八周和第十周采集土壤样本进行测序，以获取 ......
吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析
标题：吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析 摘要： 本研究旨在通过对吉林省农科院不同地点种植的B73和Mo17玉米材料进行宏基因组分析，探究它们在不同时间点和地点的土壤微生物群落组成和功能潜力差异。通过在三个地点种植三块地，每块地一半种植B73玉米材料，另一半种植Mo17玉米材料 ......
Booking.com如何在毫秒内搜索数百万个地点
译自：How Booking.com Searches Through Millions of Locations in Milliseconds Booking.com是一家与酒店、旅馆、度假租赁等相关的在线旅行社。每个月都有数亿用户通过访问该网站来寻找合适的度假住宿。Booking的一个主要特性 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
速递：易基因科技应邀在广东药科大学生物信息系讲课分享表观遗传学研究技术
2023年5月8日上午，深圳市易基因科技有限公司高级技术总监王君文应邀至广东药科大学医药信息工程学院生物信息系开展关于“基因组学时代：表观遗传学研究及DNA甲基化技术介绍”的线下讲座。讲座由生物信息系副主任任重鲁主持，众多学生积极响应参与。 表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表 ......