基因组 基因 玉米 地点
基因、基因家族和通路之间的关系
基因、基因家族和通路之间的关系如下： 基因（Gene）： 基因是DNA上的一段编码信息，它指导生物体合成特定的蛋白质或RNA分子。基因是生物体遗传信息的基本单位，每个基因编码了一个或多个蛋白质或RNA的特定序列。基因具有多样性，因为同一基因可以在不同个体中存在不同的等位基因，导致生物体的遗传多样性。 ......
基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)
目录BSA的发展BSA分析框架BSA流程及影响因素BSA的群体BSA的算法BSA的软件BSA遗传群体、算法和软件的对应关系 BSA作为基因组学中基因挖掘的三板斧之一，最大优点是高效、经济、简便。通过选择双亲群体分离后代中具有极端表型的个体进行混样，然后比较不同极端混样池之间的多态性并结合表型进行目标 ......
P3287 [SCOI2014] 方伯伯的玉米田
首先每次选择的区间结尾都可以换成 \(n\)，仍然保持单调不降，我们就按这个策略拔高玉米。 令 \(f_{i,j}\) 表示 \(1\sim i\) 这段前缀进行了 \(j\) 次操作，第 \(i\) 株玉米不被拔掉，所能剩下最多的玉米数量： \[f_{i,j}=\max\{f_{p,q}|p<i, ......
NAC-EXPANSIN模块通过控制珠心消除来提高玉米籽粒大小
玉米早期胚乳发育与母源的胚核组织消除协调进行。然而，底层机制在很大程度上是未知的。在这里，我们表征了一个主要的玉米籽粒大小和重量的数量性状位点，编码了一个EXPANSIN基因，ZmEXPB15。编码的β-扩展蛋白特异地在胚核中表达，并通过促进胚核的消除来积极控制籽粒的大小和重量。我们进一步展示了两个 ......
易基因： MeRIP-seq等揭示组蛋白乙酰化和m6A修饰在眼部黑色素瘤发生中的互作调控｜肿瘤研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白去乙酰化抑制剂(HDACis)在多种恶性肿瘤中显示出令人鼓舞的结果。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是最普遍的mRNA修饰，在肿瘤发生调控中起重要作用。然而，对组蛋白乙酰化和m6A RNA修饰之间的互作研究仍然未知。 2023年7月19 ......
玉米籽粒性状：HKW，KL，KT，KTW，KW
HKW - 百粒重（Hundred Kernel Weight）：这是指每百粒玉米籽粒的重量，通常以克（g）为单位。百粒重是一个衡量玉米籽粒大小和重量的指标，对于品种选择和产量评估非常重要。 KL - 长度（Kernel Length）：KL通常指玉米籽粒的长度，通常以毫米（mm）为单位。籽粒长度也 ......
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因，这里使用Y书的clusterProfiler包。 这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因： library(R.utils) R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto") hsa ......
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因，这里使用Y书的clusterProfiler包。 这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因： library(R.utils) R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto") hsa ......
易基因： WGBS等揭示DNA甲基化调控林地草莓植株高度和果实大小的分子机制｜植物发育
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化影响基因组稳定性、转座子沉默和基因表达；它主要发生在对称CG和CHG以及不对称CHH (H = A, C或T)中的胞嘧啶上。RNA介导的DNA甲基化(RNA-directed DNA methylation，RdDM)通路调 ......
软件测试报告办理地点流程介绍，第三方软件测试报告收费如何？
软件测试报告的费用 一、软件测试报告可以在哪里办理 对于软件的测试报告的办理，一般可以在自己城市的软件测评中心办理。测评中心是由政府主导，所以在测试内容方面会更加严苛，某些测试项目可能不会通过，而且测试费用都比较高，会超过预算。 除此之外，业界统一认为：找专业的第三方软件测试机构办理是最佳的选择 ......
泛基因组助力作物育种改良
目录结构变异SV基于单个参考基因组鉴定SV通过构建泛基因组来鉴定SV转座元件与作物改良的相关性利用pan-genome进行QTL定位和GWAS利用pan-genome进行基因组预测泛基因组应用育种的挑战与机遇多倍体基因组的复杂性研究不足的作物基因组资源快速驯化新物种 结构变异SV 基于单个参考基因组 ......
wright-fisher模型下遗传漂变基因固定的证明
# background 最近我导兴致大起准备进行组间交流开展群体遗传学的读书交流会，为了贪图内容的简易我先选了遗传漂变的部分 但并不是说要水过，多少要有点b格。 在遗传漂变的部分里有一个重要的模型Wright-Fisher 模型，很多群体遗传学教科书都会提到这个模型，但是关于该模型中的一个细节 假 ......
玉米表型数据，KL,ERN,KT,CC,MRDV,SCMV分别代表什么
KL：Kernel Length（粒子长度） - 这通常指的是玉米粒的长度，是玉米品质和产量方面的重要性状之一。 ERN：Ear Number（穗数） - 这可能表示每株玉米植株上的穗数，也是产量和生长特性的一项重要指标。 KT：Kernel Thickness（粒子厚度） - 这可能指的是玉米粒的 ......
易基因：MLL1/DNA低甲基化介导子宫肌层干细胞发育重编程的表观遗传机制｜组学研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 子宫肌瘤（uterine fibroids，UF）是生殖系统最常见的良性肿瘤，也是子宫切除手术最常见的指征。尽管患病率很高，但子宫肌瘤的确切发病机制在很大程度上仍未知。有证据表明，发育期间暴露于激素可能与子宫肌层易感UF发育有关，当发育 ......
基因芯片数据分析一般可以执行哪些程序
基因芯片数据分析通常包括以下程序： 1. 数据预处理：对原始芯片数据进行质控、去噪和归一化处理，确保数据的准确性和可比性。 2. 差异表达分析：通过比较不同条件下的基因表达水平，找出在不同条件下显著差异表达的基因。 3. 功能富集分析：将差异表达的基因进行功能注释和分类，然后使用统计方法判断哪些功能 ......
参考基因组准备
> 参考：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247483738&idx=1&sn=bd57965cf960293837671b315b35c4d4&chksm=9b4841e1ac3fc8f7d4102f1b07abce8d ......
易基因：MeRIP-seq等揭示mRNA m6A甲基化调控拟南芥的抗寒性分子机制｜植物抗逆
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 植物通过改变数千个基因的mRNA丰度以促进其生理和代谢过程，从而对低温应激进行响应。在转录后水平上，这些冷应激应答转录本经历可变剪接、microRNA介导的调控和可变多腺苷酸化等。最近研究表明，m6A、m5C等RNA修饰可以影响RNA调 ......
salmon快速基因和转录本定量 | isoform
参考前篇：可变剪切 | isoform | PSI | 单细胞 | suppa | salmon salmon的定量是不基于序列比对的 Salmon基因定量是一种常用于RNA测序（RNA-seq）数据分析的方法，其原理是利用贝叶斯统计模型从RNA-seq reads中预测不同转录本或基因的表达量。 ......
探索基因与精神分裂症的关联：一段个人科研之旅
## 引言 当我第一次听说弗里德曼博士通过研究发现了与精神分裂症有关的CHRAN7基因，我被深深吸引了。作为一名致力于遗传学和精神病学研究的科学家，我知道这是一个巨大的突破。但是，这个发现背后的科学是如何运作的呢？我决定深入了解其中的细节，并与大家分享我的发现。 ## 高通量测序 vs. 全基因组测 ......
易基因：De novo组装和转录组表征：东方田鼠原发性卵巢癌机制新见解｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2022年，中南大学湘雅医学院周智君教授团队在Mol Med Rep发表了题为" De novo assembly and transcriptome characterization: Novel insights into the ......
车间设备互联，实现设备状态的可视化，就是打造工厂的数字化基因，是企业实现数字化、智能化转型升级的基础
车间设备互联，实现设备状态的可视化，就是打造工厂的数字化基因，是企业实现数字化、智能化转型升级的基础 ......
CHR24基因相关研究进展
目前做的基因 protein chromatin remodeling 24 蛋白质染色体重塑 拟南芥编号 AT5G63950 CHR24基因是什么？ Chr 是什么？ 误区①chromosome 染色体 chr 染色体简称 ②（医学）R24抗体 结合后形成ch-R24 CHR chromatin ......
销售基因链 题解
[销售基因链](https://www.luogu.com.cn/problem/P9196) ### 题目大意 给定 $n$ 个字符串，长度总和为 $m$，进行 $q$ 次询问，每次询问给定两个字符串 $p,s$，问所有的字符串中以 $p$ 为前缀且以 $s$ 为后缀的有多少个。 ### 思路分析 ......
易基因：WGBS等揭示丹参甲基化表征及DNA甲基化在丹参酮生物合成中的调控机制｜科研速递
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 丹参（Salvia miltiorrhiza，S. miltiorrhiza）是一种具有重要经济价值和药用价值的模式药用植物，丹参的根会合成一组称为丹参酮（tanshinone）的二萜类亲脂性生物活性成分。丹参酮的生物合成和调控引起广泛 ......
宏基因组共现网络分析
引言 宏基因组学是研究环境中各种微生物群体（包括细菌、真菌等）的所有基因的集合，它已成为植物学领域中的重要工具。宏基因组数据的分析对于理解微生物的功能和相互作用至关重要。Co-occurrence Network是一种用于组织和分析孤立数据的方法。它可以将多个基因或序列组织成一个网络，其中节点代表基 ......
易基因：MeRIP-seq等揭示ALKBH5介导m6A去甲基化调控皮肤创面再上皮化分子机制
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 哺乳动物的损伤皮肤屏障完整性恢复通过创面愈合基本机制实现，这是一个包括凝血、炎症、再上皮化（re-epithelialization）、肉芽组织形成和疤痕重塑的多步骤过程。再上皮化是决定创面成功愈合的重要因素，再上皮化受损是创伤、糖尿病 ......
查找地点 销售 Apple Store 商店、Apple 授权经销商和 企业经销商
查找地点 销售 Apple Store 商店、Apple 授权经销商和 企业经销商 销售 - 查找地点 - Apple ......
查找地点 服务 Apple Store 商店，Apple 授权服务提供商和 企业客户服务商
查找地点 服务 Apple Store 商店，Apple 授权服务提供商和 企业客户服务商 服务 - 查找地点 - Apple ......
基于机器学习的基因组预测
[toc] ## 机器学习与GP 与动物育种相比，植物的基因组选择必须通过环境相互作用来考虑更大的基因型，并且需要添加适当的多环境试验数据。 机器学习 （ML） 和深度学习 （DL） 算法比线性预测模型更复杂，可以发现数据集中的非线性关系。与以前的方法相比，随机森林、支持向量机和人工神经网络由于其非 ......
单一个体参考基因组的局限性
001、 在种质资源的群体变异与性状挖掘研究中, 通常需要借助1个参考基因组, 通过将重测序数据比对到参考基因上来鉴定个体间的遗传变异(Huang et al.,2012)。这种变异鉴定的方法受制于参考基因组序列及其与检测个体间的相似性, 参考基因组缺失的基因组信息以及与比对个体差异较大区域的信息将 ......