甲基 基因 口腔 差异

易基因|一种全新的检测DNA羟甲基化的技术:ACE-Seq

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑做组学科研服务的易基因。今天给大家介绍一种全新的检测DNA羟甲基化的技术:APOBEC-coupled epigenetic sequencing,简称【ACE-seq】。 前言 DNA序列中胞嘧啶(C)5’ 碳位结合一个甲基基团而转变成5mC的现象称为DNA基 ......
甲基 基因 ACE-Seq 全新 技术

微生物测序:应用于人类肠道微生物组具有菌株分辨率的高通量单微生物基因组学

Microbe-seq: high-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.1 ......
微生物 菌株 基因组 肠道 基因

文件读取顺序差异

Linux(Ubuntu): ![image](https://img2023.cnblogs.com/blog/1165804/202306/1165804-20230607132109044-2128614193.png) Windows: ![image](https://img2023.cn ......
顺序 差异 文件

易基因:小檗碱通过介导m6A mRNA甲基化调控斑马鱼肝细胞氧化应激、凋亡和自噬

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 中药小檗碱(Berberine,BBR,化学式C20H18NO4)是从几种药用植物中分离出的一种异喹啉季生物碱,包括小檗(Berberis aristata)和黄连(Coptis chinensis)。小檗碱可改善脂质代谢紊乱诱导的细胞 ......
斑马鱼 小檗 甲基 斑马 基因

R:Wilcoxon秩和检验,比较两组样本中的基因表达差异

setwd("E:\\20220927宏基因组教学\\02后期分析\\05willcox")library(doBy)gene <- read.table('table.l5.relative-SE.txt', sep = '\t', row.names = 1, header = TRUE, st ......
样本 基因 Wilcoxon 差异

数据库结构差异如何处理?navicat 结构同步工具

操作 如何对比线上数据库,线上数据库无法直连时可以下载表结构,创建一个可以直接访问的数据库。然后开启对比 navicat 帮助文档 结构同步(只限于完整版本)Navicat 让你以详细分析的进程比对及修改表结构。換句话说, Navicat 比对两个数据库和/或模式之间的表及显示其结构的差異处。从主菜 ......
结构 差异 navicat 数据库 工具

bat脚本在C:\Program Files (x86)使用普通权限运行与使用管理员权限运行获取当前路径的差异

bat脚本在C:\Program Files (x86)使用管理员权限运行获取当前路径不对。 bat脚本如下: @echo off set "current_dir=%cd%" echo Current directory: %current_dir% set "filepath=%current_ ......
权限 脚本 路径 差异 管理员

VUE2/3差异之模板写法

Options API (选项API) 传统的组件随着业务复杂度越来越高,代码量会不断的加大,整个代码逻辑都不易阅读和理解。虽然尽量一个文件不要写太多代码(1000行内),但总有一些大型组件要一个文件写很多代码 优点:各选项编写写位置固定,结构清晰缺点: 代码组织性差,相似的逻辑代码不便于复用 逻辑 ......
写法 差异 模板 VUE2 VUE

基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析

基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析 吕利王晓利张文娟韩芝侠 宝鸡文理学院电子电气工程学院 摘要:目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷,并提出改进措施,以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法,包括基于“校正后组装”策略的FA ......
基因组 算法 基因 数据

基于长读的基因组重复序列查找技术研究

基于长读的基因组重复序列查找技术研究 郭睿 深圳大学 摘要:基因组中出现两次或者两次以上基本相同的序列称为重复序列。重复序列信息可以用来可以分析物种的进化,减少基因比对歧义,降低序列拼接数据缺失。与标准重复序列库对比,基于短读序列数据的重复序列查找技术得到的结果并不完整,平均长度较短。长读数据平均长 ......
基因组 序列 基因 技术

面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究

面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要:随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
序列 组长 算法 基因 片段

基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究

基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究 姜涛 哈尔滨工业大学 摘要:随着测序技术的不断成熟和广泛应用,以测序技术为驱动的基因组、转录组等多组学的研究得到了跨越式发展,推动了基因组科学、遗传学、临床医学等多学科的变革。基因组变异检测作为基因组研究中最为核心和关键的环节,对于基因组注释、与疾病和 ......
基因组 方法研究 变异 基因 结构

基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现

基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现 何欣雨 北京交通大学 摘要:基因测序的意义是使人类从根本上认知疾病发生的原因,做到正确的治疗疾病、尽早的预防疾病。例如肿瘤和红斑狼疮等疾病都是和基因变异有关,如果能过通过测序技术知道变异点,对精准治疗,攻克难题有重大意义。第三代测序技术是Pac ......
基因组 算法 基因 MECAT

基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究

基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要:随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
基因组 变异 算法 基因 关键

易基因:全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点|mBio

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 细菌编码许多转录因子(transcription factor,TF),这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶(RNAP)全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对TF功能的研究几乎集中 ......
基因 位点 基因组 因子 细菌

《kubernetes 系列》4. etcd 的安装、命令行操作,以及 etcd v2 和 v3 的差异

### 楔子 **通过前面两篇文章,我们已经对 etcd 有了一个基本的了解,那么接下来就要安装 etcd 了。安装完之后,再来全面介绍 etcd 的语法,etcd 的功能还是很强大的。** **下面就来安装 etcd。** ### 安装 etcd **先说一下配置,首先操作系统是 CentOS 7 ......
etcd kubernetes 差异 命令 v2

mysql快速对比两个数据库表名的差异

2023年5月29日14:51:02 因为正式库老是和测试库有差1-2张表,表也有100张了,排除差异有点麻烦 ``` SELECT table_name FROM information_schema.TABLES WHERE table_schema = '数据库名' ``` 这样就得到两个数据 ......
差异 两个 数据库 数据 mysql

速递:惠州学院生科院副院长谢海伟一行莅临易基因科技参观交流

2023年05月26日上午,惠州学院生命科学学院副院长谢海伟教授、陈兆贵教授、陈勇智博士、龚浩博士及生科院本科毕业生陈佳良一行5人莅临深圳市易基因科技有限公司参观交流,并举行“惠州学院实践教学基地“挂牌仪式。易基因总经理王君文、副总经理丁振东等公司领导出席。 交流会现场 “惠州学院实践教学基地“挂牌 ......
惠州学院 基因 院长 一行 学院

使用hiblup计算基因频率和基因型频率

001、测试数据 (base) [root@PC1 test]# ls ## 测试数据, plink格式 outcome.map outcome.ped (base) [root@PC1 test]# cat outcome.map 1 snp1 0 55910 1 snp2 0 85204 1 s ......
基因 频率 hiblup

2023-05-27 量学基础 十八个涨停基因(转)

涨停基因(十四)——大阳双休(双阴洗盘) 涨停基因(十五)——双剑霸天地 涨停基因(十六)——梯四变异 涨停基因(十七)——现场直憋 涨停基因(十八)——咬住峰顶线 涨停基因(十五)——双剑霸天地 一、双剑霸天地的形态。 双剑霸天地的形态是指:首先出现一根带有长上影线的价柱,长上影线的长度大于价柱总 ......
基因 基础 2023 05 27

易基因:MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在结直肠癌PD-1免疫治疗中的作用|Gut

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 结直肠癌(colorectal cancer ,CRC)是全球最常见的癌症之一,转移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫检查点阻断(Immune checkpoint blockade,ICB)对CRC患者表现出良好疗效,然而只有一 ......
直肠癌 直肠 基因 MeRIP-seq 作用

功能安全、预期功能安全与信息安全的差异与协同

今天的汽车行业面临最大的挑战之一,就是从过去基于硬件的车辆过渡到软件定义汽车的时代。当软件成为造车行业发展的主要领域,越来越多的OEM和零部件供应商逐步转型为软件公司。汽车也单纯的从出行工具变成了移动的计算机,汽车的开发越来越像在四个轮子上去开发车载电脑。 随着智能网联汽车的快速发展,新技术不断涌现 ......
功能 差异 信息

小程序技术助力中小银行差异化营销竞争

建设数据中台、技术人才招募和投资……在数字浪潮中,近年来,大中型银行走上了探索的前列,找到了转型和发展的大渠道。越来越多的中小银行在数据管理领域不断努力,积极构建以数字为导向的业务模式,将数字化转变作为外部监管需求和内部发展需求。 在过去几十年里,中国的银行业经历了快速增长和改革开放红利期,成为全球 ......
差异 中小 银行 程序 技术

macOS下由yarn与npm差异引发的Electron镜像地址读取问题

记录macOS下由yarn与npm差异引发的Electron镜像地址读取问题 写在前面:该问题仅仅出现在Linux和macOS上,Windows上不存在该问题! # 初始背景 最近笔者重新拾起了Electron,把最新版Electron的官方文档阅读了一遍。众所周知,Electron作为依赖在安装的 ......
Electron 差异 镜像 地址 问题

易基因:全基因组DNA甲基化分析揭示DNMT1在斑马鱼模型听觉系统发育中的作用 | 胚胎发育

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 听力障碍通常与内耳发育不全或损伤有关,是影响生活质量的严重健康问题。因此研究听觉器官发生过程中的关键基因对于探索听力损伤的潜在策略至关重要。斑马鱼模型在理解内耳发育不良和相关疾病的分子遗传学原理方面得到了越来越多的应用,内耳发育包括遗传 ......
斑马鱼 基因 基因组 胚胎 甲基

为什么不能向下兼容呢?这是因为不同版本的 Refs 文件系统之间可能存在较大的差异,如接口变化、BUG 修复、功能添加等方面

Refs 文件系统是在 Windows Server 2012 R2 引入的,目前主要用于 Windows 服务器操作系统中。截至目前为止,Windows 服务器操作系统中已经支持了三个版本的 Refs 文件系统: Refs V1:Windows Server 2012 R2 中引入的第一代 Ref ......
差异 接口 方面 之间 版本

SVN 导出改动差异文件

[toc] # SVN 导出改动差异文件 ## 应用场景/背景介绍 > 当然下面的两个场景介绍可能用分支管理都会有不错的效果,或者更优,只是记录一下思路,用什么还是看大家个人爱好啦 在开发过程中偶尔会遇到有 bug 不知道具体问题出在哪,需要一步步删减代码去分析 - 我的常见操作是备份一份代码,在找 ......
差异 文件 SVN

Midjourney|文心一格prompt教程[进阶篇]:Midjourney Prompt 高级参数、各版本差异、官方提供常见问题

# Midjourney|文心一格prompt教程[进阶篇]:Midjourney Prompt 高级参数、各版本差异、官方提供常见问题 # 1.Midjourney Prompt 高级参数 ## Quality 图片质量是另一个我比较常用的属性,首先需要注意这个参数并不影响分辨率,并不改变分辨率, ......
Midjourney 文心 常见问题 差异 常见

IDP 与 DevOps平台:相似之处与关键差异

软件开发是一个复杂而动态的过程,涉及许多工具、技术和实践。为了更快、更好地交付软件,开发人员需要有效地协作,自动执行任务,并管理环境。然而,由于软件架构的日益复杂,工具和平台的多样性,以及对安全和合规性的要求越来越高,软件开发变得极具挑战。 为了更好地应对开发挑战,企业根据自身情况分别选择内部开发者 ......
差异 关键 DevOps 平台 IDP

Linux 中 shell 脚本实现根据gff统计每一个基因的转录本数目

001、生成基因名称的列表 awk -F "\t" '$3 == "gene" && $NF ~ /gene=/ {print $NF}' chr1.gff | sed 's/\(.*\)\(gene=[^;]\+\)\(.*\)/\2/' | sort | uniq > gene.list 002 ......
数目 脚本 基因 Linux shell