甲基 基因 口腔 差异
易基因：全基因组CpG密度和DNA甲基化分析方法比较（MeDIP、RRBS和WGBS）| 研究综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 CpG密度（CpG density）与各种组织中的DNA甲基化相关。基因组按CpG密度分为：CpG岛（CpG island，CGI）、CpG岛上下游2kb以内的区域（CpG shore ，CpG岛岸）、CpG岛岸上下游2kb以内的区域（ ......
TiDB与MySQL的SQL差异及执行计划简析
TiDB作为NewSQL，其在对MySQL（SQL92协议）的兼容上做了很多，MySQL作为当下使用较广的事务型数据库，在IT界尤其是互联网间使用广泛，那么对于开发人员来说，1）两个数据库产品在SQL开发及调优的过程中，都有哪些差异？在系统迁移前需要提前做哪些准备？ 2）TiDB的执行计划如何查看，... ......
使用Sentieon加速甲基化(WGBS)分析
全基因组甲基化测序(WGBS)是一种研究DNA甲基化的方法，以全面了解在基因组水平上的表观遗传变化。在进行WGBS数据分析时，通常需要使用专门的比对工具，因为这些工具需要能够处理亚硫酸盐转化后的数据。 以下是四个不同的WGBS比对分析流程： Bismark：Bismark是一个基于Bowtie2或H ......
学习笔记403—两样本差异的统计学比较方法-假设检验
一：背景 这几天重新复习了一下以前经典的假设检验方法。包括之前使用excel来做一些简单的统计分析。 假设检验(hypothesis test)亦称显著性检验(significant test)，是统计推断的另一重要内容， 其目的是比较总体参数之间有无差别。假设检验的实质是判断观察到的“差别”是由抽 ......
高通量测序的数据处理与分析指北(二)-宏基因组篇
宏基因组篇 前言 之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理，这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前，我们先来认识一下什么是宏基因组。以我的理解，宏基因组就是某环境中所有生物的基因组的合集，这个环境可以是下水道，河流等自然环境，也可以是人体内肠道，口腔等 ......
percona-toolkit工具：使用pt-table-checksum检查MySQL主从库的差异
环境介绍 CentOS 7.6MySQL 5.7Percona Toolkit 3.4.0 下载并安装Percona Toolkit 从WEB端下载 https://www.percona.com/downloads 或者通过wget下载 [root]# wget https://downloads ......
考虑充电需求差异性的电动汽车协同充放电调度方法
考虑充电需求差异性的电动汽车协同充放电调度方法 摘要：代码提出了一种微电网中电动汽车的协调充电调度方法，以将负荷需求从高峰期转移到低谷期。 在所提出的方法中，基于充电紧迫性指标选择电动汽车的充电模式，该指标可以反映不同的充电需求。 然后，建立协调充电调度优化模型，以最小化整体峰谷负荷差异。 对慢速充 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
易基因：METTL3介导的m6A甲基化谱调控肌肉干细胞成肌细胞状态转换｜发育分化
2020年9月29日，《Cell Death Discovery》（IF: 7.109）杂志发表了题为“A defined N6-methyladenosine (m6A) profile conferred by METTL3 regulates muscle stem cell/myoblast ......
对比两个目录之间的差异！！！！
Linux怎么对比两个目录的差异 原创 入门小站 入门小站 2023-03-31 23:14 发表于湖北 收录于合集#Linux756个 入门小站 分享运维技巧及10k+Stars的开源项目 234篇原创内容 公众号 【Linux250个常用命令速查手册】关注【入门小站】，后台回复 「1001」 自 ......
单细胞转录组分析新篇章：挖掘人类胚胎基因表达的神秘密码
在这份报告中，我们使用了更新的Scanpy软件包对同一数据集（GEO number GSE109555）单细胞数据进行分析。相较于鄙人2021年发表的论文《Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in ......
易基因：群体分析揭示了DNA甲基化在番茄驯化和代谢多样性中的作用｜组学研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2023年3月23日，海南大学三亚南繁研究院/热带作物学院博士研究生郭昊等为第一作者、王守创教授为通讯作者在《Science China Life Sciences》杂志发表题为“Population analysis reveals ......
ORACLE数据库中ORACLE_SID与INSTANCE_NAME的差异
ORACLE数据库中ORACLE_SID与INSTANCE_NAME在概念和意义上有什么异同呢？下面简单来总结概况一下，很多时候，不少人都搞不清楚两者的异同，甚至认为两者是等价的。 ORACLE_SID与INSTANCE_NAME的异同 ORACLE_SID参数是操作系统的环境变量，用于和操作系统进 ......
对眼，傻是遗传与基因的问题吗
今天是4月5日，因老家旧房子翻新装修，陪我的母亲去逛石材店铺，在城中村的一家石材店铺，见到一位1米5的老板，挺着大肚子，衣衫不整，他的家中破败不堪，似窝棚搭起的房子中，用纸隔板隔离出了几个房间，他家有3个儿子，无一例外每个儿子都是对眼儿，更有甚至，其中的2个儿子明显傻乎乎的，行为举止有异于常人。 如 ......
TODO 我一直有个疑问, 视频编码 是否可以利用两帧之间的差异来保存起来,然后压缩整体视频
#疑问 如何使用ffmpeg来查看类似的数据? #工具 一、ffmpeg ffmpeg属于GPL或者LGPL，确切属于哪一种，要根据编译选项，因为它里面的库有些属于GPL的有些属于LGPL的，你编译的时候打开或者关闭这些库的选项，就决定了它属于哪一种。 http://www.ffmpeg.org/l ......
易基因： oxRRBS+RRBS揭示炎症性肠病导致发育异常的表观遗传机制｜甲基化研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2020年12月31日，美国明尼苏达大学Natalia Y. Tretyakova教授团队在《Int J Mol Sci》杂志发表题为“Multi-Omics Characterization of Inflammatory Bowel ......
易基因-单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 易基因单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序 高通量单细胞DNA甲基化测序简介 单细胞DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术，传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。目前单细胞甲基化研究主要受 ......
转录组学：解析基因表达的新视角
摘要：转录组学是一门研究全套转录产物（包括 mRNA、非编码 RNA 和其他 RNA 类型）的科学，旨在揭示基因表达调控机制及其在生物过程和疾病中的功能。本文将对转录组学的发展历程、主要技术方法、研究领域以及面临的挑战进行概述，以期为生物和医学科研工作者提供一个全面的转录组学认识。 1.引言随着高通 ......
易基因： m6A RNA甲基化研究的前期探索性实验思路｜干货系列
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 近年来，m6A RNA甲基化作为国家自然科学基金表观遗传学研究的热门领域，相关研究成果层出不穷，高分文章不断。研究方向包括疾病发生发展、发育和分化、环境暴露与响应等。 研究人员为m6A甲基化课题申请作准备以及为降低m6A甲基化实验风险， ......
[转载]git 对比两个分支差异
1. 显示出branch1和branch2中差异的部分 git diff branch1 branch2 --stat 2. 显示指定文件的详细差异 git diff branch1 branch2 具体文件路径 3. 显示出所有有差异的文件的详细差异 git diff branch1 branch ......
易基因：m6A mRNA甲基化修饰调控CTNNB1促进肝母细胞瘤增殖的机制研究｜Mol Cancer
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2019年12月23日，国家儿童医学中心（上海）、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心潘秋辉教授团队在《Molecular Cancer》（IF:41.444/Q1）杂志上发表了题为“m6A mRNA methylation regu ......
飞腾与鲲鹏性能差异的一些思考
飞腾与鲲鹏性能差异的一些思考 背景 自己在进行stress-ng以及sysbench的测试验证时发现: 飞腾的性能要比鲲鹏的性能有非常大的差距. 最近同事在现场也进行了压测, 也发现飞腾的性能不是特别好. 这里想简单总结一下自己学习过的资料,尝试分析一下为何差异这么大. 制程 注意 制程采用台积电发 ......
SARS-CoV-2、SARS-CoV (2003)及RaTG13病毒株的S(Spike)蛋白氨基酸序列差异
在NCBI网站上得到SARS-CoV (2003)、SARS-CoV-2及RaTG13的S蛋白氨基酸序列 在clustal Omega进行比对，下面是结果 ......
易基因：肠道菌群：早产儿出生后不同时间点肠道微生物定植的动态变化｜项目文章
易基因微生物组学测序分析成果见刊《Front Microbiol》 2023年02月17日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所Adnan Khan、云南省第一人民医院米弘瑛为共同第一作者，中山大学附属第六医院郝虎/李思涛、南方医科大学附属佛山市妇幼保健院戴怡蘅为论文共同通讯作者在《Front Mic ......
问卷分析笔记（1）——差异性分析（卡房、独立T、单因素）、分层回归
今天学习的几个名词以及应用场景介绍一下。 介绍可能不全面，但是在论文中用到的频率比较高。 差异性分析 首先要搞明白什么叫差异性分析。简单来说，想比较两组数据或者多组数据之间，数据的差异。常见的有卡方检验/独立样本t检验/方差分析（主要是单因素方差分析）。 卡方检验：类别对类别变量 独立样本t检验：二 ......
由“交卷”功能引发的思考——对比两个字符串数组的差异
最近在做一个答题系统，在交卷的时候需要判断客观题的答题情况 客观题的题型有单选题、多选题、判断题 其中判断题可以当做单选题处理，而单选题也可以当做标准答案长度为一的多选题 所以最终只需要实现多选题的判定即可 一、需求分析 将标准答案和考生回答分别记为字符串数组 standard 和 answer 经 ......
华为OD机试 统计差异值大于相似值二元组个数
:rocket: 本期题目：统计差异值大于相似值二元组个数 :mag: 题目 题目： 对于任意两个正整数 A 和 B ，定义它们之间的差异值和相似值： 差异值：A、B 转换成二进制后，对于二进制的每一位，对应位置的bit值不相同则为1，否则为0; 相似值：A、B 转换成二进制后，对于二进制的每一位， ......
SARS-Cov-2参考病毒株Wuhan-Hu-1的基因序列与基因结构
NCBI查找相关 进入查找到的内容 点击FASTA查看序列 点击Gpraphics查看基因结构 ......
关于 join、not exists、not in的用法和性能差异
好的，以下是关于JOIN、NOT EXISTS和NOT IN的用法和性能差异的长总结： 1. JOIN JOIN是将两个或多个表中的行连接起来形成一个新的表的操作，通常使用JOIN可以比使用NOT EXISTS和NOT IN更高效。 使用JOIN时，可以选择INNER JOIN、LEFT JOIN、 ......