甲基 基因 口腔 差异
玉米基因型不同导致其根系微生物群落不同
当进行宏基因组分析时，我们发现不同的玉米基因型可能会导致其根系微生物群落的不同。这种群落的变化可能与许多环境因素相关，例如土壤pH值、温度、湿度和养分含量等。 然而，最近的研究表明，玉米基因型也可能对其根系微生物群落的形成产生影响。例如，在一项研究中，研究人员对20个不同玉米基因型进行了分析，并通过 ......
不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析
标题：不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析 摘要： 本研究旨在探究吉林省农科院不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组特征。通过种植三块地，每块地一半种植B73玉米材料，另一半种植Mo17玉米材料，并设置三个生物学重复。分别在第四周、第六周、第八周和第十周采集土壤样本进行测序，以获取 ......
吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析
标题：吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析 摘要： 本研究旨在通过对吉林省农科院不同地点种植的B73和Mo17玉米材料进行宏基因组分析，探究它们在不同时间点和地点的土壤微生物群落组成和功能潜力差异。通过在三个地点种植三块地，每块地一半种植B73玉米材料，另一半种植Mo17玉米材料 ......
权衡Windows Server 2016 Hyper-V检查点之间的差异
导读 虚拟机即时配置快照已经帮Hyper-V管理员解决了很多令人头痛的问题，现在Hyper-V管理员在保存虚拟机状态时有了更多的选择。 Windows Server 2016 Hyper-V提供了两类检查点：标准及生产。如何决定使用哪一种? 虚拟机即时配置快照已经帮Hyper-V管理员解决了很多令人 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
PG系、Oracle、MySQL数据库在特定场景下结果差异分析
PG系、Oracle、MySQL数据库在特定场景下结果差异分析 作者：余从佳更新时间：2022-07-01 10:52人气值：416 本文主要介绍以PolarDB O引擎、ADB PG为代表的PG系数据库在某种特定事务场景下，其事务结果与Oracle、MySQL不同的现象，并分析该现象出现的原因。 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
速递：易基因科技应邀在广东药科大学生物信息系讲课分享表观遗传学研究技术
2023年5月8日上午，深圳市易基因科技有限公司高级技术总监王君文应邀至广东药科大学医药信息工程学院生物信息系开展关于“基因组学时代：表观遗传学研究及DNA甲基化技术介绍”的线下讲座。讲座由生物信息系副主任任重鲁主持，众多学生积极响应参与。 表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表 ......
易基因：2023年植物表观转录组研究的最新进展（m6A+m5C）｜深度综述
大家好这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 被称为表观转录组（epitranscriptome）的RNA修饰正成为基因调控的广泛调控机制。由于绘制转录组范围RNA修饰测序策略的改进，以及分别对沉积、去除和识别RNA修饰的writers、erasers和readers密集表征，表观转 ......
【javascript】typeof 和 instance of的差异
typeof与instanceof 都是判断数据类型的方法，区别如下：1.typeof会返回一个运算数的基本类型，instanceof 返回的是布尔值2.instanceof 可以准确判断引用数据类型，但是不能正确判断原始数据类型3.typeof虽然可以判断原始数据类型（null 除外），但是无法判 ......
02Prodigal基因预测
1、简介 Prodigal是为细菌和古菌基因组进行蛋白编码基因预测的软件 ,其缩写源于PROkaryotic DYnamic Programming Genefinding ALgorithm,表示原核生物基因预测的动态规划算法。 最早在2007年，在美国能源部联合基因组研究所(DOE)的支持下，由 ......
【2023-04-27】口腔溃疡
20:00 人生有许多事情，正如船后的波纹，总要过后才觉得美的。 ——余光中 最近口腔溃疡，伤口在舌头底部，十分难受，连吞个口水，都能痛得受不了。 口腔溃疡是最好的减肥方法，吃得慢，吃得少，还吃得清淡。昨天晚饭没吃，今天早餐也没吃，几天下来，我估计可以瘦个两三斤。但奇怪的是，我不觉得饿，而且身体那种 ......
利用snpEff对基因型VCF文件进行变异注释的详细方法
利用snpEff对VCF文件进行变异注释 群体遗传研究中，在获得SNP位点后,我们需要对SNP位点进行注释，对这些SNP位点进行更深的了解。 snpEff是一个用于对基因组单核苷酸多态性(SNP)进行注释的软件，snpEff软件可以用于对VCF文件进行变异注释，使用时需要先进行安装，然后构建参考基因 ......
FPGA与芯片设计差异
FPGA：系统规划->RTL设计->功能仿真->综合->逻辑块映射->布局布线->时序仿真->板级验证与仿真 综合(Synthesis)：用EDA工具将RTL设计的代码翻译成物理电路世界的具体电路（AND/OR/NAND gate/Dflipflop）,可用的EDA工具有Synopsys的Desig ......
递归比较两个字典差异-python dict different
def findDiff(d1, d2, path=""): for k in d1: if (k not in d2): print (path, ":") print (k + " as key not in d2", "\n") else: if type(d1[k]) is dict: if ......
易基因：禾本科植物群落的病毒组丰度/组成与人为管理/植物多样性变化的相关性 | 宏病毒组
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 现代农业通过简化生态系统、引入新宿主物种和减少作物遗传多样性来影响植物病毒的出现。因此，更好理解农业生态中种植和未种植群落中的病毒分布，以及它们之间的病毒交换至关重要。2023年03月14日，《Microbiol Spectr》杂志发表 ......
易基因：ChIP-seq等揭示热休克转录因子A1b调控植物高温胁迫响应的分子机制｜应激反应
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在拟南芥中，热休克转录因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通过影响种子产量来调控对环境胁迫的抗性。HSFA1b是生殖适应性的决定性因素，这种调控机制怎么形成的呢？ 2018年， ......
Rust、Go 和 Swift 在性能和并发性方面有何差异？
Rust是一种系统编程语言，旨在快速、安全和并发。其性能令人印象深刻，可以生成快速高效的机器代码。Rust 的编译器使用 LLVM 基础架构，它针对目标架构优化了代码。此外，Rust 的所有权和借用系统确保内存得到有效管理，没有任何运行时开销。Rust的并发模型是基于actor模型的，也就是说并发是 ......
SQLServer备份、完整备份，差异备份、日志备份
1、https://blog.51cto.com/u_15907770/5926159 https://product.pconline.com.cn/itbk/software/dnwt/1702/8821700.html 全备份（Full Backup）：就是对整个系统进行完全备份，包括系统和数 ......
参数与非参数检验：理解差异并正确使用
数据科学是一个快速发展的领域，它在很大程度上依赖于统计技术来分析和理解复杂的数据集。这个过程的一个关键部分是假设检验，它有助于确定从样本中获得的结果是否可以推广到总体。 在这篇文章中，我们将探讨参数与非参数检验之间的区别，提供示例以更好地理解它们的用例，并总结关键要点。 理解假设检验 假设检验是一种 ......
Lua5.1到Lua5.2的差异
Lua5.1到Lua5.2的差异 来源 https://zhuanlan.zhihu.com/p/96009862 版本差异 这一节列出Lua5.1到Lua5.2，以及Lua5.2到Lua5.3的版本差异。目前使用得最多的版本可能是Lua5.1这个版本，但是我很推荐将Lua升级到最新的5.3，因为5 ......
直播预告 | 字节跳动云原生大数据分析引擎 ByConity 与 ClickHouse 有何差异？
字节跳动在ClickHouse的基础之上设计并开源了分布式基础架构云数仓——ByConity，4月25日晚的这场直播将为大家介绍ByConity社区及其与ClickHouse的功能差异，欢迎大家报名观看！ ......
高通量测序的数据处理与分析(二)--宏基因组2
博客原文 宏基因组数据处理方法 数据下载 wget下载 宏基因组的数据主要分布在两个数据库：1. NCBI的SRA数据库，2. ENA。近年来也有许多研究者将数据上传到中国的数据库：NGDC 你可以直接通过网页下载数据，或者是通过各个网站提供的下载工具进行批量下载。也可以到 sra-exporter ......
Megahit基因组装
1、背景 每一个物种的参考基因组序列（reference genome）的产生都要先通过测序的方法，获得基因组的测序读段（reads），然后再进行从头拼接或组装（英文名称为do novo genome assembly），最后还原测序物种的各条染色体的序列，即ATGC四种碱基的排列顺序。 之所以要进 ......
unix domain 与本地本地回环在进程间通信中的差异
前言： 127.0.0.1它是一个私有IP，代表的就是你的本机环回地址，其实本质上是绑定在虚拟网卡loopback上的IP。 在实际应用中，有遇到在使用本地回环做进程间通讯的时候程序阻塞的情况。比如下面代码 (一)本地回环： 客户端数据收发程序： static int send_recv(char ......
易基因：MeRIP-seq等揭示m6A甲基化修饰对抗病毒基因表达的转录调控机制｜Cell Rep
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2021年03月02日，杜克大学医学中心的分子遗传学和微生物学系Stacy M. Horner教授团队在《Cell Reports》（IF: 9.995）杂志发表了题为“Post-transcriptional regulation o ......
基因组坐标到转录本坐标转换——单碱基模式
今天分享一个自己写的python小脚本可以实现单碱基的基因组位置转换到转录本的坐标，欢迎大家使用，并提出错误 #!/share/home/hujun/miniconda3/bin/python3 import pybedtools from pybedtools import BedTool imp ......
19 18 | 为什么这些SQL语句逻辑相同，性能却差异巨大？
在MySQL中，有很多看上去逻辑相同，但性能却差异巨大的SQL语句。对这些语句使用不当的话，就会不经意间导致整个数据库的压力变大。 我今天挑选了三个这样的案例和你分享。希望再遇到相似的问题时，你可以做到举一反三、快速解决问题。 案例一：条件字段函数操作 假设你现在维护了一个交易系统，其中交易记录表t ......
从国家基因组科学数据中心下载数据
001、官方网站：https://ngdc.cncb.ac.cn/ 002、入口： 003、输入数据编号： 004、 005、 06、 linux下载说明 ......
宏基因组学是如何出现的？它的出现对微生物学领域有多大的改变？
宏基因组学是在生物技术和计算机科学的帮助下发展起来的，它的出现可以追溯到上世纪90年代后期。传统微生物学侧重于使用培养方法研究单个微生物菌落，而宏基因组学则通过分析环境中的dna，可以同时研究数百万个微生物群体。这种方法能够提供关于整个微生物群落的结构、功用潜力和相互作用等信息。 宏基因组学对于微生 ......