病毒 穿山甲 病原体 基因组
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要：随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要：随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
易基因：全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点｜mBio
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 细菌编码许多转录因子（transcription factor，TF），这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶（RNAP）全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对TF功能的研究几乎集中 ......
速递：惠州学院生科院副院长谢海伟一行莅临易基因科技参观交流
2023年05月26日上午，惠州学院生命科学学院副院长谢海伟教授、陈兆贵教授、陈勇智博士、龚浩博士及生科院本科毕业生陈佳良一行5人莅临深圳市易基因科技有限公司参观交流，并举行“惠州学院实践教学基地“挂牌仪式。易基因总经理王君文、副总经理丁振东等公司领导出席。 交流会现场 “惠州学院实践教学基地“挂牌 ......
失而复得：拯救被.malox勒索病毒扼杀的企业数据
第一部分：关于.malox勒索病毒的介绍 malox勒索病毒是一种属于Mallox病毒家族的新型勒索病毒。Mallox病毒家族在2021年10月开始在亚洲的企业中发起攻击。这种勒索软件会将加密文件的后缀改为".mallox"。根据Sangfor FarSight Labs Endpoint Secu ......
感染蠕虫病毒Synaptics的查杀历程
## 一、问题发现 最近每次电脑开机联想电脑管家都给我报“发现可疑陈鼓型，存在安全风险”，一开始也没太在意，直接点立即隔离，但是每天都报这就有点不正常了~~  [root@PC1 test]# ls ## 测试数据， plink格式 outcome.map outcome.ped (base) [root@PC1 test]# cat outcome.map 1 snp1 0 55910 1 snp2 0 85204 1 s ......
2023-05-27 量学基础 十八个涨停基因（转）
涨停基因（十四）——大阳双休（双阴洗盘） 涨停基因（十五）——双剑霸天地 涨停基因（十六）——梯四变异 涨停基因（十七）——现场直憋 涨停基因（十八）——咬住峰顶线 涨停基因（十五）——双剑霸天地 一、双剑霸天地的形态。 双剑霸天地的形态是指：首先出现一根带有长上影线的价柱，长上影线的长度大于价柱总 ......
易基因：MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在结直肠癌PD-1免疫治疗中的作用｜Gut
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 结直肠癌（colorectal cancer ，CRC）是全球最常见的癌症之一，转移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫检查点阻断（Immune checkpoint blockade，ICB）对CRC患者表现出良好疗效，然而只有一 ......
易基因：全基因组DNA甲基化分析揭示DNMT1在斑马鱼模型听觉系统发育中的作用 | 胚胎发育
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 听力障碍通常与内耳发育不全或损伤有关，是影响生活质量的严重健康问题。因此研究听觉器官发生过程中的关键基因对于探索听力损伤的潜在策略至关重要。斑马鱼模型在理解内耳发育不良和相关疾病的分子遗传学原理方面得到了越来越多的应用，内耳发育包括遗传 ......
Linux 中 shell 脚本实现根据gff统计每一个基因的转录本数目
001、生成基因名称的列表 awk -F "\t" '$3 == "gene" && $NF ~ /gene=/ {print $NF}' chr1.gff | sed 's/\(.*\)\(gene=[^;]\+\)\(.*\)/\2/' | sort | uniq > gene.list 002 ......
玉米基因型不同导致其根系微生物群落不同
当进行宏基因组分析时，我们发现不同的玉米基因型可能会导致其根系微生物群落的不同。这种群落的变化可能与许多环境因素相关，例如土壤pH值、温度、湿度和养分含量等。 然而，最近的研究表明，玉米基因型也可能对其根系微生物群落的形成产生影响。例如，在一项研究中，研究人员对20个不同玉米基因型进行了分析，并通过 ......
不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析
标题：不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组分析 摘要： 本研究旨在探究吉林省农科院不同地点对B73和Mo17玉米材料的宏基因组特征。通过种植三块地，每块地一半种植B73玉米材料，另一半种植Mo17玉米材料，并设置三个生物学重复。分别在第四周、第六周、第八周和第十周采集土壤样本进行测序，以获取 ......
吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析
标题：吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析 摘要： 本研究旨在通过对吉林省农科院不同地点种植的B73和Mo17玉米材料进行宏基因组分析，探究它们在不同时间点和地点的土壤微生物群落组成和功能潜力差异。通过在三个地点种植三块地，每块地一半种植B73玉米材料，另一半种植Mo17玉米材料 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
.locked1勒索病毒数据恢复指南：打败威胁，保护您的业务
引言： 在当今数字化时代，勒索病毒已成为网络安全威胁的一个主要问题。每个月都有新的勒索病毒变种出现，其中之一就是 ".locked1" 勒索病毒。本文将详细介绍 ".locked1" 勒索病毒是什么，以及如何恢复被该病毒加密的数据文件。 如果受感染的数据确实有恢复的价值与必要性，您可添加我们的技 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
速递：易基因科技应邀在广东药科大学生物信息系讲课分享表观遗传学研究技术
2023年5月8日上午，深圳市易基因科技有限公司高级技术总监王君文应邀至广东药科大学医药信息工程学院生物信息系开展关于“基因组学时代：表观遗传学研究及DNA甲基化技术介绍”的线下讲座。讲座由生物信息系副主任任重鲁主持，众多学生积极响应参与。 表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表 ......
保护企业数据免受勒索病毒威胁：深入分析.eking勒索病毒
引言： 在当今数字化时代，勒索病毒已经成为网络安全领域的一大威胁。.eking勒索病毒是近期备受关注的一种恶意软件，它会加密用户的重要数据文件，并要求支付赎金以解密这些文件。91数据恢复研究院在本文将探讨.[back23@vpn.tg].eking勒索病毒、.[newfact@rape.lol] ......
易基因：2023年植物表观转录组研究的最新进展（m6A+m5C）｜深度综述
大家好这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 被称为表观转录组（epitranscriptome）的RNA修饰正成为基因调控的广泛调控机制。由于绘制转录组范围RNA修饰测序策略的改进，以及分别对沉积、去除和识别RNA修饰的writers、erasers和readers密集表征，表观转 ......
已公开的勒索病毒解密工具
https://www.nomoreransom.org/en/decryption-tools.html 由荷兰国家警察，欧洲刑警组织网络犯罪中心，卡巴斯基实验室，英特尔安全合作推出的「拒绝勒索软件」计划，旨在帮助勒索软件受害者重新取回其加密数据，无需支付赎金。网站包括了识别勒索软件类型，科普，防 ......
02Prodigal基因预测
1、简介 Prodigal是为细菌和古菌基因组进行蛋白编码基因预测的软件 ,其缩写源于PROkaryotic DYnamic Programming Genefinding ALgorithm,表示原核生物基因预测的动态规划算法。 最早在2007年，在美国能源部联合基因组研究所(DOE)的支持下，由 ......
clamav工具(反病毒工具)
命令使用 # 安装 pacman -S clamav # 启动后台监控服务 systemctl enable clamav-daemon.service # 更新病毒库 freshclam 服务介绍 clamav有四个服务都是与ClamAV（一种开源的反病毒软件）相关的服务。 clamav-clam ......
利用snpEff对基因型VCF文件进行变异注释的详细方法
利用snpEff对VCF文件进行变异注释 群体遗传研究中，在获得SNP位点后,我们需要对SNP位点进行注释，对这些SNP位点进行更深的了解。 snpEff是一个用于对基因组单核苷酸多态性(SNP)进行注释的软件，snpEff软件可以用于对VCF文件进行变异注释，使用时需要先进行安装，然后构建参考基因 ......
8分+文章：以病毒为研究对象，从免疫浸润等角度进行生信分析的干湿结合研究
病毒作为TME中的重要组分，在很多高分文章中已有论述： Epstein-Barr virus (EBV)感染了大约90%的成年人口，尽管该病毒不会在大多数宿主中引发明显症状，但是EBV却具有很强的致癌能力，并被认为是多种恶性肿瘤的致病源，例如B细胞或NK-T细胞淋巴瘤，上皮癌，比如鼻咽癌(NPC)和 ......
手工清理挖矿病毒案例
第三代亡命徒(Outlaw)木马样本分析 挖矿木马的危害 通常情况下，受害者会认为挖矿木马只是会让操作系统反应迟钝，并不会对自身造成太大的影响，但是挖矿木马除了会让系统卡顿之外，还会降低计算机设备性能和使用寿命，危害企业运营，浪费能源消耗，不仅如此，最重要的是现在的挖矿木马普遍会留置后门，变成攻击者 ......
易基因：禾本科植物群落的病毒组丰度/组成与人为管理/植物多样性变化的相关性 | 宏病毒组
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 现代农业通过简化生态系统、引入新宿主物种和减少作物遗传多样性来影响植物病毒的出现。因此，更好理解农业生态中种植和未种植群落中的病毒分布，以及它们之间的病毒交换至关重要。2023年03月14日，《Microbiol Spectr》杂志发表 ......